Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0009700
Sequence Length
729 nt
GC Content
0.4746
AUCCUACCUUCUGGGAAAGGUGGAGCUGCCUGGCUUGGACUCACCUCUCUUAGUCUUGUUCAGGUAAACAGCUGGGGAGCGAGAUGGCACUUGGUUUUUGCACAGUAGUAAAUUGUAAACUUUAUAGAGGCCAUUCCUCUUCAUUAUCUUACAUGAUCUCCACAUUAACUCCAGAAGGUGGCAGUGCCUCUGGCUCCCCAGCUUCUGAAAAUUGAGGACUAAGCAGCAGUGGUAGUGUCGGAAGGCCUGGAGGUCAGGCUUGUGUUUGCAAAAGGAGCUGGGAGUGAAAUCUUCCGAAGCCCCAGUCCGGGUCACAGCAGCGGCUCCCUUUUUUCCUUAGGGAAUGGUUCUUUUCUUGAGAUUGGCAGUAGGAGGGCUGCUCCCUCCCGGGUCAGCAGUUGCUGAGAGAUGGUGGUGGCCAGAGAAGGGUAGUAGACGGUAGUAGUAGGUAGAGAUAGUAGAGGUAGUAGAGGUUCCUCCCCCGUGGGAGUCUCACCCUGGAGUUAGGAGAGGGCCUUUUGCCUACCUUUUCUUCCCAAACCCCGUCCUUCAUUUCCAUUAAAAAAUUGCAUCACCCUAGAUGCAGCUUUGAGACUAAAGAAAUUUAAAACCUUGUAAGAUUUGAACACAUUAGGUGGUUUUUCAUUCUGAGUUUACAGAGUAAUGCCAGAAUAAAAGAAACAAAGUGUAUCCUUCAAAAGGAAAGAAAAUGGCCACUUCGCGUCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-239.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -254.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 183.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(........)((((((((((.((((((((.((((((((((((((..(((((((((((.((((((.....(((((((((((.(((.((((((.....(((((......))))).(((((.......(((((.....)))))........)))))......((((.((........)).)))).))))))))).))))))))))))))))).....))))))))).))..)))...(((.....(((((((.....))))))).....)))....((.((((((((......)))))..))).))))))))))))).....))))))))))))))).(((((((((.......)))))))))...((((((......))))))(((....)))(((((....)))))..(((((.((((((((..((((((((...(((((........(((......((.((((((((.((((((((((((((((.(((.......)))))).)...)))).))))))))...)))))))).))......))))))))....................((((((......))))))(((((((((((..((((....((((((.(.(((............))).).))))))...)))).))))).))))))..........................))))))))..............)))))))).).)))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..,..,,,|{{({(({({(,((((((((,((((((((((((((..(((((((((((.((((((.....(((((((((((.(((.((((((.{,,,{{(({,.,,,.}}}}}.|||||,......(((((.....))))).,,,....,,,,},}}...((((.,{........},.)))),))))))))).))))))))))))))))}.....})))))))).))..))){,,{,,.{{.,(((((((,...,))))))).,,.,}))....((.((((((((......)))))..})).))))))))))))}..),,))|||}}},|||||||(((((((((,{.,{..||||||}}}..,(((({,.{{{,{|}}}}}|||},,.}}}(((((....)))))..(((((.((((((({..{{{{{{,{...(((((........((,,({({.,{.{(((((((,((((((((((((((((.(((.......)))))).}...)))).))))))))}),))))))))})),})...))})))))}},}.}|,},..........((((((......))))))(((((((((((..((({.,..((((((.{.(((............))).}.))))))..,)))).))))).))))))..,}}}}}..,..}}}},},.,}.}}).}|||}...})))},,,,...}))))})).).)))).}))
Back