Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FNDC3B_0026500
Sequence Length
494 nt
GC Content
0.5081
GCCUUCAAUCAAGCAGGGGCAGGGCCGUACAGUGAACUUGUCCUUUGCCAGACGCCAGCGUCUGCCCCUGACCCCGUCUCCACUCUCUGUGUCCUGGAGGAGGAGCCCCUUGAUGCCUACCCUGAUUCACCUUCUGCGUGCCUUGUACUGAACUGGGAAGAGCCGUGCAAUAACGGAUCUGAAAUCCUUGCUUACACCAUUGAUCUAGGAGACACUAGCAUUACCGUGGGCAACACCACCAUGCAUGUUAUGAAAGAUCUCCUUCCAGAAACCACCUACCGGAUCAGAAUUCAGGCUAUAAAUGAAAUUGGAGCUGGACCAUUUAGUCAGUUCAUUAAAGCAAAAACUCGGCCAUUACCACCCUUGCCUCCUAGGCUAGAAUGUGCUGCUGCUGGUCCUCAGAGCCUGAAGCUAAAAUGGGGAGACAGUAACUCCAAGACACAUGCUGCUGAGGACAUUGUGUACACACUACAGCUGGAGGACAGAAACAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-130.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -140.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....(((((((((((((((((((((...(((((.......)))))...)))...)).))))))))))...((.((((((............)))))).)).....))))))))((....((.(((.(((((.((..((((.((.((((.((((..(((.((((......)))).))).......................(((((((((((.((((((...(((((.........))))).)))))))).....))))))...))).........)))).)))).))..))))..............((((((.((......)))))))).....((((......((((((((......((.((((...)))).)))))).)))).)))).(((((((((((.((...((....(((((.........)))))))...)).))).))))))))...(((....)))....)).)))))...))).))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....{(((((((((((((((({{((...({({,....,..}}})),,,|||...,),)))))))))).,.{{.{(((((,.,.....,...}))))).)).}...}))))}{{((...(((((((...,{{.{,((((...|}}|,||.{,(({{(((.((((......)))).)))....||,,,|..........,|,{{,(((((((,,((((((.,.,((((......}}}),,)).))))))})...,.))))))..,}}............))))))).....))))......,{....,.(((((((({......))))))))......,,........||}{.,,......,(,((((((..((((.,,.((((.(((.,,..(((((((((((.((...((....(((((.........)))))))...)).))).))))))))...,,))))))).}..))))))))).}))...,,,},)
Back