Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0003200
Sequence Length
446 nt
GC Content
0.4529
CGUUAAAAGGAUCUGAACAAAGUCUGCUCAAAUCUCCUGCUGUGAACCAGCAGAAUUUUUGAACAGAGACCACGUCUCCACCUCCUGGGCUCCAACGAUUCUCCCAUCUUGGCCUCCCAAAGCGCUGGAUUUACAGGUUUCUUCACAUAUAAAAAUCUAUUGUAAAAAUACGGAAAAGAAUGGCAGCGGAAACGCAGACACUGAACUUUGGGCCUGAAUGGCUCCGAGCUCUGUCCAGUGGUGGGAGUAUUACAUCCCCUCCUCUUUCUCCAGCAUUGCCGAAGUAUAAAUUAGCAGAUUAUCGUUACGGCAGAGAAGAAAUGUUAGCACUUUUCCUUAAAGACAACAAGAUACCUUCAGACCUUCUGGAUAAAGAAUUUCUGCCUAUCCUCCAGGAGGAACCCCUUCCACCAUUGGCUCUGGUACCCUUUACAGAAGAAGAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-104.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -114.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 114.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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