Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FGD4_0005100
Sequence Length
1769 nt
GC Content
0.4211
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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-449.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -479.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 438.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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