Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0000300
Sequence Length
2444 nt
GC Content
0.4800
GUGACGUGCGUGGCGACGUGUCGGCCAUCUUGUGUUGUUGAGGCUGAGGACUGACUGGGGUUCUGAGACUCCCUGUCCCGGACCGCAGAUUAUAGUGGGACCAGUCUCAUUAGGUUGAAUCUACAGCCUAUGUUGGUGUUAACCCAGGUCUCUUAGAGCGUUAAAAGGAUCUGAACAAAGUCUGCUCAAAUCUCCUGCUGUGAACCAGCAGAAUUUUUGAACAGAGACCACGUCUCCACCUCCUGGGCUCCAACGAUUCUCCCAUCUUGGCCUCCCAAAGCGCUGGAUUUACAGGUUUCUUCACAUAUAAAAAUCUAUUGUAAAAAUACGGAAAAGAAUGGCAGCGGAAACGCAGACACUGAACUUUGGGCCUGAAUGGCUCCGAGCUCUGUCCAGUGGUGGGAGUAUUACAUCCCCUCCUCUUUCUCCAGCAUUGCCGAAGUAUAAAUUAGCAGAUUAUCGUUACGGCAGAGAAGAAAUGUUAGCACUUUUCCUUAAAGACAACAAGAUACCUUCAGACCUUCUGGAUAAAGAAUUUCUGCCUAUCCUCCAGGAGGAACCCCUUCCACCAUUGGCUCUGGUACCCUUUACAGAAGAAGAACAGAGAAACUUUUCCAUGUCUGUAAAUAGUGCUGCUGUCCUGCGAUUGACAGGACGAGGAGGAGGAGGAACAGUGGUGGGGGCUCCUAGAGGUCGAAGUUCUUCAAGAGGGCGAGGCAGAGGCAGAGGUGAAUGUGGUUUCUACCAAAGAAGUUUUGAUGAAGUAGAGGGUGUUUUUGGUCGAGGAGGUGGCAGAGAAAUGCAUAGAUCGCAGAGCUGGGAGGAAAGGGGUGACAGACGUUUUGAAAAACCAGGACGAAAAGAUGUAGGGAGACCAAAUUUUGAGGAAGGUGGACCAACAUCAGUAGGGAGAAAGCAUGAAUUUAUACGCUCAGAAAGUGAAAAUUGGCGCAUCUUUAGAGAGGAACAAAAUGGAGAAGAUGAAGAUGGAGGUUGGCGACUAGCUGGAUCAAGGAGGGAUGGAGAGAGGUGGCGACCUCACAGUCCUGAUGGCCCUCGUUCUGCAGGCUGGCGGGAACACAUGGAACGACGUCGGAGGUUUGAGUUUGAUUUUCGAGAUAGAGAUGAUGAACGGGGUUACCGAAGGGUUCGCUCUGGCAGUGGGAGCAUAGAUGAUGACAGGGAUAGCUUGCCCGAAUGGUGCUUAGAGGAUGCUGAAGAAGAAAUGGGUACAUUUGACUCAUCUGGAGCAUUCCUUUCUCUAAAAAAAGUACAGAAAGAGCCUAUUCCAGAAGAGCAGGAGAUGGACUUCCGGCCUGUGGACGAAGGGGAGGAGUGCUCUGACUCUGAGGGUAGCCAUAAUGAAGAGGCCAAAGAACCCGAUAAGACAAAUAAGAAAGAAGGAGAGAAAACAGAUAGAGUAGGAGUUGAAGCUAGUGAGGAAACUCCCCAGACCUCAUCAUCAUCUGCUAGACCAGGUACUCCUUCAGACCAUCAGUCUCAGGAAGCAUCACAGUUUGAGAGGAAAGAUGAACCAAAAACUGAGCAAACGGAAAAAGCUGAAGAGGAGACUCGGAUGGAAAAUAGUCUACCAGCCAAAGUGCCCAGCAGAGGGGAUGAAAUGGUUGCUGAUGUCCAGCAGCCCCUGUCGCAGAUUCCUUCAGAUACAGCCUCUCCUCUUCUCAUACUUCCACCUCCUGUUCCCAAUCCUAGUCCUACUCUCCGGCCAGUUGAAACACCAGUUGUAGGUGCUCCUGGUAUGGGCAGUGUUUCCACAGAACCUGAUGAUGAAGAAGGUCUCAAACAUUUGGAGCAGCAAGCUGAGAAAAUGGUGGCUUAUCUCCAAGACAGUGCACUAGAUGAUGAAAGAUUGGCAUCAAAACUGCAAGAGCACAGAGCUAAAGGAGUGUCGAUUCCAUUGAUGCAUGAAGCAAUGCAGAAGUGGUAUUACAAAGAUCCUCAGGGAGAAAUUCAAGGUCCCUUCAAUAAUCAGGAGAUGGCAGAAUGGUUUCAGGCGGGCUAUUUUACUAUGUCUUUAUUGGUGAAGAGAGCGUGUGAUGAAAGCUUCCAACCUCUUGGCGAUAUCAUGAAAAUGUGGGGAAGGGUUCCCUUUUCUCCAGGUCCAGCUCCCCCUCCUCAUAUGGGAGAGCUGGACCAGGAACGACUGACCAGGCAGCAAGAACUCACAGCCUUAUACCAGAUGCAGCACCUGCAGUACCAGCAGUUUUUAAUACAACAACAAUAUGCACAGGUUUUGGCCCAACAGCAGAAAGCAGCACUGUCUUCCCAGCAGCAGCAGCAGUUGGCACUUCUUCUUCAACAGUUUCAGACCUUGAAGAUGAGAAUAUCUGAUCAGAACAUCAUUCCCUCAGUAACUAGGUCUGUGUCCGUGCCAGAUACUGGCUCUAUCUGGGAGCUUCAGCCAACAGCUUCACAGCCUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-755.