Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FNDC3B_0002500

Sequence Length

318 nt

GC Content

0.4560

AGACUGGCAAACAGACUGCUCAGCAAGUGUUUAUUGAAUGAAUGAUUUAAUGAUGGAGCAGGACAUGUUGUUUUGACACUGAGAUGCCAUGUGUUUGAACCAGGAAGCCAGUUGAGGGAAGUUCUCCAUGAAUGUACGUCACAAUGAUGAUGACCGACCAAAUCCCUCUGGAACUGCCACCAUUGCUGAACGGAGAGGUAGCCAUGAUGCCCCACUUGGUGAAUGGAGAUGCAGCUCAGCAGGUUAUUCUCGUUCAAGUUAAUCCAGGUGAGACUUUCACAAUAAGAGCAGAGGAUGGAACACUUCAGUGCAUUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-75.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -82.76

Frequency: 0.0000

Diversity: 59.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((.((((..((((((.........(((((((((.....)))))))))..))))))....))))((((.(((((((......)).))))).))))......)))))))...(((.....))).(((((((((((((((....)).))))...(((........))).....(((((.((((((((((.((((.(((((.(((.((..(((((........))).))..)))))...))))))))))))))............((((.....))))......))))).)).))).........)))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((((.((((..((((((.........(((((((((.....)))))))))..))))))....))))((((.(((((((......)).))))).))))......))))))),,(({,...}}))|.(((((((((((((({....)).))))....,...,,((((((,,....{(((({((((((((({{((({{(((((.(((.((..(((((.,....,.))).))..)))))...))))))))))))))},)}.}}}...)))}.}...|}}.......,,,)))))).|||,....,}}.)))))))))..