Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0017800
Sequence Length
2835 nt
GC Content
0.3760
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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-672.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -736.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 688.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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