Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FGD4_0008800
Sequence Length
1930 nt
GC Content
0.4311
AAAAUAGAGUGGAGGUGAAUUUAGAAAAUUAACAACCAUCUGGACAUUAUGAAGGAAUAGACCUCCUUCUGCCUACAUGUAACAGAAUGGCAAUUAAGAGGUAUUUUAUUGCAAACUGUUGGAAGAAGCAAACCGAGGCUCGUUUCCAGCAGAGAUGGUGAAUAAAAUCUUUUCUAAUAUUUCAUCAAUAAAUGCCUUCCAUAGUAAAUUCCUCUUGCCAGAGCUGGAGAAACGAAUGCAAGAAUGGGAAACUACUCCUAGAAUUGGAGACAUCCUUCAGAAAUUGGCACCAUUCCUUAAGAUGUAUGGAGAAUAUGUGAAAGGAUUUGAUAAUGCAAUGGAAUUGGUUAAAAACAUGACAGAACGUAUUCCCCAGUUCAAAUCAGUGGUUGAAGAAAUUCAGAAACAGAAAAUCUGUGGGAGCUUAACUUUGCAGCAUCACAUGCUAGAACCUGUUCAGCGGAUUCCCCGGUAUGAGAUGCUCCUUAAGGACUAUCUAAGGAAAUUGCCUCCUGAUUCCCUGGACUGGAAUGAUGCUAAAAAAUCACUUGAAAUUAUAUCUACAGCAGCAAGCCAUUCUAAUAGUGCAAUAAGGAAAAUGGAGAACCUAAAGAAACUCUUAGAGAUUUAUGAAAUGUUGGGAGAAGAAGAAGACAUUGUAAACCCUUCAAAUGAACUAAUAAAAGAAGGACAGAUCCUCAAACUAGCUGCUCGGAACACUUCAGCACAAGAACGCUACCUUUUCUUAUUCAACAACAUGUUGCUGUACUGUGUGCCCAAAUUCAGCUUGGUAGGCUCUAAAUUCACAGUUCGAACCAGGGUUGGCAUUGAUGGAAUGAAAAUUGUAGAGACUCAAAAUGAAGAAUAUCCACAUACUUUCCAGGUGUCUGGGAAAGAGAGAACACUGGAACUGCAGGCCAGUUCUGCGCAAGACAAAGAAGAAUGGAUCAAGAGACGAGGUUUUGCCAUGCUGCCCAGGCUGAUCUCGAACUCCUGAGCUCAAGCGAUCUGCCUGCCUCGGUCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCCCUUCAAGAAACCAUCGAUGCUUUUCAUCAAAGGCAUGAAACCUUCAGAAAUGCAAUUGCAAAGGAUAAUGACAUUCACUCAGAGGUUUCUACUGCUGAGCUAGGGAAAAGAGCCCCAAGAUGGAUCCGAGAUAAUGAAGUGACAAUGUGUAUGAAAUGUAAAGAACCUUUCAAUGCACUGACACGAAGGAGGCAUCAUUGUCGAGCAUGUGGAUAUGUGGUUUGUUGGAAAUGCUCCGACUACAAAGCUCAACUUGAAUAUGAUGGUGGUAAAUUGAGCAAAGUUUGUAAAGACUGUUAUCAAAUCAUAAGUGGAUUCACAGACAGUGAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAAUUUUAGAGUUCCGCAUGGCUGGGGAGGCCUCAGAAAACGUACAAUCAUGGCAGAAGGGGAAGAGGCACAUCUUACAUGGUGGCAAGCGAGAGUGAGCAAGUGUAUGAAGGAAGAACUGUCAGACACUUACAAAACCAUCAGAUCUCAUGAGAACUCACGAUCACGAGAACAGCAUGGGGGACACUGCCCCCAUGAUCCAGUUACCUCCUAUCAGAUUGAAUCAGCAGAAGUAUCUGGAAACAGUGUGGUGUGCAGCUUUCUUCAGUAUAUGGAGAAGUCAAAACCUUGGCAGAAAGCUUGGUGUGUGAUCCCCAAGCAAGACCCUCUUGUGCUGUACAUGUAUGGUGCCCCCCAGGACGUCAGAGCCCAGGCCACCAUUCCACUUCUGGGCUAUGUGGUGGAUGAAAUGCCAAGGAGCGCAGACCUGCCACACAGUUUCAAACUGACCCAGUCUAAGUCCGUGCACAGCUUUGCUGCAGACAGUGAGGAACUGAAGCAGAAGUGGCUGAAAGUCAUCCUUUUAGCUGUCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-525.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -559.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 369.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((.(((.((((((.(((((((((((...(((((((((.((....((((((.......))))))))))....(((((.((((((.(........).)))))).)))))..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...)))....))))))))...))))))...........(((((......((..(((((((((((((((.........((((....(((((......)))))....(((((.....)))))....((((((.((((((...........((.((((((((.....(((((.((......)).))))).((((......))))...)))))))).))((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...)))))))))))).)))))).....................(((((((((.......(((((.(((......(((...........)))......))).)))))..........((((((...(((.(((((((..........(((((................)))))..............((((((((.(((....))))))).......))))..))))))).)))..))))))))))))))).((((((......((((..((((....