Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0020900
Sequence Length
2159 nt
GC Content
0.4937
GUUUCUAAUAUUCAGGCAAGAGCAGUUGUGUUGUCCUGGGCUCCCCCUGUUGGACUUUCCUGUGGACCCCACAGUGGUCUUUCCUUCCCCUACAGUUACGAGGUGGCCUUAUCAGACAAAGGACGAGAUGGAAAAUACAAGAUAAUUUACAGUGGAGAAGAAUUAGAAUGUAACCUGAAAGAUCUUAGACCAGCAACAGAUUAUCAUGUGAGGGUGUAUGCCAUGUACAAUUCCGUAAAGGGAUCCUGCUCCGAGCCUGUUAGCUUCACCACCCACAGCUGUGCACCCGAGUGUCCUUUCCCCCCUAAGCUGGCACAUAGGAGCAAAAGUUCACUAACCCUGCAGUGGAAGGCACCAAUUGACAACGGUUCAAAAAUCACCAACUACCUUUUAGAGUGGGAUGAGGGAAAAAGAAAUAGUGGUUUCAGACAGUGCUUCUUCGGGAGCCAGAAGCACUGCAAGUUGACAAAGCUUUGUCCGGCAAUGGGGUACACAUUCAGGCUGGCCGCUCGAAACGACAUUGGUACCAGUGGUUAUAGCCAAGAGGUGGUGUGCUACACAUUAGGAAAUAUCCCUCAGAUGCCUUCUGCACCAAGGCUGGUUCGAGCUGGCAUCACAUGGGUCACGUUGCAGUGGAGUAAGCCAGAAGGCUGUUCACCCGAGGAAGUGAUCACCUACACCUUGGAAAUUCAGGAGGAUGAAAAUGAUAACCUUUUCCACCCAAAAUACACUGGAGAGGAUUUAACCUGUACUGUGAAAAAUCUCAAAAGAAGCACACAGUAUAAAUUCAGGCUGACUGCUUCUAAUACGGAAGGAAAAAGCUGUCCAAGCGAAGUUCUUGUUUGUACGACGAGUCCUGACAGGCCUGGACCUCCUACCAGACCGCUUGUCAAAGGCCCAGUUACAUCUCAUGGCUUUAGUGUCAAAUGGGAUCCCCCUAAGGACAAUGGUGGUUCAGAAAUCCUCAAGUACUUGCUAGAGAUUACUGAUGGAAAUUCUGAAGCGAAUCAGUGGGAAGUGGCCUACAGUGGGUCGGCUACCGAAUACACCUUCACCCACUUGAAACCAGGCACUUUGUACAAACUCCGAGCAUGCUGCAUCAGUACCGGCGGACACAGCCAGUGUUCUGAAAGUCUCCCUGUUCGCACACUAAGCAUUGCACCAGGUCAAUGUCGACCACCGAGGGUUUUGGGUAGACCAAAGCACAAAGAAGUCCACUUAGAGUGGGAUGUUCCUGCAUCGGAAAGUGGCUGUGAGGUCUCAGAGUACAGCGUGGAGAUGACGGAGCCCGAAGACGUAGCCUCGGAAGUGUACCAUGGCCCAGAGCUGGAGUGCACCGUCGGCAACCUGCUUCCUGGAACCGUGUAUCGCUUCCGGGUGAGGGCUCUGAAUGAUGGAGGGUAUGGUCCCUAUUCUGAUGUCUCAGAAAUUACCACUGCUGCAGGGCCUCCUGGACAAUGCAAAGCACCUUGUAUUUCUUGUACACCUGAUGGAUGUGUCUUAGUGGGUUGGGAGAGUCCUGAUAGUUCUGGUGCUGACAUCUCAGAGUACAGGUUGGAAUGGGGAGAAGAUGAAGAAUCCUUAGAACUCAUUUAUCAUGGGACAGACACCCGUUUUGAAAUAAGAGACCUGUUGCCUGCUGCACAGUAUUGCUGUAGACUACAGGCCUUCAAUCAAGCAGGGGCAGGGCCGUACAGUGAACUUGUCCUUUGCCAGACGCCAGCGUCUGCCCCUGACCCCGUCUCCACUCUCUGUGUCCUGGAGGAGGAGCCCCUUGAUGCCUACCCUGAUUCACCUUCUGCGUGCCUUGUACUGAACUGGGAAGAGCCGUGCAAUAACGGAUCUGAAAUCCUUGCUUACACCAUUGAUCUAGGAGACACUAGCAUUACCGUGGGCAACACCACCAUGCAUGUUAUGAAAGAUCUCCUUCCAGAAACCACCUACCGGAUCAGAAUUCAGGCUAUAAAUGAAAUUGGAGCUGGACCAUUUAGUCAGUUCAUUAAAGCAAAAACUCGGCCAUUACCACCCUUGCCUCCUAGGCUAGAAUGUGCUGCUGCUGGUCCUCAGAGCCUGAAGCUAAAAUGGGGAGACAGUAACUCCAAGACACAUGCUGCUGAGGACAUUGUGUACACACUACAGCUGGAGGACAGAAACAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-674.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -715.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 512.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((....(((.(((...((((((.((((.(((.((((((((((.....(((((...((((((...)))))).)))))...((((((...((((.(((((((..((((........))))((((((.((....((((.((((((((....(((..((((.((((........))))....))))...))).....)))))))).))))(((((((((.....)))).....(((.(((((.((((.((((.....(((((((..((((((((...((((((.(((.((((((.......((((...(((((.((((((((((....)))).)))..(((((..(((((((.......(((..............))).......)))))))..)))))............(((((....)))))...((((((((((..((...)))))))))))).(((((.....)))))))))))))...))))...))))))..((((((((.(((...)))...)))..))))))))))))))...).))))))).)))).)))...(((....)))....((((((..(((.((((....)))).).))..))))))....(((.((((..(.(((((((..((((....))))......((((((..(((......))).))))))...((((......)))).........((((((((............)))))))).(((((((((((((.(((...........(((((((..((((..........))))..)))))))....(((((((((...(((.....)))....)))))((((((((((..(((((((((((((((((........))))...))))))))((((((.((......))...))))))..((((....(((....)))....)))).(((((.