Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0023600
Sequence Length
1260 nt
GC Content
0.4944
GGAAAAAGAAAUAGUGGUUUCAGACAGUGCUUCUUCGGGAGCCAGAAGCACUGCAAGUUGACAAAGCUUUGUCCGGCAAUGGGGUACACAUUCAGGCUGGCCGCUCGAAACGACAUUGGUACCAGUGGUUAUAGCCAAGAGGUGGUGUGCUACACAUUAGGAAAUAUCCCUCAGAUGCCUUCUGCACCAAGGCUGGUUCGAGCUGGCAUCACAUGGGUCACGUUGCAGUGGAGUAAGCCAGAAGGCUGUUCACCCGAGGAAGUGAUCACCUACACCUUGGAAAUUCAGGAGGAUGAAAAUGAUAACCUUUUCCACCCAAAAUACACUGGAGAGGAUUUAACCUGUACUGUGAAAAAUCUCAAAAGAAGCACACAGUAUAAAUUCAGGCUGACUGCUUCUAAUACGGAAGGAAAAAGCUGUCCAAGCGAAGUUCUUGUUUGUACGACGAGUCCUGACAGGCCUGGACCUCCUACCAGACCGCUUGUCAAAGGCCCAGUUACAUCUCAUGGCUUUAGUGUCAAAUGGGAUCCCCCUAAGGACAAUGGUGGUUCAGAAAUCCUCAAGUACUUGCUAGAGAUUACUGAUGGAAAUUCUGAAGCGAAUCAGUGGGAAGUGGCCUACAGUGGGUCGGCUACCGAAUACACCUUCACCCACUUGAAACCAGGCACUUUGUACAAACUCCGAGCAUGCUGCAUCAGUACCGGCGGACACAGCCAGUGUUCUGAAAGUCUCCCUGUUCGCACACUAAGCAUUGCACCAGGUCAAUGUCGACCACCGAGGGUUUUGGGUAGACCAAAGCACAAAGAAGUCCACUUAGAGUGGGAUGUUCCUGCAUCGGAAAGUGGCUGUGAGGUCUCAGAGUACAGCGUGGAGAUGACGGAGCCCGAAGACGUAGCCUCGGAAGUGUACCAUGGCCCAGAGCUGGAGUGCACCGUCGGCAACCUGCUUCCUGGAACCGUGUAUCGCUUCCGGGUGAGGGCUCUGAAUGAUGGAGGGUAUGGUCCCUAUUCUGAUGUCUCAGAAAUUACCACUGCUGCAGGGCCUCCUGGACAAUGCAAAGCACCUUGUAUUUCUUGUACACCUGAUGGAUGUGUCUUAGUGGGUUGGGAGAGUCCUGAUAGUUCUGGUGCUGACAUCUCAGAGUACAGGUUGGAAUGGGGAGAAGAUGAAGAAUCCUUAGAACUCAUUUAUCAUGGGACAGACACCCGUUUUGAAAUAAGAGACCUGUUGCCUGCUGCACAGUAUUGCUGUAGACUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-408.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -431.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 244.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(......(((((....))))).......(((((((((((.........((((((((..((((..(((((...(((((..((((((((((.(((.(((((((((((.(..((.......))..)))))))..)))))..)))...)))))))........(((....)))..((((.....))))..)))..)))))...)))))............))))..))))))))(((..((((....)))).))).)))))))))))..((((((....(((((....)))))))).)))..........((((((((............)))))))).(((((((((((((.(((...........(((((((..((((..........))))..)))))))....(((((((((...(((.....)))....)))))((((((((((..(((((((((((((((((........))))...))))))))((((((.((......))...))))))..((((....(((....)))....)))).(((((.(((((((.((((((.((((((....)))..)))))).)))..))))))).)...((((((((..((((((.((.....)).)))))).(((......))).))))).))).)))))).))))))))))))))))).(((...))).((((((((((.((((((.....))))))....(.((((((....(.(.(((((((((((.((.(((((...(.(((.....))).)(((((((.....))))))).......((.((((((.((((((((...)))))).))...))))))))..(((((((.......((((((((.(((..((((((((.........(((.((((((((...(((((.(((((((.((..(((.......))).)).)))..))))..)))))...)))))))))))..))))))))........((((......)))).((((((....))))))))).)))).))))..)))))))..(((.(((((((......)))))))))).....))))).)).).))).)))))))))..)))))).)..........))))))))))....))).))))))))))))).((((((............))))))...(((.((((..(((((.......)))))..))))....))).)((((.(.((((.(((......))).)))).).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(......{{{{{....|||}}.,.,..{(((((((((((.........((((((((..((((...{{{...,{,|}},,(({(((((((,{((.(((((((((((.(..{(.......))..,)))))),.}))))..)}},,,})))))}.,.,,,,.|{,....}})|,,.((((((..(({.((((....)))).},))..))))))....,,))))..))))))))(({..((((....)))).))).))))))))))),.{(({{{...{(((({....}))))))).))}..,{{{,...((((((((............)))))))).{((((((((((((.(((...........(((((((..((((..........))))..)))))))....{((((((({...(((.....)))....))))}(((((((((,.{(((((((((((((((((........))))...))))))),((((((.{(......}}...))))))..((((....(((....)))....)))).,{{((.(((((((.(((((,{((((((....)))..)))))).)))..))))))).)...{{{(((((..{{{{||,||.,,,,||.||}}}).{{,......,}}.)))))},},.,,}))).)))))))))))))}))).((,...})).((((((((((,((((((.....)))))),,..{.((((((....,.(.(((((((((({.((.(((((,..,.{{{,,,..}}},|(((((((.....))))))).,.....{{.((((({.((((((((...}))))).))...})))))||.,(({{{{|},.,,,.((((((((.{{{..((((((((.........(((.((((((((,,.(((((.(((((((.((..(((.,....,))).)).)))..))))..))))),,.)))))))))))..))))))))........((((......)))).((((((....))))))}}}.)))).)))){{||}}}})}}|{{,{((((({.,....))))))}}}},},..))))).)).}.))).)))))))}}..)))))).)..........))))))))))....))).))))))))))))},(((({{.,.,,,.....,))))),...||}}||||,,||(((.......))))},,}}},....},,.)((((.{.((((.(((......))).)))).).))))
Back