Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FGD4_0006700
Sequence Length
2804 nt
GC Content
0.3862
AAUUUUCUUUUCUCUUUAAGAGAAAUAGUCCUGGAGAAGUACAUGGAAGGGGCUGGGCGCAUUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGCGGGGCUGAGGCGGGCGGAUCACCUGAGGUUGGGAGUUCAAGACCAGCCUGACCAACAUGGAGAAACCUCGUCUCUGCUAAAAAUACAAAAUUAGCCGGCCGUCGUGGUGCAUGCCUGUAAUCUCAGCUACUCGGGAGACUGAGGCAGGAGAAUCACUUGAACCCGGGAGGCAGAGGUUGCGGUGAGCCGAGAUCAUGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGCAACAAGAGCAAAACUCUGUCUUAAAAAAAAAAAAAACAAAAAGAGAAGUACAUGGAAGGAUAUAACUUUGUUAUAUAUUUUUCUCAGAGCAGAAAUCUUCGCAUAUACAUUAGAAAGAUUUCCACAAAACAACUGACAAAAUACAAAAAUAAAAACAUUCAGAGACAAUGGCUUAAUUAUUUGGAAAUACUGUUUCUUUUUAGUAUUUAUAAGGAUUAAUUCAUUCUUGACAAUGCUUUAUAAAUGUGGAACAAAGGAAAGUUUUAGAAAGAUCCCUCAUACAGCAAUACAGAAGGUAAAUUCACGCCACAAAAUAUUGUAAUCAGAUCAUUUGAUAGCUAUUGAUUGGUCUGGGCUUGAGAAGAGAUGAGCGAAACAGGGUGGCAGUGUUGAGAGCUUAAAGGAUGAAUGCUAAAGACAUAGUAUCAUAAGUAGGACUUGGUAGCAGUCAGGAUGCCAUGGUAGAGAAAUAAGUUUAAUUCAAGAUUCCAAAGCCAGAUAAUUGUACCAUUACCAGGAGGAGAAAAUUAGGAGUUAAUAGUAGGGUAGAGGUUUCUCAGAAAAGAUGAAUUUGGUCUUGUGUUGUCAGCAUGUCAAAGUAGUAAUAAAUGUCCAGCAAUAGUUAGGUAUGUGAUUGCUACUCAUUCAUUCAUUUGUUCGGCAAUAUUGUAUUGAAUACCAGUGUUUUUAUUGAAGCAUUGUAGUAGGCACAGGAGAUACAGCAGCUAACAAGGAAAAAAUGUUUCUGUCAUCAUGAAACUGGCAGAGUUAUAUAAGUAUAUUUAAGGCUUAAAUAAAUACAUACUGAAGAAAUAAAGUGGAAUUAAUACAAAAUAAAAUGGGCAGACAGAGGUGAGGGGGAGCGUAAAUGAAACAAGAUUAACAAUGAGUUGAUACUUGUUGAAUCUCAUUGAUGGGCAUGUGGGGGUUCACUUUACUGUUUUCUGUAUUAUUUGAUUGAAGUUUUUCUUUCUGUUUUUUUGAGAUAGGGUCUUGCUCUGUCACCCAGGCUAGAGUGCAGUGGCACAGUCAUGGCUUACACAGCCUCAACCUCCUCCCAUCUCUGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGAUGUGCGUCACCACGCCUGUGCUCAAGUGAUCCUCCCUCCUCUACCUCCCAAUAUGUUGGAAUGACAGGCAUGAGCCACUGCGGCUGGCCUAAUAAAAUAUUUUUUAAAAAUAAAAAAUUAAUAAAUGUAUAGAACUGAUAAUUAGACAAGAUGUCUGAGUGAUAACAUUUCCAAAGAGUAGCCUGAGAAAGAUGGAAAAAUGAAGAAAGAUAAUGCUAGGAACUGAAAAAGAUAGAUUUCCAGGAAAAAGGUAGAUAUGAUAGUGGUAACUGCUGCAGAGGUCAAAGGAGAAACUAUAGUUUAAAUCCAGCUGCUUGCUAAUUUCUAAUUUUGUUCAUUUCUGGUUUGACAUCUCUUGAUGGCUGAAAGAACCGAGUAACUGAAAAGCUUGAGAAAACUGUUUUGAUCAAAUCAUUUGAAGAAGCGUUUUUUACUUUAGAAAUAUUGUCCAAGGUAUCUUUCCUAAUGUGUGAAUAUCUUUCCAAUUUUUAGGAGACUAAUGAGCAAAAACUUCACAAAAUAGCCAAUGAACUUUUGCUUACUGAAAGAGCUUAUGUCAACCGACUUGACCUCUUAGAUCAGGUAUUUUAUUGCAAACUGUUGGAAGAAGCAAACCGAGGCUCGUUUCCAGCAGAGAUGGUGAAUAAAAUCUUUUCUAAUAUUUCAUCAAUAAAUGCCUUCCAUAGUAAAUUCCUCUUGCCAGAGCUGGAGAAACGAAUGCAAGAAUGGGAAACUACUCCUAGAAUUGGAGACAUCCUUCAGAAAUUGGCACCAUUCCUUAAGAUGUAUGGAGAAUAUGUGAAAGGAUUUGAUAAUGCAAUGGAAUUGGUUAAAAACAUGACAGAACGUAUUCCCCAGUUCAAAUCAGUGGUUGAAGAAAUUCAGAAACAGAAAAUCUGUGGGAGCUUAACUUUGCAGCAUCACAUGCUAGAACCUGUUCAGCGGAUUCCCCGGUAUGAGAUGCUCCUUAAGGACUAUCUAAGGAAAUUGCCUCCUGAUUCCCUGGACUGGAAUGAUGCUAAAAAAUCACUUGAAAUUAUAUCUACAGCAGCAAGCCAUUCUAAUAGUGCAAUAAGGAAAAUGGAGAACCUAAAGAAACUCUUAGAGAUUUAUGAAAUGUUGGGAGAAGAAGAAGACAUUGUAAACCCUUCAAAUGAACUAAUAAAAGAAGGACAGAUCCUCAAACUAGCUGCUCGGAACACUUCAGCACAAGAACGCUACCUUUUCUUAUUCAACAACAUGUUGCUGUACUGUGUGCCCAAAUUCAGCUUGGUAGGCUCUAAAUUCACAGUUCGAACCAGGGUUGGCAUUGAUGGAAUGAAAAUUGUAGAGACUCAAAAUGAAGAAUAUCCACAUACUUUCCAGGUGUCUGGGAAAGAGAGAACACUGGAACUGCAGGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-775.