Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0004500
Sequence Length
353 nt
GC Content
0.2861
AGCACAAAACUUAUUGACAUGAGCCUGGAAUUUUGAAGUAAGGGCAGUCAUGCUAAUAUUGUGAUUUUCCAUAUUUGUGCUUUGUAUGUAAAGUGACUGUUUUUAACAUUUUAAUUUUAAUUAUUAUGGGUACAUAAUAGUUGUAUAUAAAGUGACUCUAUUUUGAGUUUUACAUUUUACAGGAUAAAACCUUAAGAUUAAUUCCAUACAUACAUUUCAAAAUAAGGCAUCGACUUGAUAGAAAAGUUUUCUUUUUCCUUAGAUCGAUAAUAUGCUGAAUACACUUUUGGAUGCAGAAAAUAAAAUUCUGAGCAGUAUUAUAAAUUAGAAGAUUGAAUGGCUCUGUUGGUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-70.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -76.86
Frequency: 0.0001
Diversity: 86.61
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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