Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GCN1L1_0019500
Sequence Length
433 nt
GC Content
0.5150
AGCGCCCUACUGGACUUUUACAUGAAGAACAUCCUGAUGAGCAAAGUCAAGCCUCCGAAGUACCUGUUGGAUAGCUGUGCCCCUCUGCUCCGAUACCUGUCCCACUCAGAAUUUAAGGAUCUGAUACUGCCCACCAUACAGAAGUCCUUACUGAGGAGUCCAGAGAAUGUUAUUGAAACUAUUUCUAGUCUGCUGGCAUCAGUGACGCUUGACCUCAGCCAGUAUGCCAUGGACAUCGUGAAAGGACUGGCUGGUCACCUGAAAUCCAACAGUCCCCGCCUGAUGGAUGAAGCUGUGCUGGCACUGCGGAACCUGGCACGCCAGUGCAGUGACUCUUCGGCCAUGGAAUCCCUGACCAAGCACCUAUUUGCUAUCCUCGGAGGCUCGGAAGGAAAACUAACUGUUGUAGCCCAGAAGAUGAGCGUCCUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-123.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -131.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 90.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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