Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FGD4_0013600

Sequence Length

399 nt

GC Content

0.2807

GUUAGAAUGAGCACUUCCAUUUAAGAAAUCCUUUCAUGUCUUCUUCUCUUUCACAUGUAGGACCUGGAACAGUUUGAAAGAUAUACCUCCAUGUUGCCAAAAUAGAUCCAUGGUGAAAAAUACAGGGACAGUUGAGGCUAUUGUAUUAACUUAUUUAAUUUAGUUUAUAAAUCUCUAGCUGCAUAAAUGAUGUCUGUUCUUUUAAAACAAAAGAAAAAGGACAAAUUGUUGGUGUUCAGAUUUCCGAUUUAUAAAGAAAAGAUAACUUGUUUUUGUAGAAAUACUCCUAAGAAUGUCUUAAGUAUAUAGCAAUUAUGUAUAUAUAGUAUUAAAUAUAUAUAUUAUACAUGCUUUUAGGUUCACAUUCAUCUCUAAUUUAUUUUUUAAAUAUAAAGCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-65.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -74.64

Frequency: 0.0000

Diversity: 127.20

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((.....((...........(((..(((((.............))))).)))(((((((.(.((((....(((((......)))))....)))).).)))).)))......(((((((((((((((.((....)).)))))(((((...(((..((((((((((((((((..((..(((..(((((.(((((((.....)))))))...))))).)))..))..))).))).....))))))))))..))))))))..))))))))))...(((((..(((((...))))))))))..((((..((((((((((((........)))))))).))))..))))....))......))))).))))))(....(((((....)))))...)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((.....,{,...,,{...,(((..(((((.............})))).)))|{{((((...{((({,..{{,{(.,,.,,|||||,,|,,,.,...}}}},))},.....,{||||||((((((({(,..,{||{,,|||{.,......|,}}|||||||,||}}.}}}}}{{,.{{{,,(((((.(((((((.....)))))))...))))).,})},}}))))))))}},,,,},||||||||{{.{{{....}}),))))))))}}.(((((..(((((...})))))))))..((((..((((((((((((........))))))))},)))..)))),,,})),..,,,))))}.)))))){,{{.((({{....})))).}})