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -830.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 754.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((.((((..(((.(......((((((((..(((((((((((((((((.((((.((((((((((((((.((.((((((..(((.((((..((((.(((.(((((((.(((((((((..........))))))).........(((((.......))))).................((((((.(((.((((((((((.(((((.(((((((((((.(((((.(.((((..(((................(((((..(((((((..((((((((.(((..(((((((((((((.((((((((..(((.((((((.(((((((((((((((((............(((((((((.((((((((......)))).)))).)))))))))(((((.(((((.(((((..................((((((...(((.((((((..((((....(((((..((((..((((..((((.((((((..(((.((((((((........)))))))).))).)))))).))))))))...)))).)))))...(.((((((........)))))).).(((..((((.(((.((((((.....(((........)))......)))))).((((((...)))))).((((((((((.((((((..(((.(((....((((..((((...((((((.(.((((..(((...(((((((.(((((......)))))))))........)))...)))..)))).))))))).............))))..))))...))))))..)))))).............((....))...........))))))))))...)))))))..))).....(((((.......)))))))))))))))..)))...(((((((((..(((((((((....))).)).)))).)))))))))((((..(((.((((((.(((....((((((((..((((((((((((....)))))))))..)))..))......))))))..))))))))))))..)))).((((((((.........))))))))((((.(((((.........))))).))))....................)))))).............(((((.(((((....(((((((..((((........((((((((((((.....)))))).))))))...((((((((.....)).)))))))))).)))))))....)))))..)))))...)))))..))))))))))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))).)))))))))))))..))).)))))))).)))))))..))))))))..)))).).))))).))))))))))).))))).)))))))))).))).))).))))).))))))).))).))))..)))).)))..)))))).)).)))))))))))))).)))).))))))(((((((((((((((((....))))))......((((((.((..(((......((((((...)))))))))..))))))))......(((..((((((((...((((((......((((((((..(((.(((..((((....((((.(((((..((....(((((.(((.......))).))))).......))...)))))..))))..))))..))))))..((((...((((((((....((((.((((.(((....((((....)))))))))))))))(((((.........)))))(((((((.(((((..(((((...))))).))))))))))))...))))))))......)))).))))))))...((((....)))).)))))).))))))))..)))..(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...)))))))))))))))....((((((((((.(((........)))..))))))))))...(((((((..................))))))).......)))))))).))).(((((((.((((((..((((.....(((((....((((.(((..(((((.((.((((((((....)))..........(((((((.(((((...((((((.....))))))..))))).(((......))).(((((..(((.............)))..)))))((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...))))))))..((((........))))..............(((((((((.......(((((.(((......(((...........)))......))).)))))..........((((((...(((.(((((((..........(((((................)))))..............((((((((.(((....))))))).......))))..))))))).)))..))))))))))))))).)).)))))..)))))))...)))))..)))..))))...)))))..))))