(((((..((((((((.(.(((....))).).)))).))))..........)))))..))))..)))).......))))))..((((((((.(((.......)))..)).)))))).))))..))))))))).))))))..)).....)))))(((.(((.(((((((..(((.((.....))))).)))))))..))).)))((((..(((((.(((((((((.(...(((((......)))))...)))))(((((......(((((.((((((((....))))))))....((((......(((....))))))).............(((((.(((....))).)))))...(((........)))..)))))...............(((.((..((((((((((.((.....)).)))).)))))))).)))))))))))))..))))).)))).(((((...(.((((((.((((.....((((.((((((.((((((....(((...(((((((((...((((....(((((....)))))....))))............(((((.....)))))...............((((((....))))))((.(((((((((.(((.........((((((...((((((.((((((.((..(((((((.(((.((((((...((........))((((((.(((((......)).))).))))))......))))))..((((.(((..........))).))))....((((((((......)))))))).(((((.(((.((((.(((...)))...))..)).))).)))))....))).)))))))..))(((((((.....)))))))(((((....))))).....((((((.(......).)))))).....)))))).))))))...))))))..))))))))....))))..))....)))))))))....))))))))).))))))))).).....)))).)))).)).)....)))))(((((...)))))..))).))))..)(.(((.((((((...((((...((((.....))))..))))..((((((...))))))......))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...((((.(((.((((((.(((((((((({...(((((((((.({....((((((.......))))))})))..,,({{{{.{{{|||,(,,..,,,,}.}})))),)))),..((((((((((.(((........)))..)))))))))))))))))...}))....))))))))...))))))...........(((((..,...((..(((((((((((((((.........({((....(((((......})))}...,{|{||...,})}}}|,...{(((((,(({(((,....,,,,,{{{.{{||||{|..,,|||{{({,,.,,.,,,.{{{||}.{{{,......,..,...))}}))))}|{((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....)))..))))))...)))))))),}||,|}}},,...,}},...,..........(((((((((,..,,,(((({{.({{......{{{.....,,....}}}......}}),))))),.........,(((((,{{{(({(((({(...,,,,....{{(((................}}}||,....,,,},....{{((((((.(({....))))))).......)))}.,))))))).))),,))})})))))))))).||{|||.,....{{{(.,((({,.{,{{(({.,{{{,,||{{|,,,|||,,,}},),}}}}.,,}}})}...,,|,}}}}}.,|}}}..}}}}.....,,})))},..((((((,{,(((.........),,,}.)))))}.})))..))))))))).))))))..}}..,..)))))(((.(((.(((((((..(((.{(.....}}))).)))))))..))).)))((((..(((((.((((({(((,(,,,(((((......)))))...}})))(((((......(((((.((((((((....}))))))),,,.{{{|,.....(((....))}.,||,,..,...,})}.(((((.(((....))).)))))...(((........)))..))))).|,............(((.{,..((((((((((.((.....)).))))}})))))}).)))))))))))))..))))).)))).(((((...(,((((((.((((.....{(((.{(((((.((((((....(((...(((((((((...((((....(((((....)))))....)))}.,,.....,,,.{((((.....))))}...............((((({....}))))){{,((,((((((.(((.,.......{(((((...((((((.((((((,((..(((((((.(((.((((((,..((....,,..))((((((.(((((......)).))).))))))......)))))},.((((.(((..........))).)))).,..((((((((......)))))))).(((((.(((.(({{.{{,...,},.,.}}..)).))).)))))....))).)))))))..))|((((((.....)))))),(((((....))))).....((((((.(......).)))))).....)))))).))))))...))))))}.)))))))))..,})},..)}.,..)))))))))....))))))))).))))))))).}.....)))).)))),)).,....)))))(((({...}))))..))).))))..)(.(((.((((((..,((((...((((.....))))..))))..{{((((...}))))}.,,,..))))))))).)
Back