Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_FNDC3B_0025500

Sequence Length

545 nt

GC Content

0.5009

UAUGGUCCCUAUUCUGAUGUCUCAGAAAUUACCACUGCUGCAGGGCCUCCUGGACAAUGCAAAGCACCUUGUAUUUCUUGUACACCUGAUGGAUGUGUCUUAGUGGGUUGGGAGAGUCCUGAUAGUUCUGGUGCUGACAUCUCAGAGUACAGGUUGGAAUGGGGAGAAGAUGAAGAAUCCUUAGAACUCAUUUAUCAUGGGACAGACACCCGUUUUGAAAUAAGAGACCUGUUGCCUGCUGCACAGUAUUGCUGUAGACUACAGGCCUUCAAUCAAGCAGGGGCAGGGCCGUACAGUGAACUUGUCCUUUGCCAGACGCCAGCGUCUGCCCCUGACCCCGUCUCCACUCUCUGUGUCCUGGAGGAGGAGCCCCUUGAUGCCUACCCUGAUUCACCUUCUGCGUGCCUUGUACUGAACUGGGAAGAGCCGUGCAAUAACGGAUCUGAAAUCCUUGCUUACACCAUUGAUCUAGGAGACACUAGCAUUACCGUGGGCAACACCACCAUGCAUGUUAUGAAAGAUCUCCUUCCAGAAACCACCUACCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-153.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -165.47

Frequency: 0.0000

Diversity: 152.15

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((....(((((((.((.((((....(((((..((((((((((((((..(((..(((.((((((..(((((.....)))))((....))..))).))).))).))).)))).)))))).))))..))))))))).)).)))))))(((((.((((((((((....((((((((.((....))..)).))))))(((((.......)))))(((((...(((.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))))))...)))))(((((((((((((((...(((((.......)))))...)))...)).)))))))))).)))))).))))...)))))...((((((((((.........((((...(((.(.((((........((((...))))))))).))).(((.((((......)))).))).......((((((((.....((((((((......)))).))))..)))))))).........))))...........))))).))))).....))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

...(((....{((((((.{{.((((....(((((..((((((((((((((({({{,{((({(,{{{{.,|||||,....}}|||((....))..))).}},.,}}.})}))))).)))))).))))..))))))))).}}.)))))}}|((((.((((((((((...,(((((({,.,,....,,..)),)))}))(((((.......))))){((((...{{(.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))})))...))))|((((((((((({(({...({{{,.,,,,.,}))))..,)))...}),)))))))))).)))))).))))..,})))},..((((((((({.{,....,,,.||,..,,,.{.{{{{.....,{{((({..,||},,},}}.|||,(((.((((......)))).)))....}}}|,{,{{{{.....{||{{{((,.....}}}),}}}}..||||},,...,,,},}})}}}},,,,}.....,))))}}))))...,.)}}.....