Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FGD4_0009900
Sequence Length
1066 nt
GC Content
0.3968
GGAAACUACUCCUAGAAUUGGAGACAUCCUUCAGAAAUUGGCACCAUUCCUUAAGAUGUAUGGAGAAUAUGUGAAAGGAUUUGAUAAUGCAAUGGAAUUGGUUAAAAACAUGACAGAACGUAUUCCCCAGUUCAAAUCAGUGGUUGAAGAAAUUCAGAAACAGAAAAUCUGUGGGAGCUUAACUUUGCAGCAUCACAUGCUAGAACCUGUUCAGCGGAUUCCCCGGUAUGAGAUGCUCCUUAAGGACUAUCUAAGGAAAUUGCCUCCUGAUUCCCUGGACUGGAAUGAUGCUAAAAAAUCACUUGAAAUUAUAUCUACAGCAGCAAGCCAUUCUAAUAGUGCAAUAAGGAAAAUGGAGAACCUAAAGAAACUCUUAGAGAUUUAUGAAAUGUUGGGAGAAGAAGAAGACAUUGUAAACCCUUCAAAUGAACUAAUAAAAGAAGGACAGAUCCUCAAACUAGCUGCUCGGAACACUUCAGCACAAGAACGCUACCUUUUCUUAUUCAACAACAUGUUGCUGUACUGUGUGCCCAAAUUCAGCUUGGUAGGCUCUAAAUUCACAGUUCGAACCAGGGUUGGCAUUGAUGGAAUGAAAAUUGUAGAGACUCAAAAUGAAGAAUAUCCACAUACUUUCCAGGUGUCUGGGAAAGAGAGAACACUGGAACUGCAGGCCAGUUCUGCGCAAGACAAAGAAGAAUGGAUCAAGGCCCUUCAAGAAACCAUCGAUGCUUUUCAUCAAAGGCAUGAAACCUUCAGAAAUGCAAUUGCAAAGGAUAAUGACAUUCACUCAGAGGUUUCUACUGCUGAGCUAGGGAAAAGAGCCCCAAGAUGGAUCCGAGAUAAUGAAGUGACAAUGUGUAUGAAAUGUAAAGAACCUUUCAAUGCACUGACACGAAGGAGGCAUCAUUGUCGAGCAUGUGGAUAUGUGGUUUGUUGGAAAUGCUCCGACUACAAAGCUCAACUUGAAUAUGAUGGUGGUAAAUUGAGCAAAGUUUGUAAAGACUGUUAUCAAAUCAUAAGUGGAUUCACAGACAGUGAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAAUUUUAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-242.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -265.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 283.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....((((.......))))...)))((((((..........(((((((...((((((.....)))))).....(((((((((((.....(((((..(((.............)))..)))))((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)).(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))((((((.(......)))))))....)))..))))))...))))))))(((((((((......((((((...(((((.(((((((((((.......(((((.(((......(((...........)))......))).)))))..........((((((...(((.(((((((..........(((((................)))))..............((((((((.(((....))))))).......))))..))))))).)))..)))))))))))))))............(((((.(((((..((((((...(((..(((((......(((..(((((((((((.........(((.((...((........))...)).)))....((((((((.(((.......)))..)).)))))).((((((.....))))))............(((.((........)))))......))))))))))).)))......((((.((((((((.((.((((..(((((....).))))..))))..))..))))))))...)))))))))..)))..))))))))))).)))))..)).))))).))))))....((((((((((.((.....)).)))).))))))............)))))))))(((((((((.(.((((.......)))).)..))))).))))......((((((.(((..(((....))).))).))))))..(((((....)))))))))))))))).........(((((.....))))).............)))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.....((((.......))))...)))(((.{(((((,,{,,{{(((({,...,,{{{{||.,,||||||...,|{((((((({{{.,...({{{{,.(((,......,..,..,}),.)))))((((((((((((((.(((((((....))))...(((((...)))))....((........)),(((((.((((((.(((.((((...)))).)))...)))))).)))))|(((({,(,....,))))))}....)))..))))))...)))))))){|{({(|||......|{{,{{....,,,,.{{{,{((((((..,.,,{((({{.({{....,.{{|.....||....}}}......,)),))}}},.,,,.,....|{||||||{{{,,,{{,{...,|,,....{|{{|................}}||||....}}}},...,|,||||||.{{{....}})|||}.......))),{{|||||||.|||..},.,.}}|||||||,{{{{{...{{,.{((((.(((((..((((((...(((.,(((((......,{{..(((((((((((.........{((.({...((.....,..}}...)).})}....((((((,{.(((.......,,),,,},)))))}.{({{({.,.,,}))}},.........,.,(,,.({.......})})))......))))))))))).,,,......{(((.((((((((..(,{((({.{({{|....}.}}}),.))))..,},.))))))))...))))))))).,})),.))))))))))).)))))......,,.,.,,|||.{,..((((((((((.((.....)).))))}}))))),}.}}}......}}||||||}{((((({{(,,,({{{,,,,,,.}}||{|,.,,,}))))))}}},..{|{||{,|||,.{||,,,,|||,|,,.||||}}..(((((....))))),}}}))))))),,...}}}.|,|||}}}}})))),.....,,,,}}}}}}))}))))).)))
Back