Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0002200
Sequence Length
1527 nt
GC Content
0.4656
AUUAUAGUGGGACCAGUCUCAUUAGGUUGAAUCUACAGCCUAUGUUGGUGUUAACCCAGGUCUCUUAGAGCGUUAAAAGGAUCUGAACAAAGUCUGCUCAAAUCUCCUGCUGUGAACCAGCAGAAUUUUUGAACAGGUUUCUUCACAUAUAAAAAUCUAUUGUAAAAAUACGGAAAAGAAUGGCAGCGGAAACGCAGACACUGAACUUUGGGCCUGAAUGGCUCCGAGCUCUGUCCAGUGGUGGGAGUAUUACAUCCCCUCCUCUUUCUCCAGCAUUGCCGAAGUAUAAAUUAGCAGAUUAUCGUUACGGCAGAGAAGAAAUGUUAGCACUUUUCCUUAAAGACAACAAGAUACCUUCAGACCUUCUGGAUAAAGAAUUUCUGCCUAUCCUCCAGGAGGAACCCCUUCCACCAUUGGCUCUGGUACCCUUUACAGAAGAAGAACAGAGAAACUUUUCCAUGUCUGUAAAUAGUGCUGCUGUCCUGCGAUUGACAGGACGAGGAGGAGGAGGAACAGUGGUGGGGGCUCCUAGAGGUCGAAGUUCUUCAAGAGGGCGAGGCAGAGGCAGAGGUGAAUGUGGUUUCUACCAAAGAAGUUUUGAUGAAGUAGAGGGUGUUUUUGGUCGAGGAGGUGGCAGAGAAAUGCAUAGAUCGCAGAGCUGGGAGGAAAGGGGUGACAGACGUUUUGAAAAACCAGGACGAAAAGAUGUAGGAAAGAAGAAUGGAUAUUAUUGCAUGUACUCACCAGUUCUUUUGCUGGGUCAGCCUUUAUGCCAAGGGAGACCAAAUUUUGAGGAAGGUGGACCAACAUCAGUAGGGAGAAAGCAUGAAUUUAUACGCUCAGAAAGUGAAAAUUGGCGCAUCUUUAGAGAGGAACAAAAUGGAGAAGAUGAAGAUGGAGGUUGGCGACUAGCUGGAUCAAGGAGGGAUGGAGAGAGGUGGCGACCUCACAGUCCUGAUGGCCCUCGUUCUGCAGGCUGGCGGGAACACAUGGAACGACGUCGGAGGUUUGAGUUUGAUUUUCGAGAUAGAGAUGAUGAACGGGGUUACCGAAGGGUUCGCUCUGGCAGUGGGAGCAUAGAUGAUGACAGGGAUAGCUUGCCCGAAUGGUGCUUAGAGGAUGCUGAAGAAGAAAUGGGUACAUUUGACUCAUCUGGAGCAUUCCUUUCUCUAAAAAAAGUACAGAAAGAGCCUAUUCCAGAAGAGCAGGAGAUGGACUUCCGGCCUGUGGACGAAGGGGAGGAGUGCUCUGACUCUGAGGGUAGCCAUAAUGAAGAGGCCAAAGAACCCGAUAAGACAAAUAAGAAAGAAGGAGAGAAAACAGAUAGAGUAGGAGUUGAAGCUAGUGAGGAAACUCCCCAGACCUCAUCAUCAUCUGCUAGACCAGGUACUCCUUCAGACCAUCAGUCUCAGGAAGCAUCACAGUUUGAGAGGAAAGAUGAACCAAAAACUGAGCAAACGGAAAAAGCUGAAGAGGAGACUCGGAUGGAAAAUAGUCUACCAGCCAAAGUGCCCAGCAGAGGGGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-430.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -463.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 518.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....(.((((....(((((((((.((.(((((((.(((......))).......((((((.(((..........)))))))))......(((((......((((((((((.....))))..............((((((((((..........(((.(((((....)))))...)))(((((.(((....))).((((..((.(((.(((((.....))))).))).))))))(((.(((.((((((((...((((((((((((((((((((.((((.((..(((...((((((..((.((...........)).))..))))))((((..(((((...(((...(((((((((((.....((((......))))(((((((((.(((((...(((((((..((((((((((((.(((((((((..((((((((....(((.((.....)).)))....))))))))..)))))..((((((((....).))))))).......))))...))))))))))))(((...)))......)))))))..)))))..)))))))))(((((.(.....((((....))))....).)))))........)))))))))))