Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FOXO3_0003700
Sequence Length
868 nt
GC Content
0.4551
GAAGAGUGGUGUCUCACCAUUGAGUUUUUUGUUUGGUGGAUGCCUCUUUUCCAGGUCCAGUUGCUGAAUCCAGGACAUGGAGUGGAGACAGGGAGUGGGUAGGAGGUGCCAUCAAAGUUCUAAGCAAGUUCAGCAGUGUUGAAAGAAUUUAAACCCACUCUGCAGCCGGGUUAUAGCUAGACAGUACUCUACCCUGGGAUAGUGUGGAGAGGACAUCCUUUCCCAUUAGGCACUGACAGCCCAAGACAAAAAAUGGGAAGAAUCUUGGGUGGGUGAAAACACUUUACACAAUAAGUUCUUGGUGGUCUCCUGACCUCUAGGGACCUCUGAACUUCUGGAGUUAAGAUGAAGGCAUGGACAGUCUUUUUUUGCGAAGUGUCAUGUAGCAACAGAGUUUGGGCUUUAGAAUCUGACAGACCUGGGCUCUAGGGAAACCUCCUUAGGAGCUUACUGGCUGAAAUCGAGCAAGUUCUGUAACCUCUCUCUGCCUCCAUUUUUCACAGGUAAAUCCUAGUCGAGGAUUAAGUUGAAGCUAUGUAUAUUAAGUGCUUAGCAUAGUUCCUAGCAAAAAGUAAAUUUAAAAUGAUCUGUUACUAUUAGUGGUGGUGGCGGUGUGGUGAUCACCAGCAACAGUCAGAGGGUGGUGGACCAAGGAGGAAGCAGACAGCAUUCUUAAGAGAGAUGGAAAUUGCCCUCUACAUUAUAGAGGACCCAUCUGAGACCAUCUCCCAGUUCAGUUCUGUAGGAAAGGCAGGUAAGAUUGAGAAUAAGGGUUGUGUAAUUUUCGGGUGCCUUCUUCCUCUGGGGCUCUUAAGAUCUGAGCACAGUGGAUUCAAGUAAGGUAAGGAAAGACUACCAGUAGGGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-267.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -283.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 323.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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