Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0017700
Sequence Length
2795 nt
GC Content
0.4891
AAAUUAUACCAUUUUAUGGAAUGUCAACCUACAUCACCCGAGAAGACCAGUACAGCAAGCCUCCGCACAAAAAACUGAAAGACCGCCAGAUCGAUCGCCAGAACCGCCUCAACAGCCCUCCUUCUUCUAUCUACAAAAGCAGCUGCACAACAGUAUACAAUGGCUAUGGGAAGGGCCAUAGUGGUGGAAGUGGCGGAGGCGGCAGCGGUAGUGGUCCCGGAAUUAAGAAAACAGAGCGACGAGCAAGAAGCAGCCCAAAGUCGAAUGAUUCAGACUUGCAAGAAUAUGAGUUGGAAGUAAAGAGGGUGCAAGACAUUCUUUCGGGAAUAGAGAAACCACAGGUUUCUAAUAUUCAGGCAAGAGCAGUUGUGUUGUCCUGGGCUCCCCCUGUUGGACUUUCCUGUGGACCCCACAGUGGUCUUUCCUUCCCCUACAGUUACGAGGUGGCCUUAUCAGACAAAGGACGAGAUGGAAAAUACAAGAUAAUUUACAGUGGAGAAGAAUUAGAAUGUAACCUGAAAGAUCUUAGACCAGCAACAGAUUAUCAUGUGAGGGUGUAUGCCAUGUACAAUUCCGUAAAGGGAUCCUGCUCCGAGCCUGUUAGCUUCACCACCCACAGCUGUGCACCCGAGUGUCCUUUCCCCCCUAAGCUGGCACAUAGGAGCAAAAGUUCACUAACCCUGCAGUGGAAGGCACCAAUUGACAACGGUUCAAAAAUCACCAACUACCUUUUAGAGUGGGAUGAGGGAAAAAGAAAUAGUGGUUUCAGACAGUGCUUCUUCGGGAGCCAGAAGCACUGCAAGUUGACAAAGCUUUGUCCGGCAAUGGGGUACACAUUCAGGCUGGCCGCUCGAAACGACAUUGGUACCAGUGGUUAUAGCCAAGAGGUGGUGUGCUACACAUUAGGAAAUAUCCCUCAGAUGCCUUCUGCACCAAGGCUGGUUCGAGCUGGCAUCACAUGGGUCACGUUGCAGUGGAGUAAGCCAGAAGGCUGUUCACCCGAGGAAGUGAUCACCUACACCUUGGAAAUUCAGGAGGAUGAAAAUGAUAACCUUUUCCACCCAAAAUACACUGGAGAGGAUUUAACCUGUACUGUGAAAAAUCUCAAAAGAAGCACACAGUAUAAAUUCAGGCUGACUGCUUCUAAUACGGAAGGAAAAAGCUGUCCAAGCGAAGUUCUUGUUUGUACGACGAGUCCUGACAGGCCUGGACCUCCUACCAGACCGCUUGUCAAAGGCCCAGUUACAUCUCAUGGCUUUAGUGUCAAAUGGGAUCCCCCUAAGGACAAUGGUGGUUCAGAAAUCCUCAAGUACUUGCUAGAGAUUACUGAUGGAAAUUCUGAAGCGAAUCAGUGGGAAGUGGCCUACAGUGGGUCGGCUACCGAAUACACCUUCACCCACUUGAAACCAGGCACUUUGUACAAACUCCGAGCAUGCUGCAUCAGUACCGGCGGACACAGCCAGUGUUCUGAAAGUCUCCCUGUUCGCACACUAAGCAUUGCACCAGGUCAAUGUCGACCACCGAGGGUUUUGGGUAGACCAAAGCACAAAGAAGUCCACUUAGAGUGGGAUGUUCCUGCAUCGGAAAGUGGCUGUGAGGUCUCAGAGUACAGCGUGGAGAUGACGGAGCCCGAAGACGUAGCCUCGGAAGUGUACCAUGGCCCAGAGCUGGAGUGCACCGUCGGCAACCUGCUUCCUGGAACCGUGUAUCGCUUCCGGGUGAGGGCUCUGAAUGAUGGAGGGUAUGGUCCCUAUUCUGAUGUCUCAGAAAUUACCACUGCUGCAGGGCCUCCUGGACAAUGCAAAGCACCUUGUAUUUCUUGUACACCUGAUGGAUGUGUCUUAGUGGGUUGGGAGAGUCCUGAUAGUUCUGGUGCUGACAUCUCAGAGUACAGGUUGGAAUGGGGAGAAGAUGAAGAAUCCUUAGAACUCAUUUAUCAUGGGACAGACACCCGUUUUGAAAUAAGAGACCUGUUGCCUGCUGCACAGUAUUGCUGUAGACUACAGGCCUUCAAUCAAGCAGGGGCAGGGCCGUACAGUGAACUUGUCCUUUGCCAGACGCCAGCGUCUGCCCCUGACCCCGUCUCCACUCUCUGUGUCCUGGAGGAGGAGCCCCUUGAUGCCUACCCUGAUUCACCUUCUGCGUGCCUUGUACUGAACUGGGAAGAGCCGUGCAAUAACGGAUCUGAAAUCCUUGCUUACACCAUUGAUCUAGGAGACACUAGCAUUACCGUGGGCAACACCACCAUGCAUGUUAUGAAAGAUCUCCUUCCAGAAACCACCUACCGGAUCAGAAUUCAGGCUAUAAAUGAAAUUGGAGCUGGACCAUUUAGUCAGUUCAUUAAAGCAAAAACUCGGCCAUUACCACCCUUGCCUCCUAGGCUAGAAUGUGCUGCUGCUGGUCCUCAGAGCCUGAAGCUAAAAUGGGGAGACAGUAACUCCAAGACACAUGCUGCUGAGGACAUUGUGUACACACUACAGCUGGAGGACAGAAACAAGAGGUUUAUUUCAAUCUACAGAGGACCCAGCCACACCUACAAGGUCCAGAGACUGACGGAAUUCACAUGCUACUCCUUCAGAAUCCAGGCAGCAAGCGAGGCUGGAGAAGGGCCCUUCUCAGAAACCUAUACCUUCAGCACAACCAAAAGUGUCCCCCCCACCAUCAAAGCACCUCGAGUAACACAGUUAGAAGGAAAUUCAUGUGAAAUUUUAUGGGAGACGGUACCAUCAAUGAAAGGUGACCCUGUUAACUACAUUCUGCAGGUAUUGGUUGGAAGAGAAUCUGAGUACAAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-843.