Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FOXO3_0002100
Sequence Length
621 nt
GC Content
0.3833
CUAAACUGUAUGAAAAAUCAAGACUUAAAAAAGGUAAAUGGAGGCAGUUGCACAAUUACAUUUGUUUAAUGAGCUUUUACAUUUUAAAACUUUUAAUUAAUGUUAUACUAUUUCAGAAAUUCAACUGUAGUUAUAAAAUUAUAAAGAAUGCAUUUGUUAUUUAAAGUGAGAUAUGCGUGCAGACACACAGACCAUGGUCUUCCCUUCUUCCUCUGGUCUACUGCUUCUGCCUUAUAUCCCCUAGAUUCCUUCUCACUCCCCAAAAGGCAGAGGUUAAGAAGAAAGUUAAAAUAUCAAGACACACUAAACUGUUUUUGUGGUGAGUCAAGCUGCAGUGCCUCGCUGACUGGGAAACAAUGGGCUGGGCCUCCUAGAAUAUAGUAGGCUGGAGAAACAGAAAAUACAGCUUGACUGGGCCUUGCCCUCUCACUCCAAGCCUCAACAGGAUGCUAGAGCUUUAGCAUGCUUUCUGCUGUGCUGGGAUUAUUUUCUGCAACUAGACAAAAAACCCACAAAACUCCACAUGGUUUGUUCUCAAGCAACUGGAAUAUGGAAAGGCUUGAAGGAAUACUUACACUUUUUGAUGGAAGGUAAUGACCUUAGUUCUUCAGUAUUUAUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-138.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -151.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 189.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((..(((((......(((((((.((((((((((((((((.((((.((((......)))).))))..)))))..)))))....))))))..)))).)))......)))))......))....)))(((..((((..(.((((((((((.(.(((((...))))).).))))((((((......((((((.((............))..))))))...(((((((((((.........(((.....)))..........))))))))))).....(((((((......................(((((((((.((((((((((((((.((.((((.(((.(.((.....)).).))).))))))((((........))))(((......)))......))))))))))((((...))))...)))).))))....))))).(((((((....)))))))))))))).))))))((((.((.((.((((....)))).)).)).))))......((((....(((((....)))))...)))).(((.((((((..(((((.....))).)))))))).))).(((((....))))).)))))).)..))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,...,{{,,((({...,.,,{({({,,.{((({{(({(((((((.((((.((((......)))).))))..))))),.}}}}}....,}||||..,|||{,||{{{{{{|..|{{.....,..,}})))||}}}},}))),,.,|,{{((((.(.(((({...})))).).))))||{....,,}||((((((,((,,,.........}}..}}}|||.,,(((((((((((.........(((.....)))..........)))))))))))..}},|}},}},.........|||||,,{,.....,}}|||{|||||,{((({(({((,((.((((.(((.(.((.....)).).))).))))}|((((,...,,,,||||(((,,,...}}}......))))))}}}}((((...))))..||,||,|{{|{{{....((.(((((({....})))))).)}..,}}}}}||}||||}....,.{|||,,.,)})),,.....})))}},,,.{{{{,,,,|||||,...}})))...}}}}...|,|..}}))))){|||....,||{{.|||||,.,.}}|||||,,..))))),}})))),,,},))),,,})
Back