Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0001100
Sequence Length
607 nt
GC Content
0.5338
AAGCUCGGGCGGGGGAGCGGGGCGCGGCGGGAAGGAGCGGGCGACCCGGUGUGUGGGCCAGCGGAGCUCCGGAAGCCAGUUGAGGGAAGUUCUCCAUGAAUGUACGUCACAAUGAUGAUGACCGACCAAAUCCCUCUGGAACUGCCACCAUUGCUGAACGGAGAGGUAGCCAUGAUGCCCCACUUGGUGAAUGGAGAUGCAGCUCAGCAGGUUAUUCUCGUUCAAGUUAAUCCAGGUGAGACUUUCACAAUAAGAGCAGAGGAUGGAACACUUCAGUGCAUUCAAGGACCUGCUGAAGUUCCCAUGAUGUCACCCAAUGGAUCCAUUCCUCCCAUUCAUGUGCCUCCAGGUUAUAUCUCACAGGUGAUUGAAGAUAGUACUGGAGUCCGCCGGGUGGUGGUCACACCCCAGUCUCCUGAGUGUUAUCCCCCAAGCUACCCCUCAGCCAUGUCUCCAACCCAUCAUCUCCCUCCCUAUCUGACUCACCAUCCACAUUUUAUUCAUAACUCACACACGGCUUACUACCCACCUGUUACCGGACCUGGAGAUAUGCCGCCUCAGUUUUUUCCCCAGCAUCAUCUUCCCCACACAAUAUAUGGUGAGCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-169.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -182.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 196.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((((((.((((...((.(((..(((((((((.....(((((.((((...(((((.(((((..((((((((((((((.((((.....))))((.(((((......)))))))........))))))...)))))........)))...))))).....(((((((..........(((((((((.((.((...((((((((((((((((((((..(((.......((((.....)))))))..)))).)))))).((((((....)))..)))...)))))))))).))))))))....)))))....(((.....)))......))))).))((((((....(((((((........)).)))))...))))))))))).(((((.......)))))((.((....)).))......)))).)).))).....))).)).))))..))).))..)))))))))...........................((((.(((.((..(((...((.........))..)))....))))).)))))))))).)))))(((.....((.(((((.................))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((((((((((.((((.,.((.(((..(((((((((.....(((((.{((({,.{((({.((({(,.{({{((((((((((.((((.....)))}{{.(((((,.....)),)))}........)))))).,,})))},,.,,...|||,,,}||||,{{{{{{,.,{,|||}{({{{{{((((((((,{{.,.,{{(((((((((({{((({((((..{{{.......((((,...,})}}},}..)))).)))}||{((.(((....}}}..}}}...}))))))))}})))}||||,...,}}},.,,})).,,}},})))}}}}}}}},},}.((((((,,..((((({{,.......)),}))))...))))))}}))).||||({{{,...))}},((,{{..,,)},))......)))}.)).))).....))).}).))))..))).)).,)))))))))....,,.....................((((.(((.,,..(((...((.........))..)))....}}))).)))))))))).)))))(((.....((.(((((.................))))))))))
Back