Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GCN1L1_0001500
Sequence Length
2983 nt
GC Content
0.5756
GCUGCAGAUGACUGUGCCAAGGCUGUGAUGAGCAACUUGAGUGCUCACGGGGUGAAGCUGGUGCUCCCCUCCUUACUGGCUGCCCUGGAGGAGGAAUCGUGGCGGACCAAAGCUGGGUCAGUGGAGCUUCUUGGGGCAAUGGCGUACUGUGCUCCUAAGCAGCUGUCAUCCUGUCUACCCAACAUUGUGCCCAAGCUUACGGAGGUGCUGACCGACUCCCAUGUCAAAGUCCAGAAGGCUGGACAGCAGGCGCUCAGGCAGAUCGGCUCCGUUAUCAGGAACCCGGAGAUCCUGGCCAUUGCUCCAGUCCUCCUGGAUGCCCUGACGGAUCCCUCCAGGAAGACCCAGAAGUGCUUGCAGACCCUGCUGGACACCAAGUUUGUCCACUUCAUUGAUGCCCCAUCCCUGGCCCUCAUCAUGCCCAUUGUCCAGAGAGCCUUCCAGGACCGUUCCACGGACACGCGGAAGAUGGCAGCCCAGAUUAUUGGCAACAUGUACUCCCUGACAGACCAGAAGGACUUGGCUCCGUACCUGCCCAGCGUGACGCCUGGCCUGAAAGCAUCGCUUUUGGACCCUGUGCCUGAGGUGCGGACCGUAUCUGCAAAGGCCCUUGGGGCCAUGGUGAAGGGCAUGGGGGAGUCGUGCUUUGAGGACUUGCUGCCGUGGCUGAUGGAGACACUGACCUAUGAGCAGAGCUCUGUGGAUCGCUCAGGCGCUGCACAGGGGUUGGCUGAGGUCAUGGCCGGUUUGGGGGUGGAGAAGUUGGAGAAGUUGAUGCCAGAAAUCGUGGCUACAGCCAGCAAAGUGGACAUUGCACCCCAUGUCCGAGAUGGCUACAUUAUGAUGUUUAACUACCUGCCCAUCACCUUUGGAGACAAGUUUACUCCUUAUGUGGGGCCCAUCAUCCCCUGUAUCCUCAAAGCUCUUGCUGAUGAGAAUGAGUUUGUGCGUGACACCGCCCUGCGCGCGGGCCAGCGGGUUAUCUCCAUGUACGCUGAGACAGCCAUCGCCCUGCUGCUGCCCCAGCUAGAGCAAGGCCUCUUUGAUGACCUUUGGAGAAUCAGGUUCAGCUCUGUUCAGCUCCUUGGGGAUCUCCUGUUUCACAUCUCAGGAGUCACUGGGAAGAUGACCACAGAAACUGCCUCUGAGGAUGAUAACUUUGGAACUGCCCAGUCCAACAAGGCGAUCAUCACUGCCCUGGGGGUAGAGCGGCGGAACCGGGUGUUGGCAGGGCUGUACAUGGGCCGCUCAGACACCCAGCUGGUGGUGCGGCAGGCGUCCCUGCAUGUCUGGAAGAUUGUUGUCUCCAAUACCCCCCGCACCUUGCGUGAGAUCCUACCCACUCUCUUUGGGCUCCUGCUGGGUUUCCUGGCCAGCACGUGUGCAGAUAAGAGAACGAUUGCAGCGAGAACAUUGGGAGAUCUUGUGCGGAAGUUAGGGGAGAAAAUCCUCCCCGAGAUCAUCCCCAUCCUUGAGGAAGGCCUGAGGUCUCAGAAGAGCGAUGAGAGGCAGGGUGUGUGCAUUGGCCUAAGUGAGAUCAUGAAGUCCACCAGCCGGGAUGCCGUGCUGUAUUUCUCUGAAUCCCUCGUGCCCACGGCAAGGAAGGCUUUGUGUGACCCACUGGAGGAGGUCAGAGAGGCGGCAGCCAAGACUUUCGAGCAGCUGCAUUCCACCAUCGGCCACCAGGCUCUGGAGGACAUUCUCCCAUUUUUACUAAAGCAGCUGGAUGACGAGGAGGUGUCAGAGUUUGCCUUGGAUGGUCUGAAGCAAGUCAUGGCUAUUAAGAGUCGUGUGGUGCUGCCCUACCUUGUGCCCAAGCUGACAACGCCACCUGUCAACACCCGGGUGCUGGCUUUCCUUUCGUCAGUGGCUGGUGAUGCCCUCACCCGUCAUCUUGGCGUGAUCCUCCCAGCGGUCAUGCUGGCCCUGAAGGAAAAGCUUGGGACCCCAGAUGAGCAGCUGGAGAUGGCCAAUUGUCAGGCUGUGAUCCUCUCCGUAGAGGAUGACACAGGGCACCGGAUCAUCAUCGAGUAUCUGCUGGAGGCCACCCGCAGCCCUGAGGUGGGCAUGAGGCAAGCUGCUGCCAUCAUCCUCAACAUCUACUGUUCCCGCUCAAAGGCUGACUACACCAGCCACCUGCGGAGCCUGGUCUCGGGCCUGAUCCGCCUCUUCAAUGACUCCAGCCCUGUGGUUCUGGAGGAGAGCUGGGAUGCCCUAAAUGCCAUCACUAAGAAGCUGGAUGCUGGCAACCAGUUGGCACUCAUUGAAGAGCUGCACAAGGAAAUCCGGCUCAUAGGGAACGAGAGCAAAGGCGAGCAUGUGCCAGGAUUCUGCCUCCCGAAGAAGGGAGUGACCUCCAUCCUUCCAGUGUUGCGGGAAGGAGUCCUGACUGGCAGCCCUGAGCAGAAGGAGGAGGCAGCCAAAGCCUUAGGCUUGGUAAUCCGCCUGACCUCGGCUGACGCCCUGAGGCCCUCCGUGGUCAGCAUCACUGGCCCUCUGAUCCGCAUCCUGGGGGACAGGUUCAGCUGGAAUGUGAAGGCGGCUCUGCUCGAGACACUCAGCCUCUUGUUGGCUAAGGUUGGGAUUGCCCUGAAGCCCUUCCUGCCCCAGCUGCAGACCACUUUCACCAAAGCCCUGCAGGACUCCAACCGGGGGGUGCGCCUGAAGGCCGCAGAUGCUCUGGGGAAGCUCAUUUCCAUCCACAUUAAGGUGGACCCCCUCUUCACAGAGCUGCUCAAUGGCAUCCGCGCCAUGGAGGACCCAGGUGUCAGGGACACCAUGCUGCAGGCCCUGAGGUUUGUGAUUCAGGGAGCAGGGGCCAAAGUGGAUGCCGUCAUCCGGAAAAACAUCGUCUCACUCCUGCUGAGCAUGCUGGGACACGAUGAGGACAACACUCGCAUCUCCUCAGCCGGGUGCCUAGGGGAACUGUGUGCCUUUUUGACUGAAGAGGAGCUUAGUGCCGUUCUACAGCAGUGCUUGCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1179.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1232.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 864.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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