Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FNDC3B_0020700

Sequence Length

703 nt

GC Content

0.4026

GUAAAUAAUAAUUUAACCAAGUCCUAAGGGAAAAAAGUAAAGUUGUCAUAGCUGACAUAAAAGGUAGAGUUUAAAGGGAUGUGACUUCAUGGAUAUUUGUUUGGUAUCUAGAACGUUGGCAUUUGACUGAGCUAUUUUGAGACAUGGUUAUUUCACACCACCAUUCAUGGAAUCAGUGUUACUGUCUUCUGUGUUCUUGGGUGCAAAGCAGCCACUUAUCACCUUGGCUGAGUGUUUUCCAGUACCUAAUGAGCCUCCUUUUUUUCCAAGAAACCAAACUCUUUGUAACAAAUUAUCUCCCACGUUAAAAAUAAAAUAUGAUACCCAAUACCUCAGGAUUACUCAUUAAUGGUAUGUGAAGGAAUUGAGCAGAUAUACUGUUGUAUGUUGGAAAUGCUGUCUUAAAAUCUAGGUAGAGAAACAACACACAAAUAACCAAGUAAUGCUCUGUGUAAUGGAAUAUGCACCAAAUGCAGGGAUGGAAAAUAGGCAAGAGUACAAAGAAGAGUGGUUGAAUCUGACAGUGCAGACGGUACAGGAACCUGUCCAGAAUCAGUCUCAGAACACUUAAGAGUCCCUCUGUGUUCAGUAUAUCUGCCAUGAGGCCCCUCAUGUGCCUGUCUCUCUUCAACAGGUUGGGGCUCCUCGAGGCCAAAGAUCAUACCUUAAUCAUCUUUGUAUCCACAGCCCCUCACAGGGUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-167.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -180.17

Frequency: 0.0000

Diversity: 202.75

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(......(((((((.((....(((....))).....)).)))))))....((((.....((((((..((((((...((((((.(((((.((((((((.....))))))))))).))..))))))...))))))....((((((.(((((......((((......(((((((.((((...))))..)))))))......)))).....(((((((((.((((((((.((....((((((((((((((((((((..((((........((((........))))..........((((......................))))...........))))...)))))))..))))).............((((.....))))(((.(((((......((((((........)))))).....))))).)))...............((((((((..(((........))).)))))))).)))))))))).)))).)).....)).)))))))))..((((......)))).((.((((....))))))..)))))))))))((((((...((((...)))))))))).(((((((((((.(((((..(((((...((((((.........)))))))))))..))))).)))...)))).)))).......)))))).......)))).)(((((...)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(,,,,,....||||,,|....(((....))).....,}.,,,,{((({....})))}..{((((,{{,(((((..{((((((,(((((.((((((((.....))))))))))).))}.})))),.{{|,||||{...(((,{,.(((((.{((,,((((,.....(((((((.((((...))))..)))))))....,|))))..}},,|||||....||}...))))).}}},,,,,,,.,,,))),,}))))}||||}}|{({{{{{{{........}}}|,|,.......,,,,...,..,,,.............},,...(({(.(({,{{,{,{{(|,,....,)}})}.}}.,)}.}}}},((((.....)))|{((.(((((......((({((,,.....,)))))).....))))).))}.........,,..,.||{{((((,.{{{......,.)}}.,))))))),))))))}.,|{|..|.||{{{{{||.||}||||||{.((((,,.,..}}}},{{.{{{{....))))))}})})))))))),((((((...((((...)))))))))).{{{{{{{{(((.(((((..(((((...((((((.........)))))))))))..))))).)))...}))).}})).....},,))))))}}}.....))))(((((...)))))