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -803.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 670.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((....))))).))..)))((.(((((((.(((((((.((.(((((((.(((((.(.(((.....)))).))))).)))....((((((((....))))))))......(((((((((......(((((((....((((((.(((..........))))))))).......((((.(((((....((((((.....))))))....))))).))))......(((.((((((((....(((((....(((((((.((((..(((((((..((.(((((((((((..(((((((((.........(((.(((((....)))))...)))......(((....)))...(((((.((((((((((.....))).)))))....)).)))))..((((........))))((((((.(((((......(((((((..((((.........))))..)).))))))))))((((.((....)).))))......(((...(((((((((((.....((((......))))(((((((((.(((((...(((((((..((((((((((((.(((((((((..((((((((....(((.((.....)).)))....))))))))..)))))..((((((((....).))))))).......))))...))))))))))))(((...)))......)))))))..)))))..)))))))))(((((.(.....((((....))))....).)))))........)))))))))))..))))))))))))).)))))..))..)))))).))).)))))))))..))))........(((((((......)))))))....(((((.((...(((.............)))...)).)))))....))))))).((.(.(((((...((((.....)))).))))).).)).(((((...)))))......)))))...........))))).))).)))(((((((.....((((((..(((..(((((....))))).(((.((((.(((........))))))))))..(((((((.(((......))).((((((..((((.(((((((((((((...((((.((((.(((((.(((....((((.(((((.......))))).((((((((((..(((........)))............((((...(((......(((((....))))).(((((((((...(.(((((((.(((..........((((.(((((((.((((......(((((...(((....))).))))).........)))).)).)))))...)))).((((.(((..........)))......)))).............)))..))))))).)....))))).)))).((((((....(....)....)))))).))).)))).))))))))))...)))).))))))))))))...)))).))))).))))).....((((((....((.........))..))))))(((...........)))((((((((((...((.((((......)))))).......((.(((......))).)).....((((((((.....)))))))).((((..(.((.....)).)..))))..))))))))))))).))))..)))))))))))))........)))..))))))..))))))).))))))))))))))))....(((((((((((((((....))).(((.(((.(((.((((((((((...(((...((..((.((..((((.(((.((((((((((.((((((((((.(((((...((((..((....))..))))((((((((...(((.....)))...((...((((.((((.....(((((......)))))...((((((((.(.((((......(((((....(((.(.((.(((((.((((.((((.((((.((((((((((.....)))))))))).)))).)))).)))).))))).)).)...)))......)))))....)))).).)))))))).......((((((((((....))))))))))((((((((((.(((.........))).)))))))))).))))))))...))((((..............)))).........(((((...)))))......))))))))................)))))..))))))).........)))))))..)))))).))).)))).)).))..)))))))).))))))).))).))).)))((((((......((((......((((......))))....))))