Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GCN1L1_0002600
Sequence Length
2476 nt
GC Content
0.5751
CCAUUGCUCCAGUCCUCCUGGAUGCCCUGACGGAUCCCUCCAGGAAGACCCAGAAGUGCUUGCAGACCCUGCUGGACACCAAGUUUGUCCACUUCAUUGAUGCCCCAUCCCUGGCCCUCAUCAUGCCCAUUGUCCAGAGAGCCUUCCAGGACCGUUCCACGGACACGCGGAAGAUGGCAGCCCAGAUUAUUGGCAACAUGUACUCCCUGACAGACCAGAAGGACUUGGCUCCGUACCUGCCCAGCGUGACGCCUGGCCUGAAAGCAUCGCUUUUGGACCCUGUGCCUGAGGUGCGGACCGUAUCUGCAAAGGCCCUUGGGGCCAUGGUGAAGGGCAUGGGGGAGUCGUGCUUUGAGGACUUGCUGCCGUGGCUGAUGGAGACACUGACCUAUGAGCAGAGCUCUGUGGAUCGCUCAGGCGCUGCACAGGGGUUGGCUGAGGUCAUGGCCGGUUUGGGGGUGGAGAAGUUGGAGAAGUUGAUGCCAGAAAUCGUGGCUACAGCCAGCAAAGUGGACAUUGCACCCCAUGUCCGAGAUGGCUACAUUAUGAUGUUUAACUACCUGCCCAUCACCUUUGGAGACAAGUUUACUCCUUAUGUGGGGCCCAUCAUCCCCUGUAUCCUCAAAGCUCUUGCUGAUGAGAAUGAGUUUGUGCGUGACACCGCCCUGCGCGCGGGCCAGCGGGUUAUCUCCAUGUACGCUGAGACAGCCAUCGCCCUGCUGCUGCCCCAGCUAGAGCAAGGCCUCUUUGAUGACCUUUGGAGAAUCAGGUUCAGCUCUGUUCAGCUCCUUGGGGAUCUCCUGUUUCACAUCUCAGGAGUCACUGGGAAGAUGACCACAGAAACUGCCUCUGAGGAUGAUAACUUUGGAACUGCCCAGUCCAACAAGGCGAUCAUCACUGCCCUGGGGGUAGAGCGGCGGAACCGGGUGUUGGCAGGGCUGUACAUGGGCCGCUCAGACACCCAGCUGGUGGUGCGGCAGGCGUCCCUGCAUGUCUGGAAGAUUGUUGUCUCCAAUACCCCCCGCACCUUGCGUGAGAUCCUACCCACUCUCUUUGGGCUCCUGCUGGGUUUCCUGGCCAGCACGUGUGCAGAUAAGAGAACGAUUGCAGCGAGAACAUUGGGAGAUCUUGUGCGGAAGUUAGGGGAGAAAAUCCUCCCCGAGAUCAUCCCCAUCCUUGAGGAAGGCCUGAGGUCUCAGAAGAGCGAUGAGAGGCAGGGUGUGUGCAUUGGCCUAAGUGAGAUCAUGAAGUCCACCAGCCGGGAUGCCGUGCUGUAUUUCUCUGAAUCCCUCGUGCCCACGGCAAGGAAGGCUUUGUGUGACCCACUGGAGGAGGUCAGAGAGGCGGCAGCCAAGACUUUCGAGCAGCUGCAUUCCACCAUCGGCCACCAGGCUCUGGAGGACAUUCUCCCAUUUUUACUAAAGCAGCUGGAUGACGAGGAGGUGUCAGAGUUUGCCUUGGAUGGUCUGAAGCAAGUCAUGGCUAUUAAGAGUCGUGUGGUGCUGCCCUACCUUGUGCCCAAGCUGACAACGCCACCUGUCAACACCCGGGUGCUGGCUUUCCUUUCGUCAGUGGCUGGUGAUGCCCUCACCCGUCAUCUUGGCGUGAUCCUCCCAGCGGUCAUGCUGGCCCUGAAGGAAAAGCUUGGGACCCCAGAUGAGCAGCUGGAGAUGGCCAAUUGUCAGGCUGUGAUCCUCUCCGUAGAGGAUGACACAGGGCACCGGAUCAUCAUCGAGUAUCUGCUGGAGGCCACCCGCAGCCCUGAGGUGGGCAUGAGGCAAGCUGCUGCCAUCAUCCUCAACAUCUACUGUUCCCGCUCAAAGGCUGACUACACCAGCCACCUGCGGAGCCUGGUCUCGGGCCUGAUCCGCCUCUUCAAUGACUCCAGCCCUGUGGUUCUGGAGGAGAGCUGGGAUGCCCUAAAUGCCAUCACUAAGAAGCUGGAUGCUGGCAACCAGUUGGCACUCAUUGAAGAGCUGCACAAGGAAAUCCGGCUCAUAGGGAACGAGAGCAAAGGCGAGCAUGUGCCAGGAUUCUGCCUCCCGAAGAAGGGAGUGACCUCCAUCCUUCCAGUGUUGCGGGAAGGAGUCCUGACUGGCAGCCCUGAGCAGAAGGAGGAGGCAGCCAAAGCCUUAGGCUUGGUAAUCCGCCUGACCUCGGCUGACGCCCUGAGGCCCUCCGUGGUCAGCAUCACUGGCCCUCUGAUCCGCAUCCUGGGGGACAGGUUCAGCUGGAAUGUGAAGGCGGCUCUGCUCGAGACACUCAGCCUCUUGUUGGCUAAGGUUGGGAUUGCCCUGAAGCCCUUCCUGCCCCAGCUGCAGACCACUUUCACCAAAGCCCUGCAGGACUCCAACCGGGGGGUGCGCCUGAAGGCCGCAGAUGCUCUGGGGAAGCUCAUUUCCAUCCACAUUAAGGUGGACCCCCUCUUCACAGAGCUGCUCAAUGGCAUCCGCGCCAUGGAGGACCCAGGUGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-973.