Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_GCN1L1_0004400

Sequence Length

2382 nt

GC Content

0.5714

GAGAACGUCAACUCGCUGUUGCCAGUAUUCGAGGAGUUCCUGAAGAACGCGCCCAAUGAUGCCAGCUAUGAUGCUGUGCGACAGAGUGUGGUGGUCCUGAUGGGCUCUCUGGCCAAGCACCUGGACAAGAGUGACCCCAAAGUGAAGCCCAUUGUUGCCAAGCUCAUCGCUGCCCUCUCCACCCCCUCCCAGCAGGUCCAGGAGUCCGUAGCCAGCUGCUUGCCACCCCUUGUGCCAGCCAUCAAGGAGGAUGCUGGAGGGAUGAUCCAGAGGCUUAUGCAGCAGCUGCUGGAGUCAGACAAGUACGCAGAGCGCAAAGGGGCCGCCUAUGGCCUGGCGGGCCUGGUGAAGGGCCUGGGCAUCCUCUCGCUGAAGCAACAGGAGAUGAUGGCGGCACUGACUGAUGCCAUCCAAGAUAAGAAGAACUUCCGCCGGCGAGAGGGAGCCCUCUUUGCCUUCGAGAUGCUCUGCACCAUGCUGGGGAAACUUUUUGAGCCGUAUGUGGUUCACGUGCUGCCCCAUCUGCUCCUGUGCUUUGGGGAUGGAAACCAGUAUGUGCGUGAGGCUGCAGAUGACUGUGCCAAGGCUGUGAUGAGCAACUUGAGUGCUCACGGGGUGAAGCUGGUGCUCCCCUCCUUACUGGCUGCCCUGGAGGAGGAAUCGUGGCGGACCAAAGCUGGGUCAGUGGAGCUUCUUGGGGCAAUGGCGUACUGUGCUCCUAAGCAGCUGUCAUCCUGUCUACCCAACAUUGUGCCCAAGCUUACGGAGGUGCUGACCGACUCCCAUGUCAAAGUCCAGAAGGCUGGACAGCAGGCGCUCAGGCAGAUCGGCUCCGUUAUCAGGAACCCGGAGAUCCUGGCCAUUGCUCCAGUCCUCCUGGAUGCCCUGACGGAUCCCUCCAGGAAGACCCAGAAGUGCUUGCAGACCCUGCUGGACACCAAGUUUGUCCACUUCAUUGAUGCCCCAUCCCUGGCCCUCAUCAUGCCCAUUGUCCAGAGAGCCUUCCAGGACCGUUCCACGGACACGCGGAAGAUGGCAGCCCAGAUUAUUGGCAACAUGUACUCCCUGACAGACCAGAAGGACUUGGCUCCGUACCUGCCCAGCGUGACGCCUGGCCUGAAAGCAUCGCUUUUGGACCCUGUGCCUGAGGUGCGGACCGUAUCUGCAAAGGCCCUUGGGGCCAUGGUGAAGGGCAUGGGGGAGUCGUGCUUUGAGGACUUGCUGCCGUGGCUGAUGGAGACACUGACCUAUGAGCAGAGCUCUGUGGAUCGCUCAGGCGCUGCACAGGGGUUGGCUGAGGUCAUGGCCGGUUUGGGGGUGGAGAAGUUGGAGAAGUUGAUGCCAGAAAUCGUGGCUACAGCCAGCAAAGUGGACAUUGCACCCCAUGUCCGAGAUGGCUACAUUAUGAUGUUUAACUACCUGCCCAUCACCUUUGGAGACAAGUUUACUCCUUAUGUGGGGCCCAUCAUCCCCUGUAUCCUCAAAGCUCUUGCUGAUGAGAAUGAGUUUGUGCGUGACACCGCCCUGCGCGCGGGCCAGCGGGUUAUCUCCAUGUACGCUGAGACAGCCAUCGCCCUGCUGCUGCCCCAGCUAGAGCAAGGCCUCUUUGAUGACCUUUGGAGAAUCAGGUUCAGCUCUGUUCAGCUCCUUGGGGAUCUCCUGUUUCACAUCUCAGGAGUCACUGGGAAGAUGACCACAGAAACUGCCUCUGAGGAUGAUAACUUUGGAACUGCCCAGUCCAACAAGGCGAUCAUCACUGCCCUGGGGGUAGAGCGGCGGAACCGGGUGUUGGCAGGGCUGUACAUGGGCCGCUCAGACACCCAGCUGGUGGUGCGGCAGGCGUCCCUGCAUGUCUGGAAGAUUGUUGUCUCCAAUACCCCCCGCACCUUGCGUGAGAUCCUACCCACUCUCUUUGGGCUCCUGCUGGGUUUCCUGGCCAGCACGUGUGCAGAUAAGAGAACGAUUGCAGCGAGAACAUUGGGAGAUCUUGUGCGGAAGUUAGGGGAGAAAAUCCUCCCCGAGAUCAUCCCCAUCCUUGAGGAAGGCCUGAGGUCUCAGAAGAGCGAUGAGAGGCAGGGUGUGUGCAUUGGCCUAAGUGAGAUCAUGAAGUCCACCAGCCGGGAUGCCGUGCUGUAUUUCUCUGAAUCCCUCGUGCCCACGGCAAGGAAGGCUUUGUGUGACCCACUGGAGGAGGUCAGAGAGGCGGCAGCCAAGACUUUCGAGCAGCUGCAUUCCACCAUCGGCCACCAGGCUCUGGAGGACAUUCUCCCAUUUUUACUAAAGCAGCUGGAUGACGAGGAGGUGUCAGAGUUUGCCUUGGAUGGUCUGAAGCAAGUCAUGGCUAUUAAGAGUCGUGUGGUGCUGCCCUACCUUGUGCCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-921.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -965.06

Frequency: 0.0000

Diversity: 616.48

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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