Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0019100
Sequence Length
436 nt
GC Content
0.4587
AUUGUAACUGCUUCUUUCCAGCUGCAUCAGAAGAAGGGGACUUUCCAUGUAGGUGUUAUUCUCAGAAAAGGCCAGAAAAGACCAGGUCAUGGUGGGGAUGAUUUGCUCCAAGCAUAAAAGAGAAUUGUGAUGGUUCAGGAAGACUGGAAAAUAACGAGACUGGAAAGAAAUGAGAAGGGCUUCAGAGGAAUGGCACAUUGAAAUAAAAGGAAGUGUUAAAAAUUAAGCACAAGAUGCCAGGCAUGGGAGGAUCACUUUGUGAGGCCAAGGCGAGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGACAGCAUAGCAAGACCCCAUCUCUGACAAAAAAAAUUAGCUGGAUGUGGUGGGCAUGCCUGUAAUCCCAGCUACUUGGGAAGCUGAGAUGGGAGCAUUGUUUGAAGCCAGGAGGUCAAAACUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-117.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -126.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 95.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((.(((((((............))))))).)).((((((((((.((((((.((((((.......((((.....((((.....))))((((........))))...............((((.((..(((((.....)))))..)).))))..)))).......))))))....(((((.(........).)))))..........(((((........)))))..))))))..)))))))))).((((...))))(((..((((((.....))))))..)))..(.((((...((((..(((((.(..((.(((((..(((((((((.(........((.(((((((((..((((....))))....)).))))))).))......).)))))))).)..)))))))..)))))).))))..)))).).
Thermodynamic Ensemble Prediction
........(((((((((((((((((((..{{{(,,{....))))}.))))))..((((((((((.....((((.,.......,.)))).,..)))))))))).{(({...}))}..........((((.,{..(((((.....)))))..},.))))..)))))))))}.,,,....(((((((((.{{,{{{{,|.,,.............(((((........)))))....{{((((((.(((...{{..(((({.((.(((,.((((((.....)))))),.))))),))))})....))))))))).}}.|...||.,...((((((((.{........,,.(((((((((..((((....,}))....))}))))))).})......}.)))))))).}).)).))))))))).,..|.}}....,,))}
Back