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1019.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 581.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((.(.(((.(((((((.(.((....))...).))))))).)))...).)))....((((...))))((((((.......))))))((((..(((((..(((....)))....))))).......(((.(((.(.(((...(((((((.((((.(((((((..(((((((((.((..((((...((((((.(((((.(.(((((......))).(((.((.((((((((.........))).)).))).))))).........(((((((..(((((((..(((((((((...))))))).))..(((((...))))).((((((..(((((..((((((..(((((.((((.(((((((((((((((((((.(.((((((((((...(((.((.(((((((.(.(((....))).).))))))).)).))).)))))).(((((.((((((.((((....(((((.....(((..((((.......))))..))))))))...(((.......))).)))).)))))).)))))((((....)))).......((((((((((.(((((((((((((......(((......((((........))))......((((.(((....)))..)))).....(((((((((((.........)))))))))))(((((...............)))))(((((((...((((.((((((.(((((((((((((......)))).((((..((...))...))))(((((.(((..((((.((((((.(((((.((((((..........))))))))..(((........)))((((.......))))((((((((..(((((..(((....)))....)))))..)))))).)).))).)))))).))))))).)))))((((((((((.((.((......)).)))))..))))))))))))).))))))))))))).....)).))))))))......))))))))........((((((.......((((((...((((((((.((((.((.(.((((((.(.....).)))))).).)).))))..))))....................)))).))))))))))))......((((((......))))))((((((.((.((.(((....))).))...)))))))).)))).).))))...)))))))))).).))))))))...(((.(((......))))))(((((((....))).))))...((((((((.(((((((((..((((.(((((....)))))))))...)))..)))).))))))))))))))))).)))).)))).))))))))((((((((..((((((((((((((((((.(((.....................(((((.((((((..(((((((((.(((((((((((((.(((((((((.((((...(((((((......)))))))...))))..........((((((.(((((((((.((.(((((........)))))))(((((.((.((.((((((((((.(((((.....))))).)))))..))))).)).....((((((.((((.((((.(((.(((......))))))...)))))))).).))))).)).))))).)))))).)))((.(((((((....))))))).))...))))))))))))))).((.(((....))).))(.(((((((......)).))))).)..)))))))))).))).)))).)))))..)))))))))))..........(((((.......))))).))).)))))))))))....)))).)))..((((((((...((..(((......))).))..)))))).)))))))))))))..))))).))))))...(((((((((((((...)))))((((((((......))).))).)).....)))))))))))))))..)))))))...)).).)))))))))))...)))).(((((......)))))....)))))).))))).))))).)))))).).))))))...)))..).))).)))))))((((((((.(((((.(((...)))))))).....))))..))))))((((((((.((.((.((((((((((..(((((..(((((.((.(...((((((((..((....(((((.((.((...(((((((.((.(((((..(((.(.....).)))..(((((...(((..(((.((......)).)))..)))...))))).))))))).))))))).....))..)).)))))....))..)))))))).).)).)))))..)))((((((..((((......