Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0026400
Sequence Length
661 nt
GC Content
0.5083
GCCUUCAAUCAAGCAGGGGCAGGGCCGUACAGUGAACUUGUCCUUUGCCAGACGCCAGCGUCUGCCCCUGACCCCGUCUCCACUCUCUGUGUCCUGGAGGAGGAGCCCCUUGAUGCCUACCCUGAUUCACCUUCUGCGUGCCUUGUACUGAACUGGGAAGAGCCGUGCAAUAACGGAUCUGAAAUCCUUGCUUACACCAUUGAUCUAGGAGACACUAGCAUUACCGUGGGCAACACCACCAUGCAUGUUAUGAAAGAUCUCCUUCCAGAAACCACCUACCGGAUCAGAAUUCAGGCUAUAAAUGAAAUUGGAGCUGGACCAUUUAGUCAGUUCAUUAAAGCAAAAACUCGGCCAUUACCACCCUUGCCUCCUAGGCUAGAAUGUGCUGCUGCUGGUCCUCAGAGCCUGAAGCUAAAAUGGGGAGACAGUAACUCCAAGACACAUGCUGCUGAGGACAUUGUGUACACACUACAGCUGGAGGACAGAAACAAGAGGUUUAUUUCAAUCUACAGAGGACCCAGCCACACCUACAAGGUCCAGAGACUGACGGAAUUCACAUGCUACUCCUUCAGAAUCCAGGCAGCAAGCGAGGCUGGAGAAGGGCCCUUCUCAGAAACCUAUACCUUCAGCACAACCAAAAGUGUCCCCCCCACCAUCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-174.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -187.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 161.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.........(((((((((..(((.((.((.....)))).)))((((((....)))))).))))).))))..(((((............))))))))).))(..((((((......((((....((((((.((.(((((((.(((..((((..(((.((((......)))).))).......((((((.......((((((((((((((.((((((...(((((.........))))).)))))))).....)))))).................))))))...((((.........))))....((((((.((......))))))))....))))))......((......))((((((((((((..((((..(.((((.(((.....(((((((((((.((...((....(((((.........)))))))...)).))).)))))))).....))))))).)..))))))))).......)))).))).................(((((...............))))).....((((.(((.............))).))))...)))).)))...))))))))).)))))).......))))...............((((........)))).........)))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...........{((((((((((({{({...({{{,.,,,,,,}}})),{{|||...,)}))))}))))).,|{{.{(((((,{{,,,{{|.,{(((((({({(({{,{{((.(({{{...,,(,.((,..(((((.{.((((((((.((..(((((.(((.((((......)))).)))....{{{((({({......,(((((((((((((,,((((((.,.,((((......}}}),,)).))))))})...,.)))))).................))))))}..,{{{,,,......||}|.,,.(((((({((......))))))))....,)))},......((......}},,{{((((((((..((((..,.((((.(((.....(((((((((((.((...((....(((((.........)))))))...)).))).))))))))...,,))))))).}..))))))))).,,,...}}}}.})},....,,..,,,...}})},)))))...}}..))))))))})))))..|||.||{...,.,,.....,))),))}}..))})))}},))}).)}))})}||||{|},..}}}}}}.|...........,,,.((((........))))........}{......)
Back