Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FNDC3B_0001000

Sequence Length

363 nt

GC Content

0.5455

AAGCUCGGGCGGGGGAGCGGGGCGCGGCGGGAAGGAGCGGGCGACCCGGUGUGUGGGCCAGCGGAGCUCCGGAAGCCAGUUGAGGGAAGUUCUCCAUGAAUGUACGUCACAAUGAUGAUGACCGACCAAAUCCCUCUGGAACUGCCACCAUUGCUGAACGGAGAGGUAGCCAUGAUGCCCCACUUGGUGAAUGGAGAUGCAGCUCAGCAGGUUAUUCUCGUUCAAGUUAAUCCAGGUGAGACUUUCACAAUAAGAGCAGAGGAUGGAACACUUCAGUGCAUUCAAGGACCUGCUGAAGUUCCCAUGAUGUCACCCAAUGGAUCCAUUCCUCCCAUUCAUGUGCCUCCAGGUUAUAUCUCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-102.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -110.47

Frequency: 0.0000

Diversity: 131.80

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((........))))((((((((..((((.((((.((((..((((.....))))...))....(((((..((((((((((((((.((((.....))))((.(((((......)))))))........))))))...)))))........)))...))))).((((.......))))(((...(((((((((.((.((...((((((((((((((((((((..(((.......((((.....)))))))..)))).)))))).((((((....)))..)))...)))))))))).))))))))....)))))...)))..)).)))))))).....)))))))).((((...)))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

..((((........}}}}(((((((({.(((,,((((,(((,..||||.|,,.,,|||}.}},,.,||||{..{{{{{{{{((((((.((((.....}}}|({.(((((,,....)),)))}........)))))),|,}}))}}}.,,...)))...}}|||,,{((||{..{,,||}{{{,,{(((((((((.{{.,..{{(((((((((({(((((((((..{{{.......((((,...,))))}}}..)))).)))))}|{{.(((....)))..)))...)))))))))),))))))}}....}))}}.,,))).,)).))))))))...,.))))))))..|||....)}}.....