Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FGD4_0005200
Sequence Length
1910 nt
GC Content
0.4157
CUCAUUAUCAAAUUAUAGUGAUUUGAAGAAAGAGUCUGCUGUGAACCUAAAUGCUCCUAGAACCCCAGGAAGGCAUGGAUUGACAACCACACCUCAACAAAAACUCCUCUCCCAGCACUUGCCACAGAGGCAGGGAAAUGAUACAGAUAAGACUCAGGGUGCACAGACUUGUGUGGCCAACGGUGUAAUGGCAGCACAAAACCAGAUGGAAUGUGAGGAGGAGAAAGCUGCCACUCUUAGCUCAGAUACUUCUAUUCAAGCUUCUGAACCCUUGCUUGAUACGCACAUAGUGAAUGGAGAAAGAGAUGAAACUGCCACAGCUCCUGCAUCACCCACAACAGACAGCUGUGAUGGAAAUGCUUCUGACAGUAGCUACAGGACUCCAGGCAUAGGCCCAGUGCUCCCCCUAGAAGAAAGAGGGGCAGAAACAGAAACCAAGGUACAAGAGAGGGAAAAUGGGGAAAGCCCUCUGGAACUGGAGCAGCUGGACCAGCACCAUGAGAUGAAGGAGACUAAUGAGCAAAAACUUCACAAAAUAGCCAAUGAACUUUUGCUUACUGAAAGAGCUUAUGUCAACCGACUUGACCUCUUAGAUCAGAAAAUAGAGUGGAGGUGAAUUUAGAAAAUUAACAACCAUCUGGACAUUAUGAAGGAAUAGACCUCCUUCUGCCUACAUGUAACAGAAUGGCAAUUAAGAGGUAUUUUAUUGCAAACUGUUGGAAGAAGCAAACCGAGGCUCGUUUCCAGCAGAGAUGGUGAAUAAAAUCUUUUCUAAUAUUUCAUCAAUAAAUGCCUUCCAUAGUAAAUUCCUCUUGCCAGAGCUGGAGAAACGAAUGCAAGAAUGGGAAACUACUCCUAGAAUUGGAGACAUCCUUCAGAAAUUGGCACCAUUCCUUAAGAUGUAUGGAGAAUAUGUGAAAGGAUUUGAUAAUGCAAUGGAAUUGGUUAAAAACAUGACAGAACGUAUUCCCCAGUUCAAAUCAGUGGUUGAAGAAAUUCAGAAACAGAAAAUCUGUGGGAGCUUAACUUUGCAGCAUCACAUGCUAGAACCUGUUCAGCGGAUUCCCCGGUAUGAGAUGCUCCUUAAGGACUAUCUAAGGAAAUUGCCUCCUGAUUCCCUGGACUGGAAUGAUGCUAAAAAAUCACUUGAAAUUAUAUCUACAGCAGCAAGCCAUUCUAAUAGUGCAAUAAGGAAAAUGGAGAACCUAAAGAAACUCUUAGAGAUUUAUGAAAUGUUGGGAGAAGAAGAAGACAUUGUAAACCCUUCAAAUGAACUAAUAAAAGAAGGACAGAUCCUCAAACUAGCUGCUCGGAACACUUCAGCACAAGAACGCUACCUUUUCUUAUUCAACAACAUGUUGCUGUACUGUGUGCCCAAAUUCAGCUUGGUAGGCUCUAAAUUCACAGUUCGAACCAGGGUUGGCAUUGAUGGAAUGAAAAUUGUAGAGACUCAAAAUGAAGAAUAUCCACAUACUUUCCAGGUGUCUGGGAAAGAGAGAACACUGGAACUGCAGGCCAGUUCUGCGCAAGACAAAGAAGAAUGGAUCAAGGCCCUUCAAGAAACCAUCGAUGCUUUUCAUCAAAGGCAUGAAACCUUCAGAAAUGCAAUUGCAAAGGAUAAUGACAUUCACUCAGAGGUUUCUACUGCUGAGCUAGGGAAAAGAGCCCCAAGAUGGAUCCGAGAUAAUGAAGUGACAAUGUGUAUGAAAUGUAAAGAACCUUUCAAUGCACUGACACGAAGGAGGCAUCAUUGUCGAGCAUGUGGAUAUGUGGUUUGUUGGAAAUGCUCCGACUACAAAGCUCAACUUGAAUAUGAUGGUGGUAAAUUGAGCAAAGUUUGUAAAGACUGUUAUCAAAUCAUAAGUGGAUUCACAGACAGUGAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAAUUUUAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-478.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -512.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 499.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...........((((((((((((.......))))).)))))))........)(((.(((((..((.(((((((((..(((((......((((((.((.....(((((.((((.((.(((......))))).))))................((((.(((((......((((((.((((.........)))).))))))..((....)).((((..((((.....((((((.......((((((((..(((......)))..)))))...(((.(((.((.(((.....))).)).))).))).((((.....((....)).....))))..(((..((((....))))..)))....))).......))))))......))))..)))).((.((((((((((((((.........))))............((....)).....((((((.............))))))......)))))).)))).)).))))).))))....))))).....(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))........)).))))))...(((((((((((...(((((((((.((....((((((.......))))))))))....(((((.((((((.(........).)))))).)))))..