Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FOXO3_0000300
Sequence Length
634 nt
GC Content
0.3565
AUCAGAAUCUAAAUCAGUGGUUCUCAGCCCUGGUUGCAUGUUUGAAUUACCUGGGAACUUCUGAAAAAUACAAAUACCCAGAGAAUUUGAUAUAAUUUGGCUUGUGUGUGGCUUAGCAUUGAUGGUUUUGUGUUUUGUUUUUUUUUUUCAAGUUUCUUAGGUGAUUCUAAUGUAUAGUUAGGAUGAAGUUUUCUGAUCUAGUUCAACCCUCUUAUUUUACUGGUGAAAAACCUGAUUUUUGGAAAAGCUAAUGACUUUCUUAAGAUCACACAGCUAGUUAGUAGAGAGGUAAUUAGUAGCCACAGUUCUAGAGGUUUUUGUUUUCCAUUUUCUUCUUUAAAUUGAUCUUUUUUAAAAGGUCAUUUGCUAGGUAAUGGAUAGUCUCACAUAAGUAGCGCUUGCUUUCCUGAAAGGCUUAUUUGCCUCUCAAUCUAAAAACAUCUUGCUUAUUAUUUCAGCAUCAAAAGGAUGGGCAAAUGUAGAUGGAGGCUGAGUGAGUGUAUCAUGUUUGCAUAGCUGUCCAGUGCCUGUCAGUAGGGGUACUUAGGAACUAUGAAGUGAUAAAAGAGGUAAGAAGGAUAGCAUUUUAACAAAAAGAGGAAGCCCUUGGUUACUUACAUUUGUCAGAUACUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-157.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -171.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 157.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.((((.((((((.((((...))))))))))((((....(((((((((((((((((..((((((.(((((.((.(((((...(((((.......((((.......))))....)))))...))))).))))))).))))))....))).))))))))))))))..)))).(((((((((.......)))))).))).......((((((.....((((((........(((((((.(((((..(....)..))))).)))))))....)))))).....)))))).....((((((((.......((.((((((((((.(((.(((((((((((....((((((((....))))))))...((((....(((((.....)).)))...))))((((((...(.(((.(.((((((((((((((..((((....((((.(((((((((.(((........))).))))))))))))))))))))))).)))))))).).))).)...))).)))..((((((((((........)))))))..)))(((....)))....))))))).)))).))).))))...............))))))))))))))))..........)))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{(,{{(,((,{(((((.((({...}))))))))|((((....((((((((((((((((,.,((((((.((({{,{,,(((({,{{,....,,..},,||{{..,,,,,}||,.|||||.||.,,}))}))))),})),,,,,)))}}}))))))))))))))))))..)))),}}|||,,||}{.{{{.,||||||.,|,,...,,(((((({{{..((((((........(((((((.(((((..(....)..))))).)))))))....)))))).}}}})))}))}....((((((((.....,,,,.{((({{((((.(((.(((((((((((.{{.((((((((....)))))))).}}((((....{{(({.....}}.}}}...)))}{({{{(...{.{{{.{.((((((((((((({,.((((,...{(((.(((((((((.(((........))).))))))))))))))))))))))).)))))))).},})|.,...}||,|}}..((((((((((......,.)))))))..))),||,,,.,)),},,))))))).)))).))).))))....,,,......,|}}}}}})})))))))).......}}}))),})),,
Back