Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FGD4_0006900
Sequence Length
684 nt
GC Content
0.3889
GGUCUUGCUCUGUCACCCAGGCUAGAGUGCAGUGGCACAGUCAUGGCUUACACAGCCUCAACCUCCUCCCAUCUCUGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGAUGUGCGUCACCACGCCUGUGCUCAAGUGAUCCUCCCUCCUCUACCUCCCAAUAUGUUGGAAUGACAGGCAUGAGCCACUGCGGCUGGCCUAAUAAAAUAUUUUUUAAAAAUAAAAAAUUAAUAAAUGUAUAGAACUGAUAAUUAGACAAGAUGUCUGAGUGAUAACAUUUCCAAAGAGUAGCCUGAGAAAGAUGGAAAAAUGAAGAAAGAUAAUGCUAGGAACUGAAAAAGAUAGAUUUCCAGGAAAAAGGUAGAUAUGAUAGUGGUAACUGCUGCAGAGGUCAAAGGAGAAACUAUAGUUUAAAUCCAGCUGCUUGCUAAUUUCUAAUUUUGUUCAUUUCUGGUUUGACAUCUCUUGAUGGCUGAAAGAACCGAGUAACUGAAAAGCUUGAGAAAACUGUUUUGAUCAAAUCAUUUGAAGAAGCGUUUUUUACUUUAGAAAUAUUGUCCAAGGUAUCUUUCCUAAUGUGUGAAUAUCUUUCCAAUUUUUAGGAGACUAAUGAGCAAAAACUUCACAAAAUAGCCAAUGAACUUUUGCUUACUGAAAGAGCUUAUGUCAACCGACUUGACCUCUUAGAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-151.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -163.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 189.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))(((((....(((((((..(((((((((.(((((((((((.....)))).........(((((.((((........)).)).))))).(((((.((((......)))).)))))...........................((((....)))).))))).....)).))))))))).)))))))........((((((((....))))))))....((((((.((..(((......((((((...)))))))))..))))))))......(((..((((((((...((((((......((((((((..(((.(((..((((....((((.(((((..((....(((((.(((.......))).))))).......))...)))))..))))..))))..))))))..((((...((((((((....((((.((((.(((....((((....)))))))))))))))(((((.........)))))(((((((.(((((..(((((...))))).))))))))))))...))))))))......)))).))))))))...((((....)))).)))))).))))))))..)))..(((((((((..((((............)))).)))))))))....(((((.(((.(((....))).))).))))).)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...)))(((((....(((((((..(((((((((.{{{({..((((.....)))).........,{{((,,((((..{{{{,.}.,,.))))).,,|||,,|||.,....|}}|{||||}.....{.||..................(({,....,)))...,))}))).)).))))))))).)))))))........((((((((....})))))))....,{{{{{.,,..,{,.....{((((({...}))))))|},,|||}||||,..,,,{{(,,(({({(({,{{((,,({......{{{{{{{,..((((((((.((((.{{{(((((,,{,,{{,{,..,({(,({(.{{{{.{({{{..||,||,,.....,,..}),)),.})))).}))},.,)),},)}..}},)}.,..)))},}})}.}))})))))})),,..||||,.,,}}})})}},,,,,..(((((.........)))))(((((((.(((((..(((({...})))).)))))))))))).||||.}}}}}.,,,)),,})})))))}||{|,{,,{,.,,|,,,.}))))).,,,))))),,)}}..(((((((((..((((............)))).))))))))).,..(((((.(((.(((....))).))).))))).)).)))
Back