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -895.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 640.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((...)))).((((......))))...(((.(..(((((.(((.((..((((((((((......(((...((.((......)).))..)))..(((((......((((((((....((((...........((((.....)))).....))))....))).)))))......)))))..)).))))))))....)).))).)))))))))................((((..((........)).....))))..((((((((((((.(((.(((((..((.((((((.((.(((((((((.((((((((.(..(((((.(((((((...)))))))..)))))..).)))))....))).)))).(((..(((((......(((((...((((((...)))))).)))))(((((((.......(((((((((((.((((........))))....(((((.....(((.((((((((....(((..((((.((((........))))....))))...))).....)))))))).)))(((((((((............(((.(..(((((.((((.((((.((((((((.(((...((.((..(((((((((((...(((((((((...((((.....((((...(((((((....)))).))).(((..(((((.(((((((...........(((................)))...(((((.(((((.((((.....(((((....)))))...((((((((((..((...))))))))))))...........(((((...(((((..((((((((((.(((.(((((((((((.(..((.......))..)))))))..)))))..)))...)))))))........(((....)))..((((.....))))..)))..)))))...)))))(((((((...(((((((......)))(((..((((....)))).)))..((((((..(((......))).))))))...((((......))))........(((((((((........((((.((((((.....((((((((((.(((...........(((((((..((((..........))))..)))))))....(((((((((...(((.....)))....)))))((((((((((..(((((((((((((((((........))))...))))))))((((((.((......))...))))))..((((....(((....)))....)))).(((((.(((((((.((((((.((((((....)))..)))))).)))..))))))).)...((((((((..((((((.((.....)).)))))).(((......))).))))).))).)))))).))))))))))))))))).(((...))).((((((((((.((((((.....))))))....(.((((((....(.(.(((((((((((.((.(((((...(.(((.....))).)(((((((.....))))))).......((.((((((.((((((((...)))))).))...))))))))..(((((((.......((((((((.(((..((((((((.........(((.((((((((...(((((.(((((((.((..(((.......))).)).)))..))))..)))))...)))))))))))..))))))))........((((......)))).((((((....))))))))).)))).))))..)))))))..(((.(((((((......)))))))))).....))))).)).).))).)))))))))..)))))).)..........))))))))))....))).))))))))))(((((((((....((((((((.((....))..)).))))))(((((.......)))))(((((...(((.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))))))...)))))(((((((((((((((...(((((.......)))))...)))...)).)))))))))).)))))).))).))))))))))..))))))))).))))..)))))))..)))).)))).).))))).))))))).)))))....))).(((.((((......)))).)))....................((((((((((((((.((((((...(((((.........))))).)))))))).....)))))).................))))))...((((((((..................((((((..(((.((((.((((..(((........(((.............)))......)))..)))).))))))).))))))....))))))))))))....))))((.(((((.............)))))))))))))))))))).......)))))))..))...........(((((......))))).....(((((...............))))).((..((((.(((.............))).))))..))..)).))).))).))))))))).)))))))))..).)))...))))))))).((((........))))........)))))....))))))..))))).......))))))).(((....))).......))))).)))...