Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FGD4_0012300
Sequence Length
564 nt
GC Content
0.4060
UUCAACAACAUGUUGCUGUACUGUGUGCCCAAAUUCAGCUUGGUAGGCUCUAAAUUCACAGUUCGAACCAGGGUUGGCAUUGAUGGAAUGAAAAUUGUAGAGACUCAAAAUGAAGAAUAUCCACAUACUUUCCAGGUGUCUGGGAAAGAGAGAACACUGGAACUGCAGGCCAGUUCUGCGCAAGACAAAGAAGAAUGGAUCAAGGCCCUUCAAGAAACCAUCGAUGCUUUUCAUCAAAGGCAUGAAACCUUCAGAAAUGCAAUUGCAAAGGAUAAUGACAUUCACUCAGAGGUUUCUACUGCUGAGCUAGGGAAAAGAGCCCCAAGAUGGAUCCGAGAUAAUGAAGUGACAAUGUGUAUGAAAUGUAAAGAACCUUUCAAUGCACUGACACGAAGGAGGCAUCAUUGUCGAGCAUGUGGAUAUGUGGUUUGUUGGAAAUGCUCCGACUACAAAGCUCAACUUGAAUAUGAUGGUGGUAAAUUGAGCAAAGUUUGUAAAGACUGUUAUCAAAUCAUAAGUGGAUUCACAGACAGUGAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAAUUUUAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-125.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -137.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 149.48
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.........(((((((.(((((...(((.(((((.(((((..((((((...(((..(((((......(((..(((((((((((.........(((.((...((........))...)).)))....((((((((.(((.......)))..)).)))))).((((((.....))))))............(((.((........)))))......))))))))))).)))......((((.((((((((.((.((((..(((((....).))))..))))..))..))))))))...)))))))))..)))..))))))))))).))))).............(((.((..((((((((((.((.....)).)))).)))))))).)))........((((((..(((((..((.((...(((((((....(((.....))))))))))...)))).)))))..))))))(((((...((((....(((((....)))))....)))))))))...)))...))))))))))))......)))...((((....))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..,....,,(((((((.(((((...(({.{((((.(((((..((((((...(((.,(((((,.....,{{..(((((((((((.........{((.({...((.....,..}}...}).}}}....((((((,{.(((.......,,),,,},)))))}.{({{({.,.,,}))}},.........,.,(,,.({.......})})))......))))))))))).,,,......{(((.((((((((..(,{((({.{({||....}.}}}),.))))..,},.))))))))...))))))))).,})),.))))))))))).))))},,...........(((.{{..((((((((((.((.....)).)))),,)))))}}.)))...,,...((((((.,(((((..((,{{.,.(((((({.,{{(((.....))))))}))}..,||||.}}}}}..}}}}}}||{{{...{{{{,,..(((((....)))))....)))))))))...))).,.)))))))))))}......,,,...,,,,.},,|}}}..,,
Back