..))))))))))))(((......))))))..)))))).)))))..))))))))).......(((((((......)))))))((((((....((..((....(((.(......).)))...))..))...))))))((((((((((((((((((((((.....((....(((((((...((((......)))).(((.(((...........))).))).))))))).)).....))))).(((((((..................)))))))...))))))))))))..))))).((.(((....(((((.....(((((....)))))...)))))..))).))((((((.(((((((((.(((..(((((.(.......(((((((((.......)))))))))........).)))..(((.....)))....((((..(((((.(((((((((((.......(.((((.....))))).......)))))....(((((((..(((.((((((....))))....)).)))..)))))))((((((.((.......)).))))))..))))))))))).))))......))..))))))))))))))))))))))))..)))))))).))))))......)))))..)))))))))).............................)))))).....)))))...))))..))).)).)))))))))....))))).....)((((.((.((((((.(....(((((((((..((((.....)))).)))).......((((((....((.........))..))))))(((...........)))...(((....)))((.((((......)))))).......)))))))))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.....{,((((....{((((((((,((.({{({{{,||||,,,,,{{{....}))(((((({{((,......,.,}})))))))......{((((.(({{{,,{,((((((.....))))))....}}}}}.,,{(((((((({..........{((.(((({....))))}...}}}{{({(.(((....))).{{{{..{{.(((.(((((.....))))).))).|||)}|(({.(((,((({{{{{.{.((((((((((((({((((((.(((((((.,(((,,,(({(({..{,.((.{{,,.,..,.,,.,...||||},((((,,(((((...(((...{((((((((((..{,,((((,.....,,,,{((((((((.,((((.,{((({,,((((..(((((((((.(((((((((..((((((((....(((.((.....)).)))....))))))))..))))}.{((((((({....}.)))))),,}.....,}))...))))))))))))|||}}.)))|,....||||||}..))))),.))))))))}|||||,|.....((((....))))....}.}}}}}.....,,.))))))))))),,)))}})))})})(((......))),}}..))}}}|,||||||||}}}}}}}|,,,.,..(((((((......)))))))....,{|,|.||..,,,|,,|{{....,,,}}.),}.,.}}}.))}}}))}}}}||||((((,{((((,,|||{||||..,}))...,||||||},,||||..,..,)}}}.|||}.||....,,...,,})},)}},|||||,..,},....}}})}.(((((((,........,....,|..,.,||))|,|)))}|||})))),||||))|||,,{|,,,}|||{|,|,..(((((....))))).,.|}|}}..,,,{||((({((((((((((((.(({,,(.,.({((((..({(((,.,((((..,{((||.,,}},)},,..}))}..)},,)),.})).)))....||||,|(((((.(((((({{({{...,...,.{{((,....}}}}}},.....|}|||,,{{(((((((..(((.{{,{(({{{.|,,,..}}))})))..)))))))||||{{,{......,,},,,}},}),,)))))))))}}.}}}}......})..)),))))))))))))))}})))}},.,}}})))}.))}})).,|...))))}..}))))))))).......||.....................}},,,.....)},}),},))})},})).)).))))))))}....))))),....){{|(.|{.((((((.,....((({((|((|,((,{,.,,.||||{||}..{{....,,{|||,.,.{,...,,},..,}..,,,)))}}}...},|.....}))},,|{{|,,,}},{|,||{......,)))})),.}}..,)))))}))))))}),))))
Back