Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0025600
Sequence Length
1382 nt
GC Content
0.4783
UAUGGUCCCUAUUCUGAUGUCUCAGAAAUUACCACUGCUGCAGGGCCUCCUGGACAAUGCAAAGCACCUUGUAUUUCUUGUACACCUGAUGGAUGUGUCUUAGUGGGUUGGGAGAGUCCUGAUAGUUCUGGUGCUGACAUCUCAGAGUACAGGUUGGAAUGGGGAGAAGAUGAAGAAUCCUUAGAACUCAUUUAUCAUGGGACAGACACCCGUUUUGAAAUAAGAGACCUGUUGCCUGCUGCACAGUAUUGCUGUAGACUACAGGCCUUCAAUCAAGCAGGGGCAGGGCCGUACAGUGAACUUGUCCUUUGCCAGACGCCAGCGUCUGCCCCUGACCCCGUCUCCACUCUCUGUGUCCUGGAGGAGGAGCCCCUUGAUGCCUACCCUGAUUCACCUUCUGCGUGCCUUGUACUGAACUGGGAAGAGCCGUGCAAUAACGGAUCUGAAAUCCUUGCUUACACCAUUGAUCUAGGAGACACUAGCAUUACCGUGGGCAACACCACCAUGCAUGUUAUGAAAGAUCUCCUUCCAGAAACCACCUACCGGAUCAGAAUUCAGGCUAUAAAUGAAAUUGGAGCUGGACCAUUUAGUCAGUUCAUUAAAGCAAAAACUCGGCCAUUACCACCCUUGCCUCCUAGGCUAGAAUGUGCUGCUGCUGGUCCUCAGAGCCUGAAGCUAAAAUGGGGAGACAGUAACUCCAAGACACAUGCUGCUGAGGACAUUGUGUACACACUACAGCUGGAGGACAGAAACAAGAGGUUUAUUUCAAUCUACAGAGGACCCAGCCACACCUACAAGGUCCAGAGACUGACGGAAUUCACAUGCUACUCCUUCAGAAUCCAGGCAGCAAGCGAGGCUGGAGAAGGGCCCUUCUCAGAAACCUAUACCUUCAGCACAACCAAAAGUGUCCCCCCCACCAUCAAAGCACCUCGAGUAACACAGUUAGAAGGAAAUUCAUGUGAAAUUUUAUGGGAGACGGUACCAUCAAUGAAAGGUGACCCUGUUAACUACAUUCUGCAGGUAUUGGUUGGAAGAGAAUCUGAGUACAAACAGGUGUACAAGGGAGAAGAAGCCACAUUCCAAAUCUCAGGCCUCCAGACCAACACAGACUACAGGUUCCGCGUAUGUGCGUGUCGUCGCUGUUUAGACACCUCUCAGGAGCUAAGCGGAGCCUUCAGCCCCUCUGCGGCUUUUGUAUUACAACGAAGUGAGGUCAUGCUUACAGGGGACAUGGGGAGCUUAGAUGAUCCCAAAAUGAAGAGCAUGAUGCCUACUGAUGAACAGUUUGCAGCCAUCAUUGUGCUUGGCUUUGCAACUUUGUCCAUUUUAUUUGCCUUUAUAUUACAGUACUUCUUAAUGAAGUAAACCCAACAAAACUAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-387.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -413.72
Frequency: 0.0000
Diversity: 365.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.....((((((....))))))...)))).))(((((((......(((((((((((((((.(((((((...((((((((((((.....((((.(((((((((..((((.(.(..((...(((...(((((((......((.(((.(((((....(((((((..((((((((.((....))..)).))))))(((((.......)))))(((((...(((.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).).)))))))))...)))))(((((((((((((((...(((((.......)))))...)))...)).))))))))))..(((.((((((.(((((((..(((((((((((((.......(((......(((..(((..(((((.(.((((((((.((..(((((.(((.((((......)))).))).......((((((.......((((((((((((((.((((((...(((((.........))))).)))))))).....)))))).................))))))...((((.........))))....((((((.((......))))))))....))))))......((......))((((((((((((..((((..(.((((.(((.....(((((((((((.((...((....(((((.........)))))))...)).))).)))))))).....))))))).)..))))))))).......)))).)))....(((........)))..)))))...))..))))))))))))))..))))))......)))....)))))))....))))))..)))...)))).)))))).)))..)))))))..))))).)))))))))))))))))..).).)))).))))(((((((...((((..((......((((((.(((....((((.(...(((..((((.........)))).)))...).)))).))).)))))).....))..)))).)))).)))........)))))))))..))))))))))))((((.....(((...............))))))).((((..(((.......(((((((((........(((((...........)))))(((....)))....)))))))))..((((.......))))(((((......)))))))).)))).....)))))))......((((.(......).))))........(((((((((((..((((.....))))..))).......)))))))).))))))))...))))))).....))))).............((((((.....))))))................))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,{((({{{((((((((.({.((((....(((((..((((((((((((((({((({{((({({{{,,.,|||||,....|||||((....)}.,})},||,.}}},}}}))))).)))))).))))..))))))))).}}.)))))))}.,|{.((((((((((....(((((({,.,,....,,..)),)))}))(((((.......))))}{((((...{((.(.(((((.(.((((.(((......))).)))).}.)))))})))...))))|((((((((((({(({...({{{,.,,,,,,}}}))..,}))...}),)))))))))).)))))).)))).,,{((((((.(((((((..({(.((((((((((((....,{(((({((((((.((.(((((((.(((..(((({.(((.((((......)))).))).,..,,,((((({......,(((((((((((((,,((((((.,.,((((......}}}),,)).))))))})...,.)))))).................))))))}..{{{{.,,......||}}.,,.((((({{((......))))))))....})))},......((......)},,,{((((((((..((((..,.((((.(((.....(((((((((((.((...((....(((((.........)))))))...)).))).))))))))...,,))))))).}..))))))))).,},...}}}}.})},....,,..,|,.....(((((..,.........,..))))).,},.((((.(((.............))).))))..})))).)))...))))))))).))))))...,(((({...((((.((((((.((({{{........|||{{,{.,,,,...,.....,,({{..,,(,,{...}}}}..,}}...,||.,}))........,))).|}}((({((.,........)))},}).|{|.....}},..))).)))))).)))),,,,)}))}.,})))).,,...)))))).)))))).,..{{{......))).....}))...)))))))....)))))))...,({((((({(,{,...{{(((,(.,{,,,.....|}},}{,,.,|,}|}}|,.))}|||}}}..{({{...,,}.))))|{(((......))}})||||{}.},,,)}))).}))))).}}((((.(......).))))...{(((((.(((.{{{{......((((.{{((,{((((((((.,,...,,..))))}.}))))..)))),))}}.,}},))))))))).......((((((.....)))))).................}
Back