Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FNDC3B_0013300

Sequence Length

754 nt

GC Content

0.4695

GACCUGCUGAAGUUCCCAUGAUGUCACCCAAUGGAUCCAUUCCUCCCAUUCAUGUGCCUCCAGGUUAUAUCUCACAGGUGAUUGAAGAUAGUACUGGAGUCCGCCGGGUGGUGGUCACACCCCAGUCUCCUGAGUGUUAUCCCCCAAGCUACCCCUCAGCCAUGUCUCCAACCCAUCAUCUCCCUCCCUAUCUGACUCACCAUCCACAUUUUAUUCAUAACUCACACACGGCUUACUACCCACCUGUUACCGGACCUGGAGAUAUGCCGCCUCAGUUUUUUCCCCAGCAUCAUCUUCCCCACACAAUAUAUGGUGAGCAAGAAAUUAUACCAUUUUAUGGAAUGUCAACCUACAUCACCCGAGAAGACCAGUACAGCAAGCCUCCGCACAAAAAACUGAAAGACCGCCAGAUCGAUCGCCAGAACCGCCUCAACAGCCCUCCUUCUUCUAUCUACAAAAGCAGCUGCACAACAGUAUACAAUGGCUAUGGGAAGGGCCAUAGUGGUGGAAGUGGCGGAGGCGGCAGCGGUAGUGGUCCCGGAAUUAAGAAAACAGAGCGACGAGCAAGAAGCAGCCCAAAGUCGAAUGAUUCAGACUUGCAAGGUAAUACUCAAGAUGUUUGCCAUAGAGUGAAUUAUCAAGACAGAGACAUCUCAAAUGAUGUUUCCACAUCUUUUACAUGAGAAUAUUAUUUCAUGGUGGUUGGUUGUUCUGCUAAGAAUAUUUGAGUAGACCUUCUUUGAUCUAUUUCUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-179.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -194.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 208.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(..(((((...((((.(((((........((((....))))........)))))...(((((((((.......(((((((...............(((((..((((((((((((((((((..(((....))).))))..........(((.......))).................................))).))))))))........................)))..))).))))))))).....)))))))))......(((.((.(((((((.....((.(((((.................)))))))...........((((...)))).((((......))))...(((.(..(((((.(((.((..((((((((((......(((...((.((......)).))..)))..(((((......((((((((....((((...........((((.....)))).....))))....))).)))))......)))))..)).))))))))....)).))).))))))))).....))))))).)))))..))))....))))).)(((.(((..(((((((..((((....(((((.((.......)))))))...)))))))))))...))).((((((((......))))))))..((.((....(((((((......)))))))..)).))..((((((....))))))...(((((((.(......).))))))).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(,,(((((,..{{{{.(((((,,......,{{({,..,,,}.....}},))))).,.(((((((((.......(((((((...,.((((((...,((((...{,.((((((((({.({{{..(((....}}),}))}...,......|||,,,....}))...}.,.,,,,,,,.....},,,....}}}}}),..,}},}............................||...,,..,,))))))).....)))))))))...{{{((((((.(((((((,....((.(((((.................))))))}..|,.......((({...}))).{{({......})}}...{{|,|,,|{{((.({{.((..(({{{{||.,......|||...({.(,...,..),.}|{,||,..(((((.{....((((((((....((((...........((((.....)))).....})))....)))}}))))....}.)))))...)))))))))),,,.)).))).)))))|}||,....}}}}}}},||||}.|}|||....}}}}}.}{,{,(((,,((({{(({,|{{|,.,,(((,,,((,,,,,,,||||||}...}}}))))}})),..}}}.((((((((......))))))))..,,.|,....(((((((......))))))).,)),}}}}||||||,...})))}}.}}}||||{|,|}},,,,),))))}))))})