((((.......))))))))).)).)))...))).))..)))))..))).)))....))))))).)).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...,.,.((((...}))).}||{(((((........(((.{..(((((.(((.((..((((((((,(......{((...((.({...,..)}.))..}}}..(((((.{....((((((((....((((...........((((.....)))).....})))....)))}}))))....}.)))))..,))))))))))....)).))).)))))})))......,....{{...({{(..((........}},,...}}}}..,}.}}}..(((((({{{({,.,.{{{{{..||,..{.(((({{{{,.{{{{((((,(..(((((.(((((((...)))))))..))))).,|,||}}|....}}).)))})}}|||||,,|}},,.,{((((,{{((((((,..,||||},||,,{(((((((.......(((((((((((,((((........)))).,..(((((.....{((.((((((((....(((..((((.((((........))))....))))...))).....)))))))).))|(((((((((.{....,,....(((.(..(((((.((((.((((.((((((((.(((...((.((..(((((((((((...((((((((({{{(({,..{((((({...(((((((....)))).))}.(((..(((((.(((((((,,.,{{....,{{{,,.....,,.{{..{{,,.....||||}}|||{{((((,....(((((....))))).,.((((((((((..({...)}))))))))))}.,{{{,,,,.}|||}}}}|{|||,.{({((({(((,(((.(((((((((((.(..{(.......))..,)))))),.}))))..}}}|,,|))}))}.}.,,,..||,....)))))),(({{{{.,|||.{{||..,.)))).,})),.||||||,...|||,{{|,,,},,|||(({..((((....)))).}}}.,((((((..(((......))).))))))...,{((,,,{{.}|||........{((((((((........{(({.{(((((,...,{(((((((((.(((...........(((((((..((((..........))))..)))))))....{((((((({...(((.....)))....))))}(((((((((,.{(((((((((((((((((........))))...))))))),((((((.{(......}}...))))))..((((....(((....)))....)))).,{{((.(((((((.(((((,{((((((....)))..)))))).)))..))))))).)...{{{(((((..{{{{{{,||.,,,,||.||}}}).|{,......,}}.)))))},},..,}))).)))))))))))))}}}).((,.,.}}}.((((((((((,((((((.....)))))),,..{.((((((....,,(.(((((((((({.((.(((((,..,.{{{,,,..}}},|(((((((.....))))))).,.....{{.((((({.({((((((...}))))).))...})))))||,{(({{{{|},.,},.((((((((.{{{..((((((((.........(((.((((((((,,.(((((.(((((((.((..(((.,....,))).)).)))..))))..))))),,.)))))))))))..))))))))........((((......)))).((((((....)))))},}}.)))).)))){{||}}}})}}|{{,{(((({{.,....))))))}}}},},..))))).)).}.))).)))))))}}..)))))).)..........))))))))))....))).))))))))))|||((((((....((((({{,.{,....,,..)),)))}))(((((.......))))),((((...{{(.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))})))...))))|(((((((((({{(({...{{|,,,,,},,,})))).,,}))...}),)))))))))).)))))).))),))))))))))..))))))))).}})),.},}))))..,}}}.}})),}}))})).))))))).)))))....))).(((.((((......)))).)))....,,,.,},,.......,(((((((((((((,,((((((.,.,((((......}}}),,)).))))))})...,.)))))).................))))))}..,(((((((...........,.,....((((((..(((.((((.((((..(((........(({.............)))......)))..)))).))))))).))))))}},,))))))))))).....))))||.(((((.............}))))))))))))))))))),,.....}})))))..))..........,{{{{|......,}}}}.....(((((..,............))))).((..((((.(((.............))).))))..))..)).))).))).))))))))).)))))))))..).))}...))))))))),((((........))))........)))))....)))))),.}))))...,...)))))))}.||}}}})....,})))))))),.|||,||},|...,...))))))))).)),})).,)))))))))))...)))))}.......)(((........)))
Back