..))))))..)).)))))......(((.((...((........))...)).)))...))))))))).))))))))))))))))..((((.........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((((({...{{(,{......((((((({{(((..((((..(((((((.((((.((((((((((((((.{{.((((((..(((.((((..((((.(((.(((((((.(((((((((..........)))))))..,......(((((.......))))){{{{{..........})}||,((,(((.((((((((((.(((((.(((((((((((.(((((.,.((((,,(({{...,....}.....{(((((..(((((((..((((((((.(((..(((((((((((((.((((((((..((,{((((((.(((((((((((({{,.....,{{(((.((((((((({,..{((((((((((({{...}}}})})}))))))},,,.|,.(((((((((............},}})))))|,,,...,,,.((((({..{(((({...{{{{..{{(({,{{({.,{(((,{({(({{(((({,,,,{((({{{{,,,,||,|{(({{(((((|||...{{|....))}.,}},))))))}}}}}|{{{{{...,,...}||}},...,,,,.|||{.,...((((((.....(((........)))......})))))..,(((((((.(((((....))))).)))))))|(((({.,,,....||||},||||,,.((((((.(.((((..(((...(({(((,,(((((......)))))))))........)))...)))..)))).}))))))......,,..,..}}}}..})),...}}},.}}})))}}},,}},.,||,||{{{....,,......,,.....,},,},}}..}})}},}}},)))}.,,...|||}..}})},,,))))))))))))..}}}...(((((((((..(((,(((((....))).)),)),,.))))))))){{((..(((.((((((.(((....((((((((..((((((((((((....)))))))))..)))..),.....,))))))..))))))))})))..}})).{(((((((.........)))))))},|||.{,{((,{,,,,,..}}})),))}},,,,.|{||..........})))},.,,,,{.{,,,,{.{,{({{({(((,{,.(((((((..{{{(....,,..((((((((((((.....)))))).))))))..,|{|{|||,.,,..},,))}}},}))),))))))),}),))))).}))))),})),,.,,)))))))).))))))))))))))))))).)))))))))..)))))))).)))))))))))))..))).)))))))).)))))))..))))))}}..)))),),))))).))))))))))).))))).}))))))))).)))}),}.,}))).))))))).))).))))..)))).)))..)))))).}}.)))))))))))))).)))).))))))).......,((((((((....}))))}}}.....,,|{{.,...{{,.....{((((({...}))))))||..,,}}||{((((..{{{(,((({,.,...,.{{({{,..({{(...(({...{((((((,.{((((...,{,,,.,,||,{{(({,,{(((((...,,.,,(({{,..}})))}},{,.{{{{{{||||{{{|,|,,{||,,,,|,.{{{.....)))..,}),,}})},}})},.})))},,|}}}}},||{{{{|.|,((((((.,..(((((((.((,...{(.(((((,,,.(((((((..,,,..{(((((((({,,||||||||{{{{{{.{{.,,,,,.||,|}}}||,,(({{{{((,,((,{((,.,,,|||||,,,,|}|||||,....(((((((((..((((............)))).)))))))))(((((((((.(((.(((....))).))).)))))...)))){{(,{{,{{|||...((((((((((.(((........)))..))))))))))...,{{|{||,,,..{{{{{{{{{{{{{|||||,|,|..,,||,{{{{{{.,,...,{{{{,,{(({{...{(({{{....,..{.{{{...{||||.....,))))),,,))),),.....}}}})),.,})})))|{||{{{{{|,,}||{{|}}|,|||}|{{..,||{{{{{{,...{{{,,,((({{,,(((.......,,,,..,}},.})))}((((((((((((((.(((((((....))))...(((({...}))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....}))..))))))...))))))))..{({(,,......}))}.,,.....,...|||.,,|||,}}.,,,}||||,,.|||,}}.},||}},..,}},,..,||,,,{,..})}))))}},}}.}))}}})))))}})}}}},..,,,,},}}}}....,)))))))))}..........},))))))).,.))))}.)))).))))))).....)))))).}}}}}...)))})))))))}...(((({...}))))..||{(,,,|}}}.....}})}}}}})))).,.)}}...)))),,}))),},}}})}}}}}}},}}..})))}},....,|,,.....,||,....,.......))))..))))))))))),.))))))))))))))))..((((.........))))
Back