Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_FOXO3_0004600
Sequence Length
1981 nt
GC Content
0.4124
GUGAUCUAUCCCCGCUUGGCCUCCCAAAGUGCUAAGAUUACAGGUGUGAGCCACCGUGCCUGGCCAACAUUGGUUUGUAUGGUAUCCACUGUCCUCUUUAGAAUGAAUGUGAUCAUGGCCACUUUACUAAAGAAAGACAAGUAAGUCCUAUAGAAUAAGCUCAUACUUUGAGGUUUCCUCUUCUGAAAGACUUUUUUUUGUUUGCUUUUUGGGGUUUUUGUGUUUUUUUGUUUGUUUGUUUUUUGAGAUAGGGCUGUGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGAUGAAAUCACAGCUCACUGCAGCCUCAGCCUCCCAGGCACAAGUGAUCCUCCCACCUCAGCCUCCCCAGUAGCUGUGACUAUAGGUACAUGCCACCACACCUAGCUAAUUUUUGUAUUUUUUGUAGAGACAGGGUUUUGCCAUGUUGCCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGAGCUCAAGCGAUCCGUCUGCCUCAGUGUCCCAAAGUACUGGAAUUAUAGGCGUCAGGCACUGUGCCUGGCUCAGACUUUGUUUUUAAAAUCUUAAAAAAAAAUUUUUUUUUAGGAAGGGCCCACCAAAUACCCGUAACUAUUUCAUAAACAAAUUAAAAUAGUAAGAUUGUGCUUUUAUAUUCCUAUUCUUUCUUAAAUGUGAAAUGAUUCUUUAGAUAAUCUGUUUAACUGUUAGCCCAAGUAGAUUAAAUGGUGACUUCUGCAUAAUUUGGUAAGAGGCCUAUAUGAAAGGUUGUAGAAAAAGCAGUGCAUUGGAGUUUAGGAAACCCAGUGUCAGUUUUGGCUCUUGUGAACAGUAGCUGUGGGACCUUGCAUUAAGUUAUUUAAUAUCUCUCAGCCUGAGUCUUCUUAUAUAAAAUUAGGGCACUGACAUACUAAUUCUUGCAGGUUUAUUAUGAGGAUUAGAGACGAUGAAUCUAAAACACUCUGGCUCAGUAACUGACAGUGCUGUAAUCUGGCAGGCACUGUCAUCCUUGCAAUUAGGGGACCUGGGUGGGUGGGCAGUCUCCAUUGUCCUUUCCCACCCGAACACCCUGUGGUUAUGGCCCUGGAUGUGGGUGUUCCAGCCCCUUUUUACCACAUGCCCUUGUAGAAGCUUAAUAUCUGUGUCCAGAUUUUAACCCUGUGUAGCUUUUAAUUUUAUAAAACUAUACGCAUACGUUGUUGGAGGUUAGAAUUGUGAUAGAUGGCCAUCAGAAAAUUUAUGUGGGGCAUUUUGCAGUUCUAUAAGAUGUUUCACACUUUUUCUCAGUUGGGUUGGAAUUGGUGAUGCUAAAGUACAUUUUAAAAUAUUGUUCCCUAAAUGCUUUUUAAGGGGGUAUAGCUGAAUACUUGACUGGUCAUUCUAGUUAAUUCUGUGUGUUGGUGUGAUCUCCUUCCAGAAUCUAACGCAGAGGGGGCUGGACAGAGUGGGAGUACUUAGGGUAGGUGUCCACAUUUCCAUUUAGCCUCGGGACCUCCGUGUUUUUUCACUUAGAAGCUUGAGUUUGUUUUUAUUUAAUAUAUCUAGUGACCUGAAUUGUAGAUCCACCUGUACUUGCCUGCUUUCUGAACACUGCAGAGUACAUGUUGAGAGCAUGCUUCAUACCUAUUGCAUAGAGAAAUUGUUUUACUUUUUAAAGAAGUGUACUAUCCGGACCAUUAGUAGAGAUGCCAUUAUUCUUUUUAAAAACCGUAAAAGGAAUCAGGAUAUAUAGUCUCCUGGGCAACAUUUGCCUUAUCAGAUACUCAGCAUGUUGCUUAUGUUCUUCUCUCAAACGCAGUUGUAGAAAUGCCAACUUAUGACCCAUGAUUGCUAAUGCUUAUUGCCUAUCCUGAACUACAGGCCCUUCCUACAUGUGAAGCAUAGUAUUUUGGAUUAUUUACUAAUGGUAAAAUCCUGCUGACAUUCUGUGUUUUUAAAACAUUCUGGGCUGGGCGUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUGGGUGGGGAGGCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-577.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -619.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 591.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(........)..(((((((((((.(((((((..((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((.((.((((......((((.(((((((..((((.(((........))))))))))))))..)))).(((.(((((((((....((((...(((..((((((...((....)).((((........)))).......(((((((((((((((.....................((((((((...))))))))((..((((((.((((.(((..((....))..))))))).))))))..)).....))))))))).))))))........))))))...)))))))....))))))).)).))).)))).))..)))))))............(((..((.((((((((((((((((((((((((..((.((.....((((((((((.((((.....(((((...((((((..((((((..((((.((((((.((((((((...)))))))).(((((((.((((((((..(((((((((((....))))))))))).((((((.....((((((...(((((((.............))))))).(((.((((((((..((((((.(((((..(((((.((.((((.........(((((.(((((..((((((..((((..(((((((...(((((.((((((((..((.((((((((((((((((........)))))..(((((.(.(((((((.((((...)))))))))))).)))))