Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GCN1L1_0020400
Sequence Length
608 nt
GC Content
0.5559
AUCUUCCAGAGGGAGCAGUGAAGGGGCUCUGCAAAUUGUUCUGCUUGACUCUGCAUCGAUAUAGAGAUGCAGCCUCCCGCAGGGCCUUGCAGGCAGCCAUCCAGCAGUUGGCUGAGGCCCAGCCAGAAGCCACUGCUAAGAACCUUCUACACUCUCUGCAGUCUUCUGGUAUAGGCUCCAAAGCAGGUGUUCCCAGUAAGAGCAGUGGCUCUGCCGCCUUGCUGGCCUUGACCUGGACCUGCCUCCUGGUGCGCAUUGUCUUUCCAUCGAGAGCCAAGCGACAAGGAGACAUCUGGAACAAACUGGUGGAAGUGCAGUGCCUGCUCUUGCUGGAGGUGCUGGGUGGCUCCCACAAGCACGCCGUGGAUGGUGCUGUGAAGAAACUCACGAAGCUGUGGAAAGAGAACCCCGGGCUGGUGGAACAGUACUUGUCAGCCAUUCUCAGCCUAGAGCCCAACCAGAACUAUGCUGGCAUGCUGGGGCUGCUGGUGCAGUUCUGCACGAGUCACAAGGAGAUGGACGUGGUCAGUCAGCACAAGAGCGCCCUACUGGACUUUUACAUGAAGAACAUCCUGAUGAGCAAAGUCAAGCCUCCGAAGUACCUGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-224.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -234.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 192.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....(((((((......(((((((((((((((...(((((((..((..(((((((........)))))))..))..))))))).))))))..))))....((((((.((((..(((...)))...)))))))))).....)))))....)))))))..))(..(.((((((((((......(((((....((((((((....(((((...))))))))))))).....)))))(((.((((((((.((.(((.(((.(((((....))))).)))))))).))))).((((.(((.....(..((((((((.(((((..((((((((((((.((.(((((((..((((((((.((.((((......)))).(((((......)))))..)))))))...))).)))).((((((((((.(((.....)))...))))...))))))..)))))..)))).....(((((((.(((.((((((((....)))))))))))((.(((.((......))))).))....)))))))))))))))...))))).))))))))..).......))).)))).)))..))).))))).....))))).)..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,((((,,((((,.,({(({,{((((((((((((...(((((((..((..(((((((........)))))))..))..))))))).))))}|{{{(({.,({(((((((((((,.((({..|||{{{{|..|((((..(({...........)))..))))))))))))}...}|}|,|..,|{.{{,,,,,((((((((((((,.(((.((((,,{{{{{({{(,.{({..(((((..((.(((((.((.(((.(((.(((((....))))).)))))))).))))).)}}))))..))}.}})))}},,),)))).))))))))))))))).|(||((((,|{{(({((((,{((.((((,....,)))).{((((......))))}..)))))))...{,{,.....{(((((((((.({{....})}),,,))}},,})})))).})))),..}}}}.,}}..||||||.|||}|||||||||.{{||}},,|||}}({.(((.({......))))).)),,)}),},)))).,)))),))})}))){{((({,.{{{.{,{,...,},},)))...}}})))..,)))}.}}}),,,,.,..,
Back