Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FGD4_0004700
Sequence Length
1346 nt
GC Content
0.4198
CUCAUUAUCAAAUUAUAGUGAUUUGAAGAAAGAGUCUGCUGUGAACCUAAAUGCUCCUAGAACCCCAGGAAGGCAUGGAUUGACAACCACACCUCAACAAAAACUCCUCUCCCAGCACUUGCCACAGAGGCAGGGAAAUGAUACAGAUAAGACUCAGGGUGCACAGACUUGUGUGGCCAACGGUGUAAUGGCAGCACAAAACCAGAUGGAAUGUGAGGAGGAGAAAGCUGCCACUCUUAGCUCAGAUACUUCUAUUCAAGCUUCUGAACCCUUGCUUGAUACGCACAUAGUGAAUGGAGAAAGAGAUGAAACUGCCACAGCUCCUGCAUCACCCACAACAGACAGCUGUGAUGGAAAUGCUUCUGACAGUAGCUACAGGACUCCAGGCAUAGGCCCAGUGCUCCCCCUAGAAGAAAGAGGGGCAGAAACAGAAACCAAGGUACAAGAGAGGGAAAAUGGGGAAAGCCCUCUGGAACUGGAGCAGCUGGACCAGCACCAUGAGAUGAAGGAGACUAAUGAGCAAAAACUUCACAAAAUAGCCAAUGAACUUUUGCUUACUGAAAGAGCUUAUGUCAACCGACUUGACCUCUUAGAUCAGAAAAUAGAGUGGAGGUGAAUUUAGAAAAUUAACAACCAUCUGGACAUUAUGAAGGAAUAGACCUCCUUCUGCCUACAUGUAACAGAAUGGCAAUUAAGAGGUAUUUUAUUGCAAACUGUUGGAAGAAGCAAACCGAGGCUCGUUUCCAGCAGAGAUGGUGAAUAAAAUCUUUUCUAAUAUUUCAUCAAUAAAUGCCUUCCAUAGUAAAUUCCUCUUGCCAGAGCUGGAGAAACGAAUGCAAGAAUGGGAAACUACUCCUAGAAUUGGAGACAUCCUUCAGAAAUUGGCACCAUUCCUUAAGAUGUAUGGAGAAUAUGUGAAAGGAUUUGAUAAUGCAAUGGAAUUGGUUAAAAACAUGACAGAACGUAUUCCCCAGUUCAAAUCAGUGGUUGAAGAAAUUCAGAAACAGAAAAUCUGUGGGAGCUUAACUUUGCAGCAUCACAUGCUAGAACCUGUUCAGCGGAUUCCCCGGUAUGAGAUGCUCCUUAAGGACUAUCUAAGGAAAUUGCCUCCUGAUUCCCUGGACUGGAAUGAUGCUAAAAAAUCACUUGAAAUUAUAUCUACAGCAGCAAGCCAUUCUAAUAGUGCAAUAAGGAAAAUGGAGAACCUAAAGAAACUCUUAGAGAUUUAUGAAAUGUUGGGAGAAGAAGAAGACAUUGUAAACCCUUCAAAUGAACUAAUAAAAGAAGGACAGAUCCUCAAACUAGCUGCUCGGAACACUUCAGCACAAGAACGCUACCUUUUCUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-338.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -357.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 308.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((((((((((((((.......))))).)))))))..(((........))).......(((((((((..(((((......((((((.((.....(((((.((((.((.(((......))))).))))................((((.(((((......((((((.((((.........)))).))))))..((....)).((((..((((.....((((((.......((((((((..(((......)))..)))))...(((.(((.((.(((.....))).)).))).))).((((.....((....)).....))))..(((..((((....))))..)))....))).......))))))......))))..)))).((.((((((((((((((.........))))............((....)).....((((((.............))))))......)))))).)))).)).))))).))))....))))).....(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))........)).))))))...(((((((((((...(((((((((.((....((((((.......))))))))))....(((((.((((((.(........).)))))).)))))..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...)))....)))))))).......)))))..)))))))))...............(((((...((((((.......(.(((...(((((......)))))...))).)......))))))....)))))....(((((...((((((.....))))))..)))))))))))))))....((((..(((.............(((.((.((((((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...))))))))..((((........)))).................((((((.((...((((((((.....(((((......((((............))))......)))))....))))))))......((.((..((((....(((((................))))))))).)).))...)).)))))).)))).)))))(((........))))))..))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((,{(((((((((((.......))))).))))))}..{{{........|}}.......(((((((((..(((({......((((((.{{.....{(({(,((((.{{.(((,,,...}}))),)))}...,............((((.(((((......((((((.((({.....,,..}))).)))))}..((....|}.((((..((((..,..{(((({..,||..{{{(((((..(((,,..,.}}}..}}}}}...((,.(((.((.(((.....))).)).))).,)).{{{{.....({...,||,.,,.|||}..(((..((((....))))..)))....}}|...,...)))))}......))))..)))}.((.((((((((((((((.........))))}......,.....{....}}.....{(((((.............))))))},..}})))))},)))).)).))))).))))..}.})))).....(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))........)).))))))...{((((((({{{...((((((({{.((....((((((.......))))))||||....({,,,.{,,||||(|...,,||}.}})))},)))),..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...}))....}))))))}.,,,,..}))))..)))))))))...,...........(((((,..((((((.......(.(((...(((((......)))))...))).)......))))))...,)))))....(((((...{(((((.....))))})..}))))})))))))))....((((..(((........,,...{{{.((.{(({((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....)))..))))))...))))))))..((((........)))}.................{(((((.{{,,,{((({{,{,,.,..||{||,...,||,,...|,...,...})})}}},..}}}}},.,,}}))}}}},..,,.,..,...,,.,....|}||}...,............|,|(({....))))}...}}.)))))).)))).))))){{{........))})))..))))..
Back