Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0009400
Sequence Length
1278 nt
GC Content
0.4859
CCAGUUGAGGGAAGUUCUCCAUGAAUGUACGUCACAAUGAUGAUGACCGACCAAAUCCCUCUGGAACUGCCACCAUUGCUGAACGGAGAGGUAGCCAUGAUGCCCCACUUGGUGAAUGGAGAUGCAGCUCAGCAGGUUAUUCUCGUUCAAGUUAAUCCAGGUGAGACUUUCACAAUAAGAGCAGAGGAUGGAACACUUCAGUGCAUUCAAGGACCUGCUGAAGUUCCCAUGAUGUCACCCAAUGGAUCCAUUCCUCCCAUUCAUGUGCCUCCAGGUUAUAUCUCACAGGUGAUUGAAGAUAGUACUGGAGUCCGCCGGGUGGUGGUCACACCCCAGUCUCCUGAGUGUUAUCCCCCAAGCUACCCCUCAGCCAUGUCUCCAACCCAUCAUCUCCCUCCCUAUCUGACUCACCAUCCACAUUUUAUUCAUAACUCACACACGGCUUACUACCCACCUGUUACCGGACCUGGAGAUAUGCCGCCUCAGUUUUUUCCCCAGCAUCAUCUUCCCCACACAAUAUAUGGUGAGCAAGAAAUUAUACCAUUUUAUGGAAUGUCAACCUACAUCACCCGAGAAGACCAGUACAGCAAGCCUCCGCACAAAAAACUGAAAGACCGCCAGAUCGAUCGCCAGAACCGCCUCAACAGCCCUCCUUCUUCUAUCUACAAAAGCAGCUGCACAACAGUAUACAAUGGCUAUGGGAAGGGCCAUAGUGGUGGAAGUGGCGGAGGCGGCAGCGGUAGUGGUCCCGGAAUUAAGAAAACAGAGCGACGAGCAAGAAGCAGCCCAAAGUCGAAUGAUUCAGACUUGCAAGAAUAUGAGUUGGAAGUAAAGAGGGUGCAAGACAUUCUUUCGGGAAUAGAGAAACCACAGGUUUCUAAUAUUCAGGCAAGAGCAGUUGUGUUGUCCUGGGCUCCCCCUGUUGGACUUUCCUGUGGACCCCACAGUGGUCUUUCCUUCCCCUACAGUUACGAGGUGGCCUUAUCAGACAAAGGACGAGAUGGAAAAUACAAGAUAAUUUACAGUGGAGAAGAAUUAGAAUGUAACCUGAAAGAUCUUAGACCAGCAACAGAUUAUCAUGUGAGGGUGUAUGCCAUGUACAAUUCCGUAAAGGGAUCCUGCUCCGAGCCUGUUAGCUUCACCACCCACAGCUGUGCACCCGAGUGUCCUUUCCCCCCUAAGCUGGCACAUAGGAGCAAAAGUUCACUAACCCUGCAGUGGAAGGCACCAAUUGACAACGGUUCAAAAAUCACCAACUACCUUUUAGAGUGGGAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-330.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -356.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 307.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((((.((((.....))))((.(((((......)))))))........))))))(((...((((.(((((((((((.((.((((.......((((..(((...(((((((((.((.((...((((((((((((((((((((..(((.......((((.....)))))))..)))).)))))).((((((....)))..)))...)))))))))).))))))))....)))))...)))...)))))))))).))))(((((((((((....(((((((........)).)))))...))))))......(((((((((........(((.(((..(((((..(((((....((((((((((..((((.((((((((.(((..(((..(......(((((.(((.............................((((.((((.((...(((....)))....)))).)).)))).(((.(((((((.....((.(((((.................)))))))...........((((...)))).((((......))))...(((.(..(((((.(((.((..((((((((((......(((...((.((......)).))..)))..(((((......((((((((....((((...........((((.....)))).....))))....))).)))))......)))))..)).))))))))....)).))).))))))))).....))))))).)))((((..((........)).....))))..))).)))))...)..)))..))).)))))).....((((((((.....))))))))...(((((.(((((((...)))))))..)))))(((.((((.((.(((((..((((((((.....((....)).....)))).))))..))))))).)))).))).(((((.(......)))).))((((........))))..)).)))).....(((.((((((((....(((..((((.((((........))))....))))...))).....)))))))).)))))))).))).))....(((......)))..)))))..))))).))).)))......))))))))).(((((..((((....)))).............))))))))))(((((((....)))).))).....)))))))..)))))))......)))))((((....((((...(((.....))).))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((((((.((((.....)))){{.(((((,.....))})))}........))))))(((...((((.((((((({(((.((.((((.......((({..(((.{,(((((((((.((.,,.{{(((((((((({(((((((((..(((.......((((,...,))))}})..)))).)))))}{((.(((....)))..}}}...)))))))))},))))))))....))))).},)))..,}}}})))))).)))}{((((((((((.,..(((((({........)),}))))..,))))))......(((((((((........(((.(((..(((({..(((((....(((((((((({..,,,,,,..,....,.{({((((,.({{.,.(((((..,.,{,{{,....,{,,{{,.(({(((,....{(({.,,{,..{,,.{,||..,}}}...}))}}.}},||||((((.(((((({.....((.(((((,,...............))))}}}.,|........((({...}))).{{{{......}}})...(((.{..(((((.(((.((..((((((((,{......{{(...((.({...,..)}.}),.||}..(((((.{....((((((((....((((...........((((.....)))).....})))....)))}}))))....}.)))))..,))))))))))....)).))).)))))}))).....,}}}}}}.}}|{,.,..||.....}}.||...((((({{,...,)}.)))))}}..,,...)))))))),}}}}}||{{{{{{.,,,,|}}}}}}.,,.(((((.(((((((...)))))))..))))){((.{(((.((.{{(((..((((,(((.....{{....)),....))||.))))..))))))).)))}.))}.,}},,........)}))))),....)))))...,))).))))))}.....,{{.((((((({....(((.,({{{.((((........))))....)))}...))).....)))))))).)))))))).))).))...,{((......))}..)))))..})))).))).)))......))))))))).(((((..({{{..,,|}},.,.,,,.......)))))))))}{((((((....)))).))}.....)))))))..))))))).....,}}}))((((....((.((,.((,.....,,)}))))))))))
Back