Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_GCN1L1_0007200

Sequence Length

250 nt

GC Content

0.4800

GUGCUGCCCUUAGAGGCUUUGGUGACUGAUGCUGGAGAGGUGACUGAGGCAGGCAAGGCCUACGUGCCUCCACGGGUCCUGCAGGAGGCUCUGUGUGUCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUGGCAACAUGUACUCCCUGACAGACCAGAAGGACUUGGCUCCGUACCUGCCCAGCGUGACGCCUGGCCUGAAAGCAUCGCUUUUGGACCCUGUGCCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-69.55 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -74.88

Frequency: 0.0002

Diversity: 27.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(((......(((((..((((..(.(((((((..(((((.(.(((.((((..((((......))))((...((((.((((((.((..((((.(((((..................................................)))))))).)..)).)))).))))))....)).)))).))).))))))..))))))).))))).)))))....))).)))(((.((........)).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.(((..{{..(((((..((((..{.(((((((..((((,,(.(((.((((..{(((......)))|((...((({,(((((({({...{(({(((((..................................................)))))))),)..))})))).))))))....)),)))).))).))))))..))))))).})))).)))))..,,))).)))(((.((.,......)).)))