Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FNDC3B_0005200

Sequence Length

425 nt

GC Content

0.3553

UUUCAAUUUCUGGAACAGCAUAUUAAUGCAUAGUGGGUUCUCCAGCUCCAUAGUAAAUUUGGUGAUGAAAUGAAUCAACAUGUGGUAAAUACGUGGUGCUACAAGGUGAUGAGAUCAUCUCCUUGAUCUUAGAUUAUGUUUUCAGCUUUGAGCAAGUGGUGGGACAUCUUGGGAUGAUACUGCUUACCUCAUUUGAUUUGAUCAAUGAGAUUGAAUUUGUAAAGCUGGGCUUCAGGAUAUGGCCUACAGAUUUUUUUGCGUUUGGUUUUGUAGAGUGUUUUAAAAACUUUGCAAGCAACAUUUAAGAACUAAGGGAUUUCACGUAAAAUAAGAUUUCUAGCUUUUUUGGUUUGUUUGUUUUGUUUUUUUCUUUAGAAACUGAAAGAUCUGACAACAUGGCCUGCAUUCCUAUAUGGUUAGUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-95.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -104.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 112.37

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.....)))))(..(((..((((.((((..(((...(((((((...((.(((((((((((((.......)))..((((((.....))))))..(((.((((((..((((((((......)))))))).............)))))))))((((((((...((((....)))).))))))))..((((((.(((...))))))))))))))))))))).)))))))...((((.((((.....((((((((((.......((((((.(((((......((((((...((((((((.(((.((((((((.(((((((...........)))))))))).))))).)))))))))))...))))))..)))))))))))))))))))))....)))).))))...)))..)))))))))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((.....)))))(..({(,,((((.((((..(((...{((((((..{{(,,,(((((,(((((.,....,||||.{(((((,,...}}}}}}.{(((.((((((((((((((((......))))))))..........}},})}}}))))|(((((((...((((....)))).)))))))),,|{||||||||,,.))))))}))))),,}}))))..))))))}...((((.{(((.....((((((((((.......((((((.(((((......((((((...((((((((.,,,.(((({((,{(((((((...........)))))))))).))))}.})}))))))))...))))))..)))))))))))))))))))))....)))}.))))...,)),.)))))))))))..)