(((((((.((((((.((((((....)))..)))))).)))..))))))).)...((((((((..((((((.((.....)).)))))).(((......))).))))).))).)))))).))))))))))))))))).(((...))).((((((((((.((((((.....))))))....(.((((((....(.(.(((((((((((.((.(((((...(.(((.....))).)(((((((.....))))))).......((.((((((.((((((((...)))))).))...))))))))..(((((((.......((((((((.(((..((((((((.........(((.((((((((...(((((.(((((((.((..(((.......))).)).)))..))))..)))))...)))))))))))..))))))))........((((......)))).((((((....))))))))).)))).))))..)))))))..(((.(((((((......)))))))))).....))))).)).).))).)))))))))..)))))).)..........))))))))))....))).)))))))))))))((((((....((((((((.((....))..)).))))))(((((.......)))))(((((...(((.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))))))...)))))(((((((((((((((...(((((.......)))))...)))...)).)))))))))).))))))))))))))..)))).))))))).))))..))))).)))...)))))......)).))).))))))))))))))....))))))..((((......)))).(((((..(((............(((....((((((((.((((((...(((((.........))))).)))))))).....))))))..)))............)))))))).((((((((..................((((((..(((.((((.((((..(((........(((.............)))......)))..)))).))))))).))))))....))))))))........))))))........)))).))))))))))))).........(((....)))....))).)))...)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((....((((({(...((((({,((({{(((.((((((((((...,.(((((...((((((...)))))).))))}..,((((((...((({,(((((((..((((........))))((((((.((....{(((.((((((((....(((..((((.((((........))))....))))...))).....)))))))).)))|(((((({{{,....}|||.....{||.{((((.((((.(((({(((((.,,.(((({,((((,,.({((,(((.((((((((((,..,.,{(({,...(((((.({,(((((((....)))).))).{(,({({{(((,,,,..}}..}||.,,..}}||,....,{{.{{,.((.{,,...,},))))),},|||||....(((((....))))).,.((((((((((..({...)}))))))))))}{((((.....)))))))))))))...}))),,,}}}}|}.(((((((((((.(..{(.....,.)}..,)))))),.}))))..||||,|||||}||,,,,....}}..,,,)))))).((((((..(({.((((....)))).},))..))))))....))))))))}})..)))).}.))))....)))))......((((((..(((......))).))))))....,,,{{.{{,.{{{,,.......,}}})}|.,},.....{(((.{(((((.....{(((((((((.(((...........(((((((..((((..........))))..)))))))....{((((((({...(((.....)))....))))}(((((((((,.{(((((((((((((((((........))))...))))))),((((((.{(......}}...))))))..((((....(((....)))....)))).,{{((.(((((((.(((((,{((((((....)))..)))))).)))..))))))).),..{{{(((((..{{{{{{,||,,,,,||.||}}}).|{,......,}}.)))))},},..,}))).)))))))))))))}}}).((,.,,}}}.((((((((((,((((((.....)))))),}..{.((((((....,,(.(((((((((({.((.(((((,..,.{{|,,,..}}},|(((((((.....))))))).,.....,{.((((({.{{{{{(((...})}))).))...})))))||,|(({{{{|},.,},.((((((((.{{{..((((((((.........(((.((((((((,,.(((((.(((((((.((..(((.,....,))).)).)))..))))..))))),,.)))))))))))..))))))))........((((......)))).((((((....)))))},}}.)))).)))){{||}}}})}}|{{,{(((({{.,....))))))}}}},},..))))).)).}.))).)))))))}},.)))))).)..........))))))))))....))).)))))))))}||{((((((....((((({{,.{,....,,..)),)))}))(((((.......))))),((((...{{(.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))})))...))))|(((((((((({{(({...{{|,,,,,,,,,})))).,,}))...}),)))))))))).)))))).))),))))))))))..))))).))))..))))).})),.,))))).,,...)).))).))))))))))))))....))))))..((((......)))).(((({..(((............,{{....(((((((,,((((((.,.,((((......}}}),,)).))))))})...,.))))))..,}}............)))))))}.{(((((((..........,,.,....((((((..(((.((((.((((..(((........(({.............)))......)))..)))).))))))).))))))}}},)))))))}.,,.....))))))........)))).))))))}))))))...,.,...{((,...}}},,,,)))))),...)))))).....
Back