Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_GCN1L1_0018600

Sequence Length

528 nt

GC Content

0.5379

CUAUUUCUAGUCUGCUGGCAUCAGUGACGCUUGACCUCAGCCAGUAUGCCAUGGACAUCGUGAAAGGACUGGCUGGUCACCUGAAAUCCAACAGUCCCCGCCUGAUGGAUGAAGCUGUGCUGGCACUGCGGAACCUGGCACGCCAGUGCAGUGACUCUUCGGCCAUGGAAUCCCUGACCAAGCACCUAUUUGCUAUCCUCGGAGGCUCGGAAGGAAAACUAACUGUUGUAGCCCAGAAGAUGAGCGUCCUCUCAGGGAUUGGGAGCGUCAGUCAUCACGUGGUGUCUGGACCUUCCAGUCAGGUCCUGAAUGGGAUCGUGGCUGAGCUGUUCAUCCCGUUCCUUCAGCAGGAAGUUCAUGAAGGGACCUUGGUACACGCUGUCUCAGUCCUGGCUCUCUGGUGUAACCGAUUCACUAUGGAAGUGCCCAAGAAGCUCACUGAAUGGUUCAAAAAAGCUUUCAGCCUUAAAACCUCCACAUCUGCGGUGAGGCAUGCCUACCUGCAGUGCAUGUUGGCCUCUUACCGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-175.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -187.64

Frequency: 0.0000

Diversity: 155.89

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.((((((((((.((((....)))))))...(((((..(((((((....((((.....)))).....))))))))))))......(((((.(((.......))).)))))...(((((((((((..(((........))).)))))))))))(((..((((((((((..(((((......((((......))))......(((.(((((...((..(((.....)))....)).......))))).)))..((((((((((((((.(((((.((((....)))).)).))))))))))))....)))))..)))))))))))))))..)))......(((((((((............))))))))).(((((((((...(((........)))......)))).))))).......))))))))(((((((.(((..(((((.((((......))))))))).............((((((((((..(((....)))..))))))...)))).))).))))...)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

({(,,,,|||((,{.,{{{,(((({((.((((((({.,(((((((.{..(((({...,))))...,.))))))}))}}.......{((((.(((,,...,.})).)))}},..(((((((((((..(((........))).))))))))))),{{..{(((((((((,.,((((.{,...((((......))))....,.(((.(((((...{{..,,(...,.}}}},,,,},......))))).)))..{{{{{(((((((((.(((((.((((....)))).))}})))))))))))..,,))))}..)))))))))))))))..}}},,....(((((((((...,....,,..))))))))){{{({{{{,,|||{,{.,,},...)))||,,|||||...,,,...})))}.))),)))|||||||}||}}}||||..((((......,|||,,.))}.,,..,,||...,({.{{{((({|(((...,})},}}})))).},}})},))),},,,..,)))