((((.(((....))).)))).((((((((((((((...((((.(((.....((((...)))).....))).))))...((((((..((((.(((......(((((((.......((((..((((((.................)))))))))).....((((((((((((......))).)))))))))..)))))))..((((....((((((((.(((((((....)))))))...))))))))....)))))))))))..)))))))))))))).)))))))))...)))))))).)).....)))))))).....(((((((.....((((((((((((((((((.(((((......)))))))))))(((.....))).)).))))))))))...)))))))..)))))...)))))))...)))).....))))))..)).)))))))).......)))).)).)))))..))))).)).))))..)))))))).)))...........((.((((.....)))).))))))))..........((((((((.....))))))))..((.((((((((((.((......))))....)))))))).))(((((((((..((((((((.((((((...))))))))).)))))...)))))))))))).)))..(((......)))))))))))..)))))))..............(((((.............)))))...)))))).)).))))))))..).)))))))))).....))))..))))((((............)))).......((.((((((((((((((((((((...((((...((.....))...))))....)))).))))))))))..)))))).)).)))))).....)).))))))))))))(((((......)))))....((((((.....))))))..............(((((((....)).))))).((((.(((....(((((.(((((..((.....((((.....)))).........))....))))))))))...))).))))......)))))))))))))))).)))....((((((...))))))....))))))))))))))))))))))))))))))..))))))).....)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,(........,},(((((((((((,(((((((..((((((((((((((((((((((((((((((.....(((((((,{(((((..,((({{{.(((((((,.{(((.(((........)))}}}}}||||||.,||||{{,{,((((({{(({,.{((({,{.,...,||{{||...{{....},.||||}}.....,))}}||},,,||||{|||||{|{{||,,,,,...,,.........,.((((((((...)))))))){{,.(((((({,{((((((((((....,,,.,,)))))})),})}}}))}}...})))}}||{{|...|{{{{{{{{{{{{{|{{..,||||||{.{,,,,,|||{,|{|||{|.||{|{.,|||||,,.,,,{{......,{{{{{{{({((((((((({,((,,(((((((,.((,((,{{.{({{{{||,||}||||},}.}|||({{{,{{{{{,,,{,,|||,}||,,.,,||}}}((((((({...)))))))).,||||||,||||,||,..(((((((((((....))))))))))).|{||.,..,,.,.||}}...{{{{{{{...,.......,.})))))},(((.((((((((..((((((.(((((..(((((.((.((((,........{((,.{((({{..((((((..((((..(((((((...(((((.((((((((..((.(((((((((({(((((........)))))..(((((.,.(((((((.((({...}))))))))))}.)))))((((.{((....))).)))),{(((((((((((((...{{{{.{{{.....((({...}))).....}}}.}}}}...((((((..((((.{{{......(((((((....{,.((((..{(((((.................)))))})))),}},.((((((((((((......)))}}))))))))..))))))}..((((....((((((((.(((((((....)))))))...))))))))....)))))}}))))..)))))))))))))).))))))}}},},)))))))).)).....)))))))).....{((((((.,,..((((((((((((((((((.(((((......))))))))))){((.....})}.)).))))))))))..,)))))))..)))))...)))))))...)))).....))))))..)},)))))))),,.....)))).)).}))))..))))).)).))))..)))))))),))).........,{(((({((.....})),}))))}||}}},}}.,...{(((((((.....))))))))..{,}||||,|||||}||}}}...}}})}...))}}}}},}})||||||||,.,|,||||||}|||||{,|.||||||}}},}},}}},,))))}}}}||||.,}}},|{|,,...{|||||{{{||,,{||||..,.....}}}}}}....}}}))))}.,,}},.,}}}),}|}||,|||{{{..,{(((,,,.....,,.,)))))))}}},))}}}))))|{||............)))),}}|,,....,,,|{|{|||}}}}))))))}))}}}.}}}}}}}{{{{{{{.{||{{{{{{{{((((((((.......))))))))}}|||||..,..,},,)))))||||||,.,|||,.....{{{.....{((({{.,}},,}}}}}....,.......},{{({({{....))}}}}}}.{(({.(((.{{.{(((,,(((((..,{,....{{((.....))))............},,)))))))))),}.))).}}}}....,})))))),,))))))))})|,....((((({...})))))...,))))))))))))))))))))))))))))))..)))))))...,.)))))))))))
Back