Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0000200
Sequence Length
716 nt
GC Content
0.4832
GUGACGUGCGUGGCGACGUGUCGGCCAUCUUGUGUUGUUGAGGCUGAGGACUGACUGGGGUUCUGAGACUCCCUGUCCCGGACCGCAGAUUAUAGUGGGACCAGUCUCAUUAGGUUGAAUCUACAGCCUAUGUUGGUGUUAACCCAGGUCUCUUAGAGCGUUAAAAGGAUCUGAACAAAGUCUGCUCAAAUCUCCUGCUGUGAACCAGCAGAAUUUUUGAACAGAGACCACGUCUCCACCUCCUGGGCUCCAACGAUUCUCCCAUCUUGGCCUCCCAAAGCGCUGGAUUUACAGGUUUCUUCACAUAUAAAAAUCUAUUGUAAAAAUACGGAAAAGAAUGGCAGCGGAAACGCAGACACUGAACUUUGGGCCUGAAUGGCUCCGAGCUCUGUCCAGUGGUGGGAGUAUUACAUCCCCUCCUCUUUCUCCAGCAUUGCCGAAGUAUAAAUUAGCAGAUUAUCGUUACGGCAGAGAAGAAAUGUUAGCACUUUUCCUUAAAGACAACAAGAUACCUUCAGACCUUCUGGAUAAAGAAUUUCUGCCUAUCCUCCAGGAGGAACCCCUUCCACCAUUGGCUCUGGUACCCUUUACAGAAGAAGAACAGAGAAACUUUUCCAUGUCUGUAAAUAGUGCUGCUGUCCUGCGAUUGACAGGACGAGGAGGAGGAGGAACAGUGGUGGGGGCUCCUAGAGGUCGAAGUUCUUCAAGAGGGCGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-223.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -236.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 222.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((....))))).))..)))(((((.((.((((((((...((((..((((((((((((((((....((((((...............)))))).))))))..(((((((......)))))))....(((....)))((((((.(((..........))))))))).......((((.(((((....((((((.....))))))....))))).)))).(((((((((((.(((((((((..((((.(((......)))))))...))).((((.(((......)))))))...............(((.(((((....)))))...)))..(((((((.....(((((((..((((((.(((((.....))))).)))(((((((((((((((((((..........((((((.((((((......(((((((..((((.........))))..)).)))))))))))...((((....((((.....))))..)))).((((....((((..((((......))))..))))..))))....)))))).....))))))))))))).((((..........))))......))))))......)))..)))))))......)))))))(((((((....).)))))).)))))).))))..)).))))).))))).))))).))))..))..)))))).)).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(({((((....))))}.))..)))(((((.((.((((((((..,((((..((((((((((({((({....|||{{|,,,,.,,,......,|}}||}.}})))),.(((((((......)))))))....(((....)))((((((,{((,......,..}}))))))).......{(((.(((((..,.((((((.....)))))).,..))))).)))),{({{{|||{{{,(({{{{({{,.(({{.{{{......)))}))).,.}}}..((({(((..,,,,|||||,,...............,,|.||||,....}},(((((((..,{{{,(((....))).{{((..((.(((.(((((.....))))).))).}}|}}|{(({(({(((((........,,|,,||{{{(((((......(((((((..((((,{{....}}))))..)).))))))))))},..||||....||||,,,..},,}.,}},,,||,,..,|{{{,,,((((||{...||||..||,|..}.,,.||.}})}}}.....}}}}}|}}}}})}(((((,,,..,(((,||||.,..,,|}}}}}...))}))),..,)))))))),,))))).,{(((((({....}.))))))}})}))).)))),..),))))),)))))})))}),))))..))},)))))).)).)))))
Back