((((((........))))))......)))).))))))((((....))))...)))))))))))).))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...((({,.(((.(((((((.{.((....))...}.))))))).)))...{{{{|{...((((...}))){(((({.......))))))}}}|..{((((..{{{....})),...})}}}.......{{{.{{{.|.(((...(((((((.((((.(((((((..(((((((((.((..((((...(((((,,(((({.{{((((,.,.,.,|||.,{{.{{.{(({{{{{....|,,..|||.,,,))}.))}}}|...,,...(((((((..(((((((..,,{{{((((,,.}}}}))),)}..(((((...))))),((((({{{((((({(((((((,,(((((.((((.(((((((((((((((((((.(.((((((((((...(((.((.(((((((.(.(((....))).).))))))).)).))).)))))){(((((.((((((.((((.,..(((({....{(((..((((.......))))..))))))))...(((.....,.))),)))).)))))).)))))|{{,....}}},.......(((((({{((,(((((((((((((...,..(((.{({({((((........}}}|,,{{,.((((.(((....)))..)))).,,,.{{{((((((({........,||}}}}))}))((((({{,..,,,{|{{{,,||||}{{{{{((,,.(((((((((((,((((((((({((((..{{{|||{{(((,..,,.,}))}},,,}}||||{.|||||{{{(,|{{(({.(({({.((((((..........)))))}}}.,|||,..,.,,,}})|||{..,,,,,}||}{{((((((..((((((,,((....)))))),.,})}..)))))).}}.}}}.)))))),)))))))}),,}}|||||{||||.||||{},,,,,})}}}}},..))}))))}))))),))))))))))))).,,,,)),))}}}))).,}...))))))))}.......((((((.......((((((...((((.((((((((.((.(.((((((.(.....).)))))).).)).))},.,))))}.,,.......,}.......)))),))))))))))))......((((((......))))))((((((.((.((.(((....))).))...))))))))..,}).).)})),..)))))))))).).))))))))...(((.(((......))))))(((((((....))).))))...((((((((.(((((((((..(((,{(((((....)))))))))...)))..)))).}})))))))))))))))},))).)))).))))),},}||||||.}}{{{((((((((((((({(,(((.....,,,,............(((((.((((((..(((((((((.(((((((((((((.(((((((((.((((...(((((((......)))))))...))))..........((((((.{{(((((((.(((({(((........}||}|}|(((({.{{,{,.{{(((({(((.(((((.....})))).))))}..}))|},||,,,,.{{((({.((({.{{((|{({,|||,.....))))))...))))}))).).))))),),,)))},.)))))))}}|((.(((((((....))))))).)),..))))))))))))))).((.(((....))).))(.({{{{{|..,,.,,).))))),)..)))))))))).))).)))).)))))..)))))))))))..,,,.....(((((.......))))).}}},)))))))))))....)))).}}}{{({((((({...,,{((((,.,....)),,}},)))))),)}}))})))))))..,)))),)}}}},...(((((((((((((...)))))((((((((......))).))).)).....)))))))))))))))..)))))))..})).)})))))))))))...)))),(((((......))))).,..))))))}})))).))))).)))))).).))))))...)))..,.))).)))}.,}((((((((.((({{{(((...)))))))).....))))..))))))(((((({{{((.((.((((((((((.{(((((..(((((.((.{...(((((((({{{{{...{((((.((.((...(((((((.((.(((((..(((.,.....|.}}}..(((((...(((..(((.{(......)}.)))..)))...))))).))))))).))))))).....})}.)).)))))}}..)),,)))))))).}.)).)))))..)))|||,,({(({{{......{{{{((,,,.....})))))....,,||...,))))}{{{{....))))...}})))))))))).))))))))))))
Back