Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GCN1L1_0001600
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.4920
GCAGUACCACCGGGCUCUGGUGGCGGUGCUCCUGAGCCGCACCUGGCACGUCCGCAGGCAGGCUCAGCAGACAGUUCGGAAGCUGCUGUCCUCUCUUGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGGACAACACUCGCAUCUCCUCAGCCGGGUGCCUAGGGGAACUGUGUGCCUUUUUGACUGAAGAGGAGCUUAGUGCCGUUCUACAGCAGUGCUUGCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-72.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -76.49
Frequency: 0.0025
Diversity: 63.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(.(((((((...))))))).).)))(.(((((((...((((.........))))..)))))))(((.(((((....))))))))(((......)))...................................................(((((..((((.((.((((.((((.(((((((.(((.....))).))))))....).)))).)))).))..))))..))))).(((((.....))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(.(((((((...))))))).}.)))(,(((((((...((((,{......}))))..)))))))(((.((((,....,})}))))|{(,,....))}..................................................,(((({..((((.((.((((.((((,{((((((.{((.....))).)))))}....}.)))).)))).))..))))..))))}.||{|||...}))))))
Back