Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FOXO3_0000900
Sequence Length
661 nt
GC Content
0.4750
GGGUCCUGAAGAGCCACUUUACCUUUUUGGUGCUAUAAAAGGAGCUGGGGAUCAUAAAUGCAAAGACGAGUUGAUAUCAGUGGAUGUUACAGCUGGUAUACAUACUUCAACUCUGCUAAGAAGUUGCUGGGAAGUGGCAAAUUUGAUGUGGGGCAUGGCUUGGAGCUAGCCUUUAACUCUCUGCAGAUCAUUUUGAGCUUGCUUUGGAGAUGCAAAACCACCGUACCAUGGCUCCUGUGGAUUGGGUCUGUUUGGGAGAAGCUUUGGUUUUCCAAGCUCCACCUGGAUUAGAUAGAGCACAUCUUUGGCCCUGGACUGAUCUGGGAUCCCCAGUUCUGUCUCCCAGGGCCUGAUGUAGAUCUGGCCUUCCUCUGGAGUGGAUGUGGAGCCUUGAUGCCACUGACUCAUCUGUAUUACUUGUUGCCUAAAACUCAGAACUAAAAGAGAUCUUAAAGAUCAUCUAACUACCUUAUUUUGCAGUGCCUCAGUUACUACUAUGGAAUAACAUAAUAAGCGAAGAGGAUGACUUCUCUGCUGGGCUGUGGUUCUUCUAGUAAUUCCGCUACUCCUGGGUCAUUGCCUGGGGUGAGGAGGCCAGGUUAUCUUCUGGAGGCUCACCACACCUUGGUGUCCAGAUGUGCCCUAGGACUGCAGUGGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-211.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -224.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 176.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(..((((((((((..((((.....))))(((((..((..(((((((..(((...((((((...((((((((((((((.(......).)))))))........))))))).((.((.(((((((((((.(((((((........(((((((.(((((...))))))))......(((((((((.(((...)))..))))...))))).......)))).....((.((((((...((((...))))((((((((((........))))))))))((((((((((..((.((((.((((((...((((((((((.((.(((((...))))).)).))...)))))))).))))).).))))..))...))))).)))))...)))))).)).)))))))..))))...)))..)))).))))..................((((((((...))))).)))...........))))))))))))))))..))..)))))............((((.(((((....))))).)))).....))))))))))..)...(((((((.((((((((.(((...((((((((((....(((((......)))))...))))))((((....))))))))..))).)))))))..).)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,...|,,((((((((((..{(((.....)))}{{{{{..((.,(((((((..(,,...(((((({..((((((((((((({,|..,...},}))}))}|.,,..,,}{{||{{{.,..}}|||||},((((.(((((((.,,,{{{{,(((({{.{((((,,,||}}||||,....{((((,(((({((,..,|||,,||||..,||,}},,.....,,,,,}}.|||.|||{{{.,,|||...}))))||,,|||||,,,,...}})}})))))))|{{,||||{|,,||,|(((.,(((((...((((((((((.((.(((((...))))).)).)),..}))))))).))))).,.)))|,||||||}}}}}.)}))).,,))}))).,,.)))))))..)))),|||}},,,,,,,}},.......,.}}},......((((((((...))))).)))..........,)))))))},))))))),.))..||||}.....,,,,...((({.(((((....})))),)))).....))))))))))..}...{((((((.{(((((((.(((...((((((((((....(((((......)))))...))))))((((....))))))))..))).)))))))..,.))))))}.,
Back