Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FGD4_0004800
Sequence Length
1519 nt
GC Content
0.4213
CUCAUUAUCAAAUUAUAGUGAUUUGAAGAAAGAGUCUGCUGUGAACCUAAAUGCUCCUAGAACCCCAGGAAGGCAUGGAUUGACAACCACACCUCAACAAAAACUCCUCUCCCAGCACUUGCCACAGAGGCAGGGAAAUGAUACAGAUAAGACUCAGGGUGCACAGACUUGUGUGGCCAACGGUGUAAUGGCAGCACAAAACCAGAUGGAAUGUGAGGAGGAGAAAGCUGCCACUCUUAGCUCAGAUACUUCUAUUCAAGCUUCUGAACCCUUGCUUGAUACGCACAUAGUGAAUGGAGAAAGAGAUGAAACUGCCACAGCUCCUGCAUCACCCACAACAGACAGCUGUGAUGGAAAUGCUUCUGACAGUAGCUACAGGACUCCAGGCAUAGGCCCAGUGCUCCCCCUAGAAGAAAGAGGGGCAGAAACAGAAACCAAGGUACAAGAGAGGGAAAAUGGGGAAAGCCCUCUGGAACUGGAGCAGCUGGACCAGCACCAUGAGAUGAAGGAGACUAAUGAGCAAAAACUUCACAAAAUAGCCAAUGAACUUUUGCUUACUGAAAGAGCUUAUGUCAACCGACUUGACCUCUUAGAUCAGAAAAUAGAGUGGAGGUGAAUUUAGAAAAUUAACAACCAUCUGGACAUUAUGAAGGAAUAGACCUCCUUCUGCCUACAUGUAACAGAAUGGCAAUUAAGAGGUAUUUUAUUGCAAACUGUUGGAAGAAGCAAACCGAGGCUCGUUUCCAGCAGAGAUGGUGAAUAAAAUCUUUUCUAAUAUUUCAUCAAUAAAUGCCUUCCAUAGUAAAUUCCUCUUGCCAGAGCUGGAGAAACGAAUGCAAGAAUGGGAAACUACUCCUAGAAUUGGAGACAUCCUUCAGAAAUUGGCACCAUUCCUUAAGAUGUAUGGAGAAUAUGUGAAAGGAUUUGAUAAUGCAAUGGAAUUGGUUAAAAACAUGACAGAACGUAUUCCCCAGUUCAAAUCAGUGGUUGAAGAAAUUCAGAAACAGAAAAUCUGUGGGAGCUUAACUUUGCAGCAUCACAUGCUAGAACCUGUUCAGCGGAUUCCCCGGUAUGAGAUGCUCCUUAAGGACUAUCUAAGGAAAUUGCCUCCUGAUUCCCUGGACUGGAAUGAUGCUAAAAAAUCACUUGAAAUUAUAUCUACAGCAGCAAGCCAUUCUAAUAGUGCAAUAAGGAAAAUGGAGAACCUAAAGAAACUCUUAGAGAUUUAUGAAAUGUUGGGAGAAGAAGAAGACAUUGUAAACCCUUCAAAUGAACUAAUAAAAGAAGGACAGAUCCUCAAACUAGCUGCUCGGAACACUUCAGCACAAGAACGCUACCUUUUCUUAUUCAACAACAUGUUGCUGUACUGUGUGCCCAAAUUCAGCUUGGUAGGCUCUAAAUUCACAGUUCGAACCAGGGUUGGCAUUGAUGGAAUGAAAAUUGUAGAGACUCAAAAUGAAGAAUAUCCACAUACUUUCCAGGUGUCUGGGAAAGAGAGAACACUGGAACUGCAGGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-382.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -407.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 420.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((.((((((((...))))))))..)).)))(((((.((...((......(((((.........(((((((((..(((((......((((((.((.....(((((.((((.((.(((......))))).))))................((((.(((((......((((((.((((.........)))).))))))..((....)).((((..((((.....((((((.......((((((((..(((......)))..)))))...(((.(((.((.(((.....))).)).))).))).((((.....((....)).....))))..(((..((((....))))..)))....))).......))))))......))))..)))).((.((((((((((((((.........))))............((....)).....((((((.............))))))......)))))).)))).)).))))).))))....))))).....(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))........)).))))))...(((((((((((...(((((((((.((....((((((.......))))))))))....(((((.((((((.(........).)))))).)))))..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...)))....)))))))).......)))))..))))))))).......(((((((.((((((..((((.....(((((....((((.(((..(((((.((.((((((((....)))..........(((((((.(((((...((((((.....))))))..))))).(((......))).(((((..(((.............)))..)))))((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...))))))))..((((........))))..............(((((((((.......(((((.(((......(((...........)))......))).)))))..........((((((...(((.(((((((..........(((((................)))))..............((((((((.(((....))))))).......))))..))))))).)))..))))))))))))))).)).)))))..)))))))...)))))..)))..))))...)))))..))))..))))))..)).)))))......(((.((...((........))...)).)))...(((((((....))))))))).)))......)).)).))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((.((((((({...))))))))..},.))|((((({((...{(......{((((.,......,||{((({{(,,{{(({......{{{{{{.,{.....(((((,((((,{(.((({{{...,,)))}))}}..,,............{{{{,(((((......((((((.((((.........)))).))))))..((,,,,||.((((,,({((,,,..{(({{{..,||,.,{|{((((..(((,,,.,,}}}..}}}|}...((,.(((.((.(((.....))).)).))).,)).{,,{.....{,..,,||{,{,.||||..(((..((((....))))..)))...,|||...,.,,|}}}|}.,,,..}}}}.,|}}}.{(.((((((((((((((.........})))).,,...,.....{....}}.....{(((((.............))))))},..))))))),,)))).)).))))).})}),,}.})))).....(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))......,,)),)))))}...{(((({{{{{,...(((((((||.{{....((((((.......))))))}|||..,,({,,,.,{{{{||(,...,,{{}.}}}))}|}))),..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...}}}....})))))}}...,,,.)))}}..)))))))}}.,.,,..{{{{{{{.((((({..((((,,...{{{{(.,,,,,,({(((..,,,,|}||,,,,|||{|..,.,.)}}}}}...||||||,{{{(((,,...{{{{|{||.{{||||||..,}|}|{{{{,,..,.|,,,{||||,.{{{,......,,.,...})},))))}((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....)))..))))))...)))))))).,{({{,.......})),..............(((((((((,..,,,{((({{.({{......{{{....,,,....}}|......}}),))))),.........,(((((,{{{(({(((({(...,,,,....{{{((...,............}}}|||....,,,},....{{((((((.(({....))))))).......)))}.,))))))).))),.))})})))))))))),}))))}})),,,}}|||,,,|||}},.}||..}}}}..,)}})}.,))))..))))}},,}}.}})}}......{{{.{{...((........}}...)).)))...|||||||}},,)))))),}).)))....,,)).,,.))))}},,)
Back