Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_GCN1L1_0008500

Sequence Length

1378 nt

GC Content

0.5813

GUUCUGGCUUCAGACACCCUGACCACCCUGUGUGCCAGCAGCAGUGGUGAUGAUGGCUGUGCCUUUGCAGAGCAGGAGGAGGUGGACGUGCUGCUCUGUGCCUUGCAGUCCCCGUGUGCCAGCGUGCGGGAAACCGUGCUCCGGGGGCUGAUGGAACUCCACAUGGUAUUGCCAGCACCUGAUACUGAUGAGAAGAAUGGCCUGAACCUUCUGCGGAGACUCUGGGUGGUCAAGUUUGACAAGGAGGAGGAGAUCCGGAAGCUGGCUGAGAGGCUCUGGUCAAUGAUGGGCCUAGACCUGCAGCCAGACCUCUGCUCCUUGCUGAUUGACGACGUGAUCUAUCAUGAGGCGGCUGUAAGGCAGGCAGGGGCCGAAGCCCUCUCCCAAGCAGUGGCACGUUACCAGCGGCAGGCGGCGGAGGUUAUGGGCAGGCUCAUGGAGAUUUACCAGGAAAAGCUCUACCGGCCGCCCCCAGUGCUGGAUGCUUUGGGACGAGUUAUUUCAGAAUCUCCUCCAGAUCAGUGGGAAGCCAGGUGUGGCUUGGCGUUGGCCCUCAACAAGCUCUCCCAGUAUUUGGACAGCUCUCAGGUGAAGCCACUCUUUCAGUUUUUUGUCCCUGAUGCCCUCAAUGACCGACACCCAGAUGUCCGGAAGUGCAUGUUGGAUGCAGCCCUCGCAACGCUCAACACUCAUGGGAAGGAGAACGUCAACUCGCUGUUGCCAGUAUUCGAGGAGUUCCUGAAGAACGCGCCCAAUGAUGCCAGCUAUGAUGCUGUGCGACAGAGUGUGGUGGUCCUGAUGGGCUCUCUGGCCAAGCACCUGGACAAGAGUGACCCCAAAGUGAAGCCCAUUGUUGCCAAGCUCAUCGCUGCCCUCUCCACCCCCUCCCAGCAGGUCCAGGAGUCCGUAGCCAGCUGCUUGCCACCCCUUGUGCCAGCCAUCAAGGAGGAUGCUGGAGGGAUGAUCCAGAGGCUUAUGCAGCAGCUGCUGGAGUCAGACAAGUACGCAGAGCGCAAAGGGGCCGCCUAUGGCCUGGCGGGCCUGGUGAAGGGCCUGGGCAUCCUCUCGCUGAAGCAACAGGAGAUGAUGGCGGCACUGACUGAUGCCAUCCAAGAUAAGAAGAACUUCCGCCGGCGAGAGGGAGCCCUCUUUGCCUUCGAGAUGCUCUGCACCAUGCUGGGGAAACUUUUUGAGCCGUAUGUGGUUCACGUGCUGCCCCAUCUGCUCCUGUGCUUUGGGGAUGGAAACCAGUAUGUGCGUGAGGCUGCAGAUGACUGUGCCAAGGCUGUGAUGAGCAACUUGAGUGCUCACGGGGUGAAGCUGGUGCUCCCCUCCUUACUGGCUGCCCUGGAGGAGGAAUCGUGGCGGACCAAAGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-537.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -563.86

Frequency: 0.0000

Diversity: 424.70

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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