......)))))).)))))))))))).....((((((.....))))))))))))..))))))))))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((((((....))))).))..)))(({({(((({{(((((((.((.(((((((.((((({(.(((.....))).}))))).))).....,((((({....})))}}|((((((......)))))}|{{{((((,,,..,,((((((,{((,,.....,..,,))))))).......{(((.(((((..,.((((((.....)))))).,..))))).)))}{{(...)))|((((((((({(,((((.,,..,((({{({((((..((((((,.,((.(((((((((.,.((((((({,{..........,{.{{{{{....}}}|{{{{{{,.{{{{,(((....))).{{((,,({,(((,(((((.....)))}),))).}},))},}|,|{.((((........))))|,||{||{((((......(((((((..(({{,{{....},))))..)).))))))))))}}..}}}},.,,|}}}|||{{...(((...(((((((((((..{{{((((......}},,{((((((((.,((((.{{(((,,.({((..(((((((((.(((((((((..((((((((....(((.((.....)).)))....))))))))..))))).{((((((({....}.)))))),,}.....}}))...))))))))))))|}}}}.)))|.....||||||}..))))),.))))))))}|||||,|.....((((....))))....}.})))}.....,,.)))))))))))..)))}}}))))))},,))))}}),..)))))).))).)))))))))..})))}}}.....(((((((......)))))))....|||||.,|}}},||........,}},,)))}}})),)))}}.,,,}}}}},..{{.{.{,{{{...({{{.....,))).,||||{|{}|((((((,.............,,..}}}}})),,,,|(((((.(((.((((((.(((,.,.((((((,,{{({,.(((((....)))))...,}}((((((((((((({{({(((((((((.(({,,(.,.{{((((..{{(((,,,((({..,{{(||,,,}},)},,..})}}..}},,)},.})}.)))....||||,|(((((.(((((({{({{...,...,.{{((,....}}}}}}}.....|||||,,{{(((((((..(((.{{,{(({{{.|,,,..}}))})))..)))))))||||{{,{......,,},.}}},}),,)))))))))}}.}}}}......}}..)),))))))))))))))},))|(((((((((.(((..(((..{(((.({{.,..,,..|,||}......}}}}.....,...............|,,,............,,,{,(((({(,,..{...,|{{,.}}}}}}...,.))))}))})},}))}))},,.))))))))))))}...))))))){(((({,..{{......|}}))))}((,,..{{{,..,.....,}}{((...........)))((((((((((,,.((.((({......}})}))}.,,...,{{(,,.,},{{|||{{{{,...((((((((.....)))))))).,,{|,.,.,|})))))).,.....}..))))))))))}}}}..)))).)))))),.,,)))...))))))))).)))))|||||||}....{{{{.....,.)))).,.(((((((((((((((....))).{((.(((.(((.((((((({{{...,.,..{((..((.((..((((.(({.{(((((((((.((((((((((.(((({...,,((,{(.....,}..))))|(((((((...(((.....)))..,(((.,((,({(.(((((..(((((......)))))..))))).}}},}...,.}}}}..(((({....,,,.{.||}||(({.{({(.((((.((((.((((((((((,....}))))))))).)))).)))).)))),))))).|}|).||}||,,....)}})}...|}}}}}},..,.,|||....,}}{(((((((({...})))))))))}((((((((((.(((.........))).)))))))))).|},,,..|||.,,((((.,..........,.))))..,.,,,,.(((((...)))))......)))))))}................)))))..))))))).........)))))))..)))))).))).)))).)).))..)}))))),.))))))).))).))),))|((((((......((((......((((......))))....))))......)))))))))))))))))))..}}}||||{{..,,.)))))}))))))..))))))))))))..))))
Back