Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0002000
Sequence Length
443 nt
GC Content
0.4424
AUUAUAGUGGGACCAGUCUCAUUAGGUUGAAUCUACAGCCUAUGUUGGUGUUAACCCAGGUCUCUUAGAGCGUUAAAAGGAUCUGAACAAAGUCUGCUCAAAUCUCCUGCUGUGAACCAGCAGAAUUUUUGAACAGAGAUACUGUAGCUAAGUGCAACAAGGUGUCCUGAAUUGGAGACUGGCACAGAACAAGGAUGUUGUUGGAAAAACUGAUGAAAUCUGAAUAAACUCUGAAGUAUAGAGACUGUCUCGCUCUGUCACCCAGGCUAGAGUGCAGUGGUGCUAUCGUAACUCACUGGAGCCCUGAUCUAGGCUCAAACCAUCCUCCCACCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUAAGGUUUCUUCACAUAUAAAAAUCUAUUGUAAAAAUACGGAAAAGAAUGGCAGCGGAAACGCAGACACUGAACUUUGGGCCUGAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-123.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -131.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 79.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...((((((((.((((((..(((((((......)))))))....(((....)))((((((.(((..........))))))))).......((((.(((((....((((((.....))))))....))))).)))).....(((.((.....)).))).(((.(((......))).)))....((((....((((.(((((((.....))))))).))))........)))).......))))))))))))))..))((..(((((((((((.(((((.((((((............(((((........))))).............((((.((..(((((......))))))).)))).................(((.(((((....)))))...)))))))))(((....)))...))))).))))).))))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...((((((({,((((((..(((((((......))))))).,,.(((....)))((((((,{((,......,.,}}))))))).......((((.(((((..,.((((((.....)))))).,..))))).))))..,.{(((.((.....}}.}},.{((.(((......))).))),}}}|{{|....((((.(((((((.....))))))).)))).......,|},,.,}}...))))))))))))))..))((..(((((((((((.(((((.((({{{,,,.........(((((........)))))...{{,,..{{{,{{((.((,.,({{,.,..,.))))),,.}))),,.................|.||||,....}}}))...,}.))))}}(((....)))...))))).)))))}))))))..))
Back