Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0000900
Sequence Length
674 nt
GC Content
0.3650
UUCAGCUGAGGAAUUUUAAUAUUUUGGUUUUGAAAUGCUUUUGCUGGUGAGAUGCAUAUGUGAAAAACACUUUGGAGUAGGUUUGCCUCAAAAUCAUGAGAAGAUGGAAAUUACAAGGUCAGUGUGUGAAUGCAACUCCUUGGCUAAAAGGGAGGCAUAGUGAUGGUAGUGAUGAGGUAGUGUUUUAACUAAUUGCCUUUCUUCCUCUUGUUUUUCUAUUGUGUUUUUGAAAUGACAUUUCCAAAUUAUGUCUUUGAUGUCAUAUCAGCUCAUUUGUUUUCAUGACUCUGCAUUUUAAUACUCCAUAUUGUCUCUUCUCUUUUUGUUGACCUUCACAUUGGAAGAUGACACUGUUGAUAGUGAUUGCUAUCUGGGAGAACCUUUUUGGGUAAAAAGAUUACUACUGUCGCUUUUAUGAUUGCCCUUCUGUAGGAUCUUUGACUUGUGCCAUUUUCAAAUUUUGACUUUGUUUGCAGUUCUCCAUUAGCUCCUGCUGAUUAAAUUUCCCAUACUUUCUGUUUUAUUCUAUUUCUUAUAGAUUAUAGUGGGACCAGUCUCAUUAGGUUGAAUCUACAGCCUAUGUUGGUGUUAACCCAGGUCUCUUAGAGCGUUAAAAGGAUCUGAACAAAGUCUGCUCAAAUCUCCUGCUGUGAACCAGCAGAAUUUUUGAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-163.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -176.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.((((.(((((((..........))))))).)))).))))(((((((......(((.....)))...((((.....((((..((((.(((.((((((((((....((((((.((((.......((((..((((((.......))))))))))(((((((((((((((((((((((..........))))))))((((((.......((((............)))).(((((.........)))))...((.(((((...(((......)))...)))))))................(((.((((((((((.....(((.((...)))))..)))))).)))).))).((((((....)))))).))))))((((....))))......)))))))))))))))...........(((.....)))....))))))))))))))))))...)).))).))))...))))..))))((((((....))))))......((((((....(((((...............))))).....))))))...)))))))(((((((......)))))))....(((....)))((((((.(((..........)))))))))........(((.(((((....((((((.....))))))....))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((.((((.{((((((.,,....,,.))))))}.)))).))))(((((((......(({.....))}..,((((.....((((..((((.(((.{{((((((((....(((((((((((,{,....{{||..{(((((......,}})}}}}|||(((((((((((((((((((((((..........))))))))((((((...............{,{...,(((.(((((((,..........,.....)))||||}.}}||{.,,...||,...}}))}...,},.....,......{{{.((((((((({.....((,.{,...,))))..)))))).)))).}},.((((((....)))))).))))))((((....))))......)))))))))))))))...,,}....,|||...,.)))}...,)))))))))))))))))...},.))).))))...))))..))))|(((((....))))),......((((((....(((((...............))))).....))))))...)))))))(((((((......)))))))....(((....)))((((((,{((,......,,,}})))))))........(((.(((((..,.((((((.....)))))).,..))))).)))
Back