Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GCN1L1_0000600
Sequence Length
688 nt
GC Content
0.5770
GGACACCAUGCUGCAGGCCCUGAGGUUUGUGAUUCAGGGAGCAGGGGCCAAAGUGGAUGCCGUCAUCCGGAAAAACAUCGUCUCACUCCUGCUGAGCAUGCUGGGACACGAUGAGGACAACACUCGCAUCUCCUCAGCCGGGUGCCUAGGGGAACUGUGUGCCUUUUUGACUGAAGAGGAGCUUAGUGCCGUUCUACAGCAGUGCUUGCUGGCGGACGUGUCCGGCAUUGACUGGAUGGUUCGGCACGGGCGGAGCCUGGCACUUUCCGUGGCUGUGAAUGUGGCUCCUGGCAGACUUUGUGCCGGCAGAUAUAGCAGUGAUGUUCAGGAAAUGAUCCUGAGCAGUGCCACGGCGGACAGGAUCCCCAUUGCGGUGAGCGGGGUCCGGGGCAUGGGCUUUCUCAUGAGACACCACAUCGAGACAGGCGGAGGGCAGUUGCCGGCCAAACUUUCCAGCCUGUUCGUUAAGUGUCUGCAGAACCCAUCCAGCGACAUCAGGCUGGUGGCUGAGAAGAUGAUCUGGUGGGCAAAUAAGGACCCACUGCCUCCCCUGGACCCCCAGGCCAUCAAGCCCAUCCUGAAGGCUCUUCUUGACAACACCAAGGAUAAGAACACCGUGGUCAGGGCCUACAGCGACCAGGCAAUUGUCAACCUCCUCAAGAUGCGGCAGGGUGAAGAGGUGUUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-266.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -279.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 182.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((.((((.((((((..(.(((.((...)).))).).))))))...)))))))..)))..)(.(((..(((((.((((((.((((((..((((..(((((.((((((((.......)))((((((........))))))...(((((.((((.(.(((((((....))))))).((((.((((((..(((...((((...((((((((....)).))))))...))))..)))..))))))))))...((((((((((....((.(((((...((((.((.((((((.......)))))).)).))))))))).))((((((((.....))))))))))))))).)))).))))..))))).....((((.(((((((((((((...(((((((((((((((((((.....((((.((((((((((((........))).....)))).)))))))))....)))))).))....(((.(((((........)))))))).))))))).......(((((((.......).)))))))))).)))))))))))...))))))..(((..(((((.(((((((..........((((.((.........)).)))).))))))).))).))...))).))))).....))).))..))))))))))))).))))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({(.|(,{,((({.((((((,,(.(((.{{..,)),))},),))))))...}}|||||..},),})|.{,.,{(((((.((((((.((((((..((((.,(((({..,{,((((({.....,}}|,.,,}}},}},,,}|}|||,,.(((((.((((.{{(((({((....}}}}}}}.(((,.((((((..(({,..((((...((((((({....}).))))))...))))..)))..)))))),}))...{(((((((((....((.(((((..,(((,.((.((((((.,...,.)))))).)),))),))))).))((((((((.....))))))))))))))).)))}.))))..)))))...||((({.{|(((((((((((...(((({((((((,{((((((.....((({{((((((((((({........,}}...,,)))).)))))))))....)))))).}}....(((.(((((........)))))))).))))))}.......(((((((.......}.)))))))))).))))))))))),.,}}}.||..{||..{{{{{.{||||{{,{{{(,,..,{{||.{|.......,.))}))))}))))))).))).}}.,.)))...,}},..,,}}},}}..)))))))))))))}.)}))))))),.)
Back