Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0020200
Sequence Length
764 nt
GC Content
0.4791
AAUAUGAGUUGGAAGUAAAGAGGGUGCAAGACAUUCUUUCGGGAAUAGAGAAACCACAGGUUUCUAAUAUUCAGGCAAGAGCAGUUGUGUUGUCCUGGGCUCCCCCUGUUGGACUUUCCUGUGGACCCCACAGUGGUCUUUCCUUCCCCUACAGUUACGAGGUGGCCUUAUCAGACAAAGGACGAGAUGGAAAAUACAAGAUAAUUUACAGUGGAGAAGAAUUAGAAUGUAACCUGAAAGAUCUUAGACCAGCAACAGAUUAUCAUGUGAGGGUGUAUGCCAUGUACAAUUCCGUAAAGGGAUCCUGCUCCGAGCCUGUUAGCUUCACCACCCACAGCUGUGCACCCGAGUGUCCUUUCCCCCCUAAGCUGGCACAUAGGAGCAAAAGUUCACUAACCCUGCAGUGGAAGGCACCAAUUGACAACGGUUCAAAAAUCACCAACUACCUUUUAGAGUGGGAUGAGGGAAAAAGAAAUAGUGGUUUCAGACAGUGCUUCUUCGGGAGCCAGAAGCACUGCAAGUUGACAAAGCUUUGUCCGGCAAUGGGGUACACAUUCAGGCUGGCCGCUCGAAACGACAUUGGUACCAGUGGUUAUAGCCAAGAGGUGGUGUGCUACACAUUAGGAAAUAUCCCUCAGAUGCCUUCUGCACCAAGGCUGGUUCGAGCUGGCAUCACAUGGGUCACGUUGCAGUGGAGUAAGCCAGAAGGCUGUUCACCCGAGGAAGUGAUCACCUACACCUUGGAAAUUCAGGAGGAUGAAAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-211.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -227.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 266.79
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((..(((......(((((....((.(((((.((((((((.(((((((...)))))))..))))(((((((.(.......).))).))))(((((((......(((((...((((((...)))))).)))))(((((((.(((((..(((.(((((((((((........)))).............((((.((((((((....(((..((((.((((........))))....))))...))).....)))))))).)))).((((((((((...(((..(((((.....)))))..)))...((((......))))...........)).))))))))..(((.((((((........((((.((..(((((((....)))).)))....)))))))))))))))...........(((.........)))..))))))).))).)))))..))))))).(((((.((.((........)).)).))))).))))))).....((((((((..((((..(((((...(((((..((((((((((.(((.(((((((((((.(..((.......))..)))))))..)))))..)))...)))))))........(((....)))..((((.....))))..)))..)))))...)))))............))))..))))))))(((..((((....)))).))).)))))))))))...)))))....)))...)))))).....((....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((((..,,{....,.(((((.,..((,((((({(((({(((.(((((((...)))))))..}}}}{((({{{{{{({..,||,||||||||(({{{{{{{{,,.{((({...((((((...)))))).)))}|{{{{,{(,(((,{..,,..|{||{||{{{{........}))).,,,.,,}}....{(((.((((((((....(((..({{{.((((........))))....))))...))).,...}))))))).)))|.{((({{{{||,..|||,.{((((.....))))).,)))||.,{|||||...{|||{,{,,{,..{,|{,{||,{{{|{,((({{,,{,{{{,,,...(((({.{,.(((((((....)))).))).,{,{|||||||}}}},,)}..|||.,...||||,....,{{.||..||||}},.}}}.))))).,}}}})},...(((((....))))).,.((((((((((..{{...))))))))))))|(((((,,,..}}}}}})}}})))..,|}}|,,{||}|||.(((((((((((.(..{(.....,.)}..,)))))),.}))))..||||,|||||}}},,,,,...||,.,,,)))))}.((((((..(({.((((....)))).},))..))))))...,)))))}}})))}.)))|{|..((((....)))).,}}.)}})})}}})},.,)}}}).}.}))),..)))))).....{{....,}
Back