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...)))....)))))))).......)))))..)))))))))...............(((((...((((((.......(.(((...(((((......)))))...))).)......))))))....)))))(((((.(((...((((((.....))))))..)))(((((((((((.....(((((..(((.............)))..)))))((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...))))))))(((((((((......((((((...(((((.(((((((((((.......(((((.(((......(((...........)))......))).)))))..........((((((...(((.(((((((..........(((((................)))))..............((((((((.(((....))))))).......))))..))))))).)))..)))))))))))))))............(((((.(((((..((((((...(((..(((((......(((..(((((((((((.........(((.((...((........))...)).)))....((((((((.(((.......)))..)).)))))).((((((.....))))))............(((.((........)))))......))))))))))).)))......((((.((((((((.((.((((..(((((....).))))..))))..))..))))))))...)))))))))..)))..))))))))))).)))))..)).))))).))))))....((((((((((.((.....)).)))).))))))............)))))))))(((((((((.(.((((.......)))).)..))))).))))......((((((.(((..(((....))).))).))))))..(((((....))))))))))))))))...))))).(((((.....)))))...............))..))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((.(({{{(((..,||||||}}..,,.)))((({{{({{{{,{...,{|(((((.{....,.,|||{{||||..{{{{{...,,,(({(((.((.....((((({((((.{{.(((,,,...}}))),))}}..,,............{{{{,(((((,,,,..((((((.((((.........)))).))))))..((,,,,||.((((,,({((,,,..,{{{{{..|||,.,{|{{(((..(((,,,,,,}|}..|||||...((,.(((.((.(((.....))).)).))).,)).|,,,...,,{,..,|||{,{{.||||..(((..((((....))))..)))...,|||...,.,,||}|||.,,,..}|||.,||}}.{|,|({(((((((((((.........})))).,,...,.....{....}}.....{(((((.............))))))},..)))}))),})))}.}),)))}).}}}),,}.})))).....(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...))))......,,)),)))))}...{({{{{{{{{,...{((({(|||.{,....((((((.......))))))||||..,,({,,,.,{{{{||{,...,,{{},}|}}}}|}}}},..((((((((((.(((........)))..))))))))))})}))))...,,}....}}))))}}...},,,)))}}..}}))}}}}}.,,,,..,,{{{,,,(((((,..((((((.......(.(((...(((((......)))))...))).)......))))))...,))))}{{{{{{{,,...|||||{}}.,,|||}||..,}}||{(({{{{{{.,...{|{||,.(({,......,,,,..,}),,))))}((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....)))..))))))...)))))))){{(((({{,.....,|||,{{.....,,,.,,(((((((((,..,,,{((({{.({{......{{{.....,,....}}}......}}).))))),.........,(((((,{{{((((((({(...,,,,....{{(((................)}}|||....,,,,,....{{((((((.(({....))))))).......)))}..))))))).))),,))})}))))))))))}}}}}}}}}}..(((((.(((((..((((((...(((.,(((((,.....,{{..(((((((((((.........{((.((...((........}}...)).})}....((((((,{.(((.......,,),,,},)))))}.{({{({.,.,,}))}},.........,.,(,,.({.......})})))......))))))))))).,,,......{(((.((((((((..(,{((({.{({{{....}.}}}),.))))..,},.))))))))...))))))))).,})),.))))))))))).)))))..,,..,,.,.,,|||,{,..((((((((((.((.....)).))))}}))))),}.}}}...}},)}}}}}}))||{|||{{|}|}|{{,,{{,,,,}|||{{{.,,,,)))))),,,,..((((((.{({..(((....))).}}}.))))))..(((((....))))),}},))))))},,..,,)).|||||,}.,})}},,...